首页 > 其他分享 >GATK不能多线程的问题

GATK不能多线程的问题

时间:2024-06-12 20:56:45浏览次数:20  
标签:13 17 IntelPairHmm threads GATK 不能 多线程

问题:申请了多线程但是只能单线程

 

17:13:48.941 INFO  IntelPairHmm - Available threads: 1
17:13:48.941 INFO  IntelPairHmm - Requested threads: 4
17:13:48.941 WARN  IntelPairHmm - Using 1 available threads, but 4 were requested

  

 解决方法:

export OMP_NUM_THREADS=4

 

参考网页:

java - GATK: HaplotypceCaller IntelPairHmm only detecting 1 thread - Stack Overflow

 

标签:13,17,IntelPairHmm,threads,GATK,不能,多线程
From: https://www.cnblogs.com/cmjj/p/18244681

相关文章

  • 【C++】多线程(基于Windows以及pthread库)
    文章目录一、前言1.1进程和线程二、创建线程2.1线程函数pthread_self(void)2.2创建线程三、线程退出3.1线程函数pthread_exit()四、线程回收4.1线程函数pthread_join()4.2线程数据回收五、线程分离5.1线程函数pthread_detach()六、C++线程类七、线程同......
  • python指南之多线程与多进程编程大全
    Python作为一种高级编程语言,提供了多种并发编程的方式,其中多线程与多进程是最常见的两种方式之一。在本文中,我们将探讨Python中多线程与多进程的概念、区别以及如何使用线程池与进程池来提高并发执行效率。多线程与多进程的概念多线程多线程是指在同一进程内,多个线程并发执......
  • Interlocked 为多个线程共享的变量提供原子操作 多线程重入
    Interlocked可以为多个线程共享的变量提供原子操作主要使用的读写方法varrunningState=Interlocked.Read(refisRunning);Interlocked.Exchange(refisRunning,0);可以配合lock实现业务常用方法Add(Int32,Int32) 对两个32位整数进行求和并用和替换第一个整数,上述操......
  • 一文带你搞清楚Python的多线程和多进程
    本文分享自华为云社区《Python中的多线程与多进程编程大全【python指南】》,作者:柠檬味拥抱。Python作为一种高级编程语言,提供了多种并发编程的方式,其中多线程与多进程是最常见的两种方式之一。在本文中,我们将探讨Python中多线程与多进程的概念、区别以及如何使用线程池与进程池来......
  • Java多线程CompletableFuture使用
    引言一个接口可能需要调用N个其他服务的接口,这在项目开发中非常常见。如果是串行执行的话,接口的响应速度会很慢。考虑到这些接口之间有大部分都是无前后顺序关联的,可以并行执行。就比如说调用获取商品详情的时候,可以同时调用获取物流信息,通过并行执行多个任务的方式,接口的......
  • 多线程实现并发
    多线程并发服务器架构void*thread_fun(void*arg){ while(1){ recv()/send() } }scokfd=socket()bind()listen()while(1){ accept() //连上就创建线程 pthread_create(,,thread_fun,) pthread_detach()}案例/*#Multi-processconcurren......
  • C#实现多线程的几种方式(附完整源码)
    C#实现多线程的几种方式1.使用Thread类:2.使用ThreadPool类:3.使用Task类:以下是C#中实现多线程的几种常见方式的示例代码:1.使用Thread类:usingSystem;usingSystem.Threading;​classProgram{staticvoidMain(){Threadth......
  • Java多线程(一):多线程基础
    多线程技术概述线程与进程进程:一个内存中运行的应用程序每个进程有一个独立的内存空间线程进程中的一个执行路径·共享一个内存空间·线程间自由切换,并发执行·一个进程至少有一个线程·线程实际上是在进程基础之上的进一步划分,一个进程启动之后,里面的若干......
  • 写一个多线程控制工人接活和工作的例子(使用synchronized wait notifyAll)
    packageorg.example;publicclassStudyWaitAndNotify{publicstaticvoidmain(String[]args){WorkManNeedToDoa=newWorkMan();Leaderl1=newLeader(a,25);Leaderl2=newLeader(a,20);Testert1=newTester(a......
  • Android 11.0 mtk浏览器Browser下载应用不能安装问题的解决办法
    1.前言 在系统11.0的ROM定制化开发中,在开发mtk平台的时候,在系统默认浏览器Browser中发现在下载某些app的时候,结果显示的确实在下载到内部存储的时候,点击安装的时候安装失败,所以就需要从Browser的下载流程中出发分析相关源码来实现具体的功能2.mtk浏览器Browser下载应用不能......