微信公众号【原子与分子模拟】： 熔化温度 + 超导电性 + 电子化合物 + 分子动力学模拟 + 第一性原理计算 + 数据处理程序

往期内容主要涵盖： 熔化温度 + 超导电性 + 电子化合物 + 分子动力学模拟 + 第一性原理计算 + 数据处理程序

【1】熔化温度 + 分子动力学 + LAMMPS 相关内容

1. 【文献分享】分子动力学模拟 + LAMMPS + 熔化温度 + 晶体缺陷 + 熔化方法

2. LAMMPS 文献：金属熔化行为的局域原子结构模拟与分析

3. LAMMPS 文献：9 种熔化温度模拟方法的总结与比较（三）：两相方法、单相方法以及缺陷方法

4. LAMMPS 文献：使用两相法计算熔化温度的软件（二）

5. LAMMPS 文献：使用两相法自动计算熔化温度的软件（一）

6. 【文献分享】Journal of Materials Science：合金 + 固态烧结 + 熔化温度 + 分子动力学模拟

7. 【文献分享】CMS : OVITO + LAMMPS + 结构识别 + 共同邻域 + 配位多面体

8. 【文献分享】JPCC : 原子模拟中晶体结构表征的累积方法

9. 【文献分享】JPCC：结合蒙特卡罗和分子动力学模拟研究 Au-Pd 纳米颗粒的稳定性和相变

10. 【文献分享】CMS：表面熔化 + 熔化机制 + 液体核 + 分子动力学

【2】机器学习 + 第一性原理计算 + 分子动力学相关内容

1. 【文献分享】机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理 + 微观结构 + 热力学性质（密度、热容、热导率和粘度）

2. 【文献分享】机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理 + 热力学性质 + 微观结构

3. 【文献分享】机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理计算 + P-T 相图

4. 【文献分享】机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理计算 + 热力学性质（熔化温度 & 热导率 & 热膨胀系数）

5. 【文献分享】Journal of Physical Chemistry C ：通过更好的实践提高机器学习原子间势的质量和可靠性

6. 【文献分享】PCCP：机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理 + 热学性质 + 微观结构

7. 【文献分享】机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理 + 电导率 + 微观结构

8. 【文献分享】机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理 + 输运性质 + 微观结构

9. 【文献分享】Journal of Molecular Structure：机器学习 + 第一性原理 + 体系能量 + 带隙预测

10. 【文献分享】JPCL：机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理 + 液态水

11. 【文献分享】ACS Materials Letters ：固体电解质 + 机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理

12. Journal of Materials Chemistry A：固态离子导体 + 机器学习 + 分子动力学 + 第一性原理

13. 【文献分享】Journal of Chemical Physics：固态氢的高压结构—从头算分子动力学模拟的见解

14. 【文献分享】CMS：机器学习原子间势的验证流程 — 初步验证 + 静态性质+ 动态性质

15. 【文献分享】CMS：金属钪 + 原子结构 + 熔化温度 + 深度学习 + 分子动力学模拟

16. 【文献分享】CMS：SiC神经网络势的构建及其在单轴拉伸模拟中的应用

17. 【文献分享】PRB：高压锂铅化合物 + 超导电性 + 塑性态 + 超离子态 + 机器学习

【3】第一性原理计算 + 数据处理程序

1. SMATool 程序：VASP + QE + 零温 + 有限温度 + 拉伸、剪切、双轴、维氏硬度的计算

2. ElasTool v3.0 程序：材料弹性和机械性能的高效计算和可视化工具包

3. VELAS 程序：用于弹性各向异性可视化和分析

4. Phasego 程序：用于自动计算和绘制相图

5. 可视化软件 GDIS 软件：第一原理计算/VASP + 结构预测/USPEX

6. VASPMATE：集成用户界面程序 + 高通量计算

7. TRACK：使用 Kubo 计算相关电子系统传输特性的 Python 代码

8. 弹性各向异性后处理软件 ElASTool（四）：可以计算弹性常数随温度的变化关系

9. 弹性各向异性后处理软件（三）

10. 弹性各向异性后处理软件 ElATools（二）

11. GULP 案例 3 代码解释：计算弹性常数以及弹性模量二维/三维投影图的绘制

12. 【程序分享】MD2D 程序：用于从分子动力学模拟中准确测定扩散系数的 python 模块

13. 【程序分享】SPaMD studio 程序：（VASP + LAMMPS） 原子建模、模拟、分析和可视化的集成平台

14. 【程序分享】ElasT 程序：用于热弹性计算的工具包

15. 【程序分享】CrySPY 程序：机器学习加速的晶体结构预测工具

16. 【程序分享】GUI4dft 程序 —面向 SIESTA 的 GUI

17. 【程序分享】Elastemp 程序：弹性常数 + 有限温度 + 准谐近似 + 热力学性质

【4】文献速递 + 超导电性 + 电子化合物

1. 【文献分享】PHYSICAL REVIEW B ：超导 + 间隙电子 + 拓扑结构 + 电子化合物超导体

2. 【文献分享】Materials Today Physics：富氢化合物 + 超导电性 + 第一性原理 + 分子动力学

3. 【文献分享】PHYSICAL REVIEW B：富氢化合物 + 超导电性 + 超离子态 + 高超导转变温度

4. 【文献分享】Inorganic Chemistry：氢化物 + 超导电性 + 亚稳态 + 结构预测

5. 【文献分享】Physical Review B ：超导电性 + 电子化合物 + 电子跃迁 + 间隙准原子

6. 【文献分享】MTP：Superconductivity induced by ionized σ-bond at 10 GPa

7. 【文献分享】Physical Review B ：常压下硼-碳笼形物的高温超导

8. 【文献分享】Acta Materialia：金属硼化物 + 新型超硬材料 + 超导电性 + 原子替换

9. 【文献分享】Results in Physics：中压下电子化合物 Be6C 的成键性质和超导电性

10. 【文献分享】PRB ：高压三元Sr-Hf/Zr-H体系中的高温超导研究

11. 【文献分享】PRB：超导电性 70K + MB2C8 (M=Na, K, Rb, Cs)

12. 【文献分享】PRB：高压锂铅化合物 + 超导电性 + 塑性态 + 超离子态 + 机器学习

【5】分子动力学模拟 + 数据处理程序

1. viewSq 程序 ：可视化分子动力学（VMD）模块 +  分析 X 射线和中子结构因子

2. freud 程序: 用于原子模拟数据的高通量分析

3. HBCalculator 程序：通过 VMD 可计算分子动力学模拟中氢键密度和强度的一维和二维分布

4. DensityCalculator 程序（1D & 2D）：通过 VMD 可计算 LAMMPS 轨迹的密度（一）

5. 分子动力学模拟—LAMMPS 模拟（固体和液体）数据后处理软件（六）: mdapy

6. 分子动力学模拟—LAMMPS 液体模拟数据后处理软件（五）: LiquidLib

7. 分子动力学模拟—LAMMPS 数据后处理软件（四）: Lindemann Index

8. H-A键对分析程序strfac  ：分子动力学模拟—LAMMPS 数据后处理软件（三）

9. 分子动力学模拟—LAMMPS 数据后处理软件（二）

10. 分子动力学模拟—LAMMPS 数据后处理软件

11. LAMMPS 文献：使用两相法计算熔化温度的软件（二）

12. LAMMPS 文献：使用两相法自动计算熔化温度的软件（一）

13. 键序参数分析程序——Bond Order Parameters

14. 一个用于分析轨迹文件（LAMMPS）的VMD插件：可分析数密度、质量、电荷和电子分布

15. 晶体结构轨迹（VASP、LAMMPS）分析后处理程序 ISAACS

16. 安装教程：结构轨迹后处理程序ISAACS

17. TPMD 程序：利用分子动力学轨迹研究速率过程并进行温度编程分子动力学计算的工具包

18. 【程序分享】bop 程序 ：分子动力学模拟中进行键序参数分析—Bond Order Parameters（一）

19. 【程序分享】bopcalc 程序：一种评估分子动力学模拟中键序参数的高效方法（二）

20. 【程序分享】AACSD 程序: 用于晶体结构和缺陷的原子分析平台

21. 【程序分享】AADIS 程序：位错特征和分布的原子分析平台

22. 【程序分享】SPaMD studio 程序：（VASP + LAMMPS） 原子建模、模拟、分析和可视化的集成平台

23. 【程序分享】CMS：图神经网络 + 形状记忆合金 + 马氏体变体 + 识别方法

24. 【程序分享】分子动力学 + 原子模拟 + LAMMPS + 结构识别方法

25. 【程序分享】ERSN-OpenMC-Py 程序：基于 python 的 OpenMC Monte Carlo 开源代码

26. 【程序分享】LaSCA 程序：分子动力学模拟中复杂系统微观结构的可视化分析工具

27. 【程序分享】kMCpy 程序：一个使用动力学蒙特卡罗模拟固体输运性质的 python 包

28. 【程序分享】Pytim 程序：用于分子模拟界面分析的 python 包

29. 【程序分享】dynasor 程序：一种从分子动力学模拟中提取动力学结构因子和电流相关函数的工具

30. 【程序分享】LiquidDiffract 程序 : 液体全散射分析软件

31. 【程序分享】MolTwister 程序：分子系统构建、操作和统计力学计算工具

32. 【程序分享】分子动力学模拟中晶体材料中自填隙原子和空位的识别

【6】VMD + 数据处理程序

1. viewSq 程序 ：可视化分子动力学（VMD）模块 +  分析 X 射线和中子结构因子

2. HBCalculator 程序：通过 VMD 可计算分子动力学模拟中氢键密度和强度的一维和二      维分布

3. DensityCalculator 程序（1D & 2D）：通过 VMD 可计算 LAMMPS 轨迹的密度       （一）

4. 一个用于分析轨迹文件（LAMMPS）的VMD插件：可分析数密度、质量、电荷和电子分布

【7】分子动力学模拟 + LAMMPS 输入文件

1. 关于一篇带有 LAMMPS 输入文件的文章（三）

2. 关于一篇带有 LAMMPS 输入文件的文章（二）

3. 关于一篇带有 LAMMPS 输入文件的文章

4. 表面能的计算 & lammps输入脚本 (二)

5. 表面能的计算 & lammps输入脚本(一)

6. 表面能的计算 & lammps输入脚本

【8】晶格动力学 + GULP 软件

1. 一个与 GULP 相关的软件《ParamGULP》

2. 势函数的拟合方式有哪些？GULP 软件可以做什么？

3. GULP 案例 4：如何计算热力学性质（热容、熵、焓、自由能等）？

4. GULP 案例 3：如何计算弹性常数？

5. GULP 案例 2：如何计算相变压力？

6. GULP 案例 1：如何计算声子色散曲线和态密度？

7. 晶格动力学 GULP 软件的安装步骤

8. GULP 案例 3 代码解释：计算弹性常数以及弹性模量二维/三维投影图的绘制

9. GULP案例 2 代码解释：计算相变压力

10. GULP案例1代码解释：声子色散曲线和态密度的计算

11. 晶格动力学程序 GULP

【9】其他杂类内容

1. 利用 Vesta 软件绘制团簇构型 ICO多面体（二）

2. 利用 OVITO 软件绘制团簇构型 (ICO, BCC, HCP, FCC及SC 多面体)

3. 这个网址可以检索某位作者发表的所有文章

4. 英语润色：DeepL Write 人工智能写作助手

5. Origin中将 x、y 轴设置为等长度

6. Ovito 技巧：筛选体系中特定种类的原子

7. 号称全世界最准确的翻译工具：DeepL

8. 分享几个查找势函数的网站以及查找晶格常数的网站/软件

9. 七大晶系的力学稳定性判据（很全面）

10. 如何提取文献中的“曲线”数据？

11. 怎么做到文献检索的“全”与“准”？

12. 怎么做到文献检索的“全”与“准”？

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