如何操作文本数据
原文:
pandas.pydata.org/docs/getting_started/intro_tutorials/10_text_data.html
-
将所有名称字符改为小写。
In [4]: titanic["Name"].str.lower() Out[4]: 0 braund, mr. owen harris 1 cumings, mrs. john bradley (florence briggs th... 2 heikkinen, miss. laina 3 futrelle, mrs. jacques heath (lily may peel) 4 allen, mr. william henry ... 886 montvila, rev. juozas 887 graham, miss. margaret edith 888 johnston, miss. catherine helen "carrie" 889 behr, mr. karl howell 890 dooley, mr. patrick Name: Name, Length: 891, dtype: object
要使
Name
列中的每个字符串都变为小写,选择Name
列(参见数据选择教程),添加str
访问器并应用lower
方法。因此,每个字符串都被逐个转换。
与时间序列教程中具有dt
访问器的日期时间对象类似,在使用str
访问器时可以使用许多专门的字符串方法。这些方法通常与单个元素的内置字符串方法具有匹配的名称,但是在每个值的列上逐个应用(记得逐元素计算吗?)。
-
创建一个新列
Surname
,其中包含乘客的姓氏,通过提取逗号前的部分。In [5]: titanic["Name"].str.split(",") Out[5]: 0 [Braund, Mr. Owen Harris] 1 [Cumings, Mrs. John Bradley (Florence Briggs ... 2 [Heikkinen, Miss. Laina] 3 [Futrelle, Mrs. Jacques Heath (Lily May Peel)] 4 [Allen, Mr. William Henry] ... 886 [Montvila, Rev. Juozas] 887 [Graham, Miss. Margaret Edith] 888 [Johnston, Miss. Catherine Helen "Carrie"] 889 [Behr, Mr. Karl Howell] 890 [Dooley, Mr. Patrick] Name: Name, Length: 891, dtype: object
使用
Series.str.split()
方法,每个值都返回一个包含 2 个元素的列表。第一个元素是逗号前的部分,第二个元素是逗号后的部分。In [6]: titanic["Surname"] = titanic["Name"].str.split(",").str.get(0) In [7]: titanic["Surname"] Out[7]: 0 Braund 1 Cumings 2 Heikkinen 3 Futrelle 4 Allen ... 886 Montvila 887 Graham 888 Johnston 889 Behr 890 Dooley Name: Surname, Length: 891, dtype: object
由于我们只对代表姓氏的第一部分感兴趣(元素 0),我们可以再次使用
str
访问器,并应用Series.str.get()
来提取相关部分。事实上,这些字符串函数可以连接起来组合多个函数!
到用户指南
有关提取字符串部分的更多信息,请参阅用户指南中关于拆分和替换字符串的部分。
-
提取关于泰坦尼克号上女伯爵的乘客数据。
In [8]: titanic["Name"].str.contains("Countess") Out[8]: 0 False 1 False 2 False 3 False 4 False ... 886 False 887 False 888 False 889 False 890 False Name: Name, Length: 891, dtype: bool
In [9]: titanic[titanic["Name"].str.contains("Countess")] Out[9]: PassengerId Survived Pclass ... Cabin Embarked Surname 759 760 1 1 ... B77 S Rothes [1 rows x 13 columns]
(对她的故事感兴趣吗?请参阅 维基百科!)
字符串方法
Series.str.contains()
检查列Name
中的每个值是否包含单词Countess
,并对每个值返回True
(Countess
是名称的一部分)或False
(Countess
不是名称的一部分)。此输出可用于使用在数据子集教程中介绍的条件(布尔)索引来对数据进行子选择。由于泰坦尼克号上只有一位女伯爵,我们得到一行作为结果。
注意
字符串的更强大的提取操作是支持的,因为Series.str.contains()
和 Series.str.extract()
方法接受正则表达式,但不在本教程的范围内。
到用户指南
更多有关提取字符串部分的信息,请参阅用户指南中有关字符串匹配和提取的部分。
-
泰坦尼克号的乘客中,哪位乘客的名字最长?
In [10]: titanic["Name"].str.len() Out[10]: 0 23 1 51 2 22 3 44 4 24 .. 886 21 887 28 888 40 889 21 890 19 Name: Name, Length: 891, dtype: int64
要获得最长的名称,我们首先必须获取
Name
列中每个名称的长度。通过使用 pandas 字符串方法,对每个名称单独应用Series.str.len()
函数(逐元素)。In [11]: titanic["Name"].str.len().idxmax() Out[11]: 307
接下来,我们需要获取对应位置,最好是表格中名字长度最大的索引标签。
idxmax()
方法正是这样做的。它不是字符串方法,适用于整数,因此不使用str
。In [12]: titanic.loc[titanic["Name"].str.len().idxmax(), "Name"] Out[12]: 'Penasco y Castellana, Mrs. Victor de Satode (Maria Josefa Perez de Soto y Vallejo)'
基于行的索引名称(
307
)和列的名称(Name
),我们可以使用loc
运算符进行选择,该运算符在子集切片教程中介绍过。 -
在“性别”列中,将“male”的值替换为“M”,将“female”的值替换为“F”。
In [13]: titanic["Sex_short"] = titanic["Sex"].replace({"male": "M", "female": "F"}) In [14]: titanic["Sex_short"] Out[14]: 0 M 1 F 2 F 3 F 4 M .. 886 M 887 F 888 F 889 M 890 M Name: Sex_short, Length: 891, dtype: object
而
replace()
不是一个字符串方法,它提供了一种方便的方式来使用映射或词汇表来转换某些值。它需要一个dictionary
来定义映射{from : to}
。
警告
还有一个可用的replace()
方法,可以替换特定的字符集。但是,当有多个值的映射时,这将变得:
titanic["Sex_short"] = titanic["Sex"].str.replace("female", "F")
titanic["Sex_short"] = titanic["Sex_short"].str.replace("male", "M")
这将变得繁琐,并且很容易出错。想想(或者试试)如果这两个语句以相反的顺序应用会发生什么…
记住
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可以使用
str
访问器使用字符串方法。 -
字符串方法是逐元素进行的,可以用于条件索引。
-
replace
方法是根据给定字典转换值的便捷方法。
到用户指南
用户指南页面提供了处理文本数据的全面概述。
与其他工具的比较
原文:
pandas.pydata.org/docs/getting_started/comparison/index.html
-
与 R / R 库的比较
-
快速参考
-
基本 R
-
plyr
-
reshape / reshape2
-
-
与 SQL 的比较
-
复制 vs. 原地操作
-
选择
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WHERE
-
GROUP BY
-
连接
-
UNION
-
限制
-
pandas 对一些 SQL 分析和聚合函数的等效操作
-
更新
-
删除
-
-
与电子表格的比较
-
数据结构
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数据输入/输出
-
数据操作
-
字符串处理
-
合并
-
其他考虑因素
-
-
与 SAS 的比较
-
数据结构
-
数据输入/输出
-
数据操作
-
字符串处理
-
合并
-
缺失数据
-
GroupBy
-
其他考虑因素
-
-
与 Stata 的比较
-
数据结构
-
数据输入/输出
-
数据操作
-
字符串处理
-
合并
-
缺失数据
-
GroupBy
-
其他考虑因素
-
与 R/R 库的比较
译文:
pandas.pydata.org/docs/getting_started/comparison/comparison_with_r.html
由于 pandas 旨在提供许多人们使用R的数据操作和分析功能,因此本页面旨在更详细地查看R 语言及其许多第三方库与 pandas 的关系。在与 R 和 CRAN 库的比较中,我们关心以下几点:
-
功能性/灵活性:每个工具可以/不可以做什么
-
性能:操作有多快。最好提供硬性数据/基准
-
易用性:一个工具更容易/更难使用(您可能需要通过并排代码比较来判断)
本页面还提供了一个为这些 R 包的用户提供一点翻译指南的页面。
快速参考
我们将从一个快速参考指南开始,将一些常见的 R 操作(使用dplyr)与 pandas 的等效操作进行配对。
查询、过滤、抽样
R | pandas |
---|---|
dim(df) |
df.shape |
head(df) |
df.head() |
slice(df, 1:10) |
df.iloc[:9] |
filter(df, col1 == 1, col2 == 1) |
df.query('col1 == 1 & col2 == 1') |
df[df$col1 == 1 & df$col2 == 1,] |
df[(df.col1 == 1) & (df.col2 == 1)] |
select(df, col1, col2) |
df[['col1', 'col2']] |
select(df, col1:col3) |
df.loc[:, 'col1':'col3'] |
select(df, -(col1:col3)) |
df.drop(cols_to_drop, axis=1) 但请参见[1] |
distinct(select(df, col1)) |
df[['col1']].drop_duplicates() |
distinct(select(df, col1, col2)) |
df[['col1', 'col2']].drop_duplicates() |
sample_n(df, 10) |
df.sample(n=10) |
sample_frac(df, 0.01) |
df.sample(frac=0.01) |
排序
R | pandas |
---|---|
arrange(df, col1, col2) |
df.sort_values(['col1', 'col2']) |
arrange(df, desc(col1)) |
df.sort_values('col1', ascending=False) |
转换
R | pandas |
---|---|
select(df, col_one = col1) |
df.rename(columns={'col1': 'col_one'})['col_one'] |
rename(df, col_one = col1) |
df.rename(columns={'col1': 'col_one'}) |
mutate(df, c=a-b) |
df.assign(c=df['a']-df['b']) |
分组和汇总
R | pandas |
---|---|
summary(df) |
df.describe() |
gdf <- group_by(df, col1) |
gdf = df.groupby('col1') |
summarise(gdf, avg=mean(col1, na.rm=TRUE)) |
df.groupby('col1').agg({'col1': 'mean'}) |
summarise(gdf, total=sum(col1)) |
df.groupby('col1').sum() |
基础 R
使用 R 的c
进行切片
R 使得通过名称轻松访问 data.frame
列成为可能
df <- data.frame(a=rnorm(5), b=rnorm(5), c=rnorm(5), d=rnorm(5), e=rnorm(5))
df[, c("a", "c", "e")]
或按整数位置
df <- data.frame(matrix(rnorm(1000), ncol=100))
df[, c(1:10, 25:30, 40, 50:100)]
在 pandas 中按名称选择多列很简单
In [1]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 3), columns=list("abc"))
In [2]: df[["a", "c"]]
Out[2]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
In [3]: df.loc[:, ["a", "c"]]
Out[3]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
通过整数位置选择多个不连续列可以通过iloc
索引器属性和numpy.r_
的组合实现。
In [4]: named = list("abcdefg")
In [5]: n = 30
In [6]: columns = named + np.arange(len(named), n).tolist()
In [7]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(n, n), columns=columns)
In [8]: df.iloc[:, np.r_[:10, 24:30]]
Out[8]:
a b c ... 27 28 29
0 -1.344312 0.844885 1.075770 ... 0.813850 0.132003 -0.827317
1 -0.076467 -1.187678 1.130127 ... 0.149748 -0.732339 0.687738
2 0.176444 0.403310 -0.154951 ... -0.493662 0.600178 0.274230
3 0.132885 -0.023688 2.410179 ... 0.109121 1.126203 -0.977349
4 1.474071 -0.064034 -1.282782 ... -0.858447 0.306996 -0.028665
.. ... ... ... ... ... ... ...
25 1.492125 -0.068190 0.681456 ... 0.428572 0.880609 0.487645
26 0.725238 0.624607 -0.141185 ... 1.008500 1.424017 0.717110
27 1.262419 1.950057 0.301038 ... 1.007824 2.826008 1.458383
28 -1.585746 -0.899734 0.921494 ... 0.577223 -1.088417 0.326687
29 -0.986248 0.169729 -1.158091 ... -2.013086 -1.602549 0.333109
[30 rows x 16 columns]
aggregate
在 R 中,您可能希望将数据拆分为子集并为每个子集计算平均值。使用名为df
的数据框,并将其拆分为by1
和by2
组:
df <- data.frame(
v1 = c(1,3,5,7,8,3,5,NA,4,5,7,9),
v2 = c(11,33,55,77,88,33,55,NA,44,55,77,99),
by1 = c("red", "blue", 1, 2, NA, "big", 1, 2, "red", 1, NA, 12),
by2 = c("wet", "dry", 99, 95, NA, "damp", 95, 99, "red", 99, NA, NA))
aggregate(x=df[, c("v1", "v2")], by=list(mydf2$by1, mydf2$by2), FUN = mean)
groupby()
方法类似于基本的 R aggregate
函数。
In [9]: df = pd.DataFrame(
...: {
...: "v1": [1, 3, 5, 7, 8, 3, 5, np.nan, 4, 5, 7, 9],
...: "v2": [11, 33, 55, 77, 88, 33, 55, np.nan, 44, 55, 77, 99],
...: "by1": ["red", "blue", 1, 2, np.nan, "big", 1, 2, "red", 1, np.nan, 12],
...: "by2": [
...: "wet",
...: "dry",
...: 99,
...: 95,
...: np.nan,
...: "damp",
...: 95,
...: 99,
...: "red",
...: 99,
...: np.nan,
...: np.nan,
...: ],
...: }
...: )
...:
In [10]: g = df.groupby(["by1", "by2"])
In [11]: g[["v1", "v2"]].mean()
Out[11]:
v1 v2
by1 by2
1 95 5.0 55.0
99 5.0 55.0
2 95 7.0 77.0
99 NaN NaN
big damp 3.0 33.0
blue dry 3.0 33.0
red red 4.0 44.0
wet 1.0 11.0
有关更多详细信息和示例,请参阅分组文档。
match
/ %in%
在 R 中选择数据的常见方法是使用%in%
,该运算符使用函数match
定义。运算符%in%
用于返回指示是否存在匹配项的逻辑向量:
s <- 0:4
s %in% c(2,4)
isin()
方法类似于 R 的%in%
运算符:
In [12]: s = pd.Series(np.arange(5), dtype=np.float32)
In [13]: s.isin([2, 4])
Out[13]:
0 False
1 False
2 True
3 False
4 True
dtype: bool
match
函数返回其第一个参数在第二个参数中匹配位置的向量:
s <- 0:4
match(s, c(2,4))
有关更多详细信息和示例,请参阅重塑文档。
tapply
tapply
类似于aggregate
,但数据可以是不规则的数组,因为子类大小可能不规则。使用名为baseball
的数据框,并根据数组team
检索信息:
baseball <-
data.frame(team = gl(5, 5,
labels = paste("Team", LETTERS[1:5])),
player = sample(letters, 25),
batting.average = runif(25, .200, .400))
tapply(baseball$batting.average, baseball.example$team,
max)
在 pandas 中,我们可以使用pivot_table()
方法来处理这个问题:
In [14]: import random
In [15]: import string
In [16]: baseball = pd.DataFrame(
....: {
....: "team": ["team %d" % (x + 1) for x in range(5)] * 5,
....: "player": random.sample(list(string.ascii_lowercase), 25),
....: "batting avg": np.random.uniform(0.200, 0.400, 25),
....: }
....: )
....:
In [17]: baseball.pivot_table(values="batting avg", columns="team", aggfunc="max")
Out[17]:
team team 1 team 2 team 3 team 4 team 5
batting avg 0.352134 0.295327 0.397191 0.394457 0.396194
有关更多详细信息和示例,请参阅重塑文档。
subset
query()
方法类似于基本的 R subset
函数。在 R 中,您可能希望获取data.frame
的行,其中一列的值小于另一列的值:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
subset(df, a <= b)
df[df$a <= df$b,] # note the comma
在 pandas 中,有几种方法可以执行子集。您可以使用query()
或将表达式传递为索引/切片,以及标准布尔索引:
In [18]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [19]: df.query("a <= b")
Out[19]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [20]: df[df["a"] <= df["b"]]
Out[20]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [21]: df.loc[df["a"] <= df["b"]]
Out[21]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
有关更多详细信息和示例,请参阅查询文档。
with
在 R 中使用名为df
的数据框,其中包含a
和b
列的表达式将使用with
进行评估:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
with(df, a + b)
df$a + df$b # same as the previous expression
在 pandas 中,使用eval()
方法的等效表达式将是:
In [22]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [23]: df.eval("a + b")
Out[23]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
In [24]: df["a"] + df["b"] # same as the previous expression
Out[24]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
在某些情况下,eval()
比纯 Python 中的评估要快得多。更多详细信息和示例请参见 eval 文档。
plyr
plyr
是一个用于数据分析的 R 库,围绕着 R 中的三种数据结构 a
(数组)、l
(列表)和 d
(数据框)展开。下表显示了这些数据结构在 Python 中的映射方式。
R | Python |
---|---|
数组 | 列表 |
列表 | 字典或对象列表 |
data.frame | 数据框 |
ddply
在 R 中使用名为 df
的 data.frame 来按 month
汇总 x
的表达式:
require(plyr)
df <- data.frame(
x = runif(120, 1, 168),
y = runif(120, 7, 334),
z = runif(120, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7,8),30),
week = sample(1:4, 120, TRUE)
)
ddply(df, .(month, week), summarize,
mean = round(mean(x), 2),
sd = round(sd(x), 2))
在 pandas 中,等效的表达式,使用 groupby()
方法,将是:
In [25]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 120),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 120),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 120),
....: "month": [5, 6, 7, 8] * 30,
....: "week": np.random.randint(1, 4, 120),
....: }
....: )
....:
In [26]: grouped = df.groupby(["month", "week"])
In [27]: grouped["x"].agg(["mean", "std"])
Out[27]:
mean std
month week
5 1 63.653367 40.601965
2 78.126605 53.342400
3 92.091886 57.630110
6 1 81.747070 54.339218
2 70.971205 54.687287
3 100.968344 54.010081
7 1 61.576332 38.844274
2 61.733510 48.209013
3 71.688795 37.595638
8 1 62.741922 34.618153
2 91.774627 49.790202
3 73.936856 60.773900
更多详细信息和示例请参见 分组文档。
reshape / reshape2
meltarray
在 R 中使用名为 a
的 3 维数组来将其融合成一个 data.frame 的表达式:
a <- array(c(1:23, NA), c(2,3,4))
data.frame(melt(a))
在 Python 中,由于 a
是一个列表,你可以简单地使用列表推导式。
In [28]: a = np.array(list(range(1, 24)) + [np.NAN]).reshape(2, 3, 4)
In [29]: pd.DataFrame([tuple(list(x) + [val]) for x, val in np.ndenumerate(a)])
Out[29]:
0 1 2 3
0 0 0 0 1.0
1 0 0 1 2.0
2 0 0 2 3.0
3 0 0 3 4.0
4 0 1 0 5.0
.. .. .. .. ...
19 1 1 3 20.0
20 1 2 0 21.0
21 1 2 1 22.0
22 1 2 2 23.0
23 1 2 3 NaN
[24 rows x 4 columns]
meltlist
在 R 中使用名为 a
的列表来将其融合成一个 data.frame 的表达式:
a <- as.list(c(1:4, NA))
data.frame(melt(a))
在 Python 中,这个列表将是一个元组的列表,因此 DataFrame()
方法将其转换为所需的数据框。
In [30]: a = list(enumerate(list(range(1, 5)) + [np.NAN]))
In [31]: pd.DataFrame(a)
Out[31]:
0 1
0 0 1.0
1 1 2.0
2 2 3.0
3 3 4.0
4 4 NaN
更多详细信息和示例请参见 数据结构入门文档。
meltdf
在 R 中使用名为 cheese
的 data.frame 来重新塑造数据框的表达式:
cheese <- data.frame(
first = c('John', 'Mary'),
last = c('Doe', 'Bo'),
height = c(5.5, 6.0),
weight = c(130, 150)
)
melt(cheese, id=c("first", "last"))
在 Python 中,melt()
方法是 R 中的等效方法:
In [32]: cheese = pd.DataFrame(
....: {
....: "first": ["John", "Mary"],
....: "last": ["Doe", "Bo"],
....: "height": [5.5, 6.0],
....: "weight": [130, 150],
....: }
....: )
....:
In [33]: pd.melt(cheese, id_vars=["first", "last"])
Out[33]:
first last variable value
0 John Doe height 5.5
1 Mary Bo height 6.0
2 John Doe weight 130.0
3 Mary Bo weight 150.0
In [34]: cheese.set_index(["first", "last"]).stack(future_stack=True) # alternative way
Out[34]:
first last
John Doe height 5.5
weight 130.0
Mary Bo height 6.0
weight 150.0
dtype: float64
更多详细信息和示例请参见 重塑文档。
cast
在 R 中,acast
是使用名为 df
的 data.frame 来转换为更高维数组的表达式:
df <- data.frame(
x = runif(12, 1, 168),
y = runif(12, 7, 334),
z = runif(12, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7),4),
week = rep(c(1,2), 6)
)
mdf <- melt(df, id=c("month", "week"))
acast(mdf, week ~ month ~ variable, mean)
在 Python 中,最好的方法是利用 pivot_table()
:
In [35]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 12),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 12),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 12),
....: "month": [5, 6, 7] * 4,
....: "week": [1, 2] * 6,
....: }
....: )
....:
In [36]: mdf = pd.melt(df, id_vars=["month", "week"])
In [37]: pd.pivot_table(
....: mdf,
....: values="value",
....: index=["variable", "week"],
....: columns=["month"],
....: aggfunc="mean",
....: )
....:
Out[37]:
month 5 6 7
variable week
x 1 93.888747 98.762034 55.219673
2 94.391427 38.112932 83.942781
y 1 94.306912 279.454811 227.840449
2 87.392662 193.028166 173.899260
z 1 11.016009 10.079307 16.170549
2 8.476111 17.638509 19.003494
类似于在 R 中使用名为 df
的 data.frame 来基于 Animal
和 FeedType
聚合信息的 dcast
:
df <- data.frame(
Animal = c('Animal1', 'Animal2', 'Animal3', 'Animal2', 'Animal1',
'Animal2', 'Animal3'),
FeedType = c('A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'B', 'A'),
Amount = c(10, 7, 4, 2, 5, 6, 2)
)
dcast(df, Animal ~ FeedType, sum, fill=NaN)
# Alternative method using base R
with(df, tapply(Amount, list(Animal, FeedType), sum))
Python 可以通过两种不同的方式来处理这个问题。首先,类似于上面使用 pivot_table()
:
In [38]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "Animal": [
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: "Animal2",
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: ],
....: "FeedType": ["A", "B", "A", "A", "B", "B", "A"],
....: "Amount": [10, 7, 4, 2, 5, 6, 2],
....: }
....: )
....:
In [39]: df.pivot_table(values="Amount", index="Animal", columns="FeedType", aggfunc="sum")
Out[39]:
FeedType A B
Animal
Animal1 10.0 5.0
Animal2 2.0 13.0
Animal3 6.0 NaN
第二种方法是使用 groupby()
方法:
In [40]: df.groupby(["Animal", "FeedType"])["Amount"].sum()
Out[40]:
Animal FeedType
Animal1 A 10
B 5
Animal2 A 2
B 13
Animal3 A 6
Name: Amount, dtype: int64
更多详细信息和示例请参见 重塑文档 或 分组文档。
factor
pandas 有一种用于分类数据的数据类型。
cut(c(1,2,3,4,5,6), 3)
factor(c(1,2,3,2,2,3))
在 pandas 中可以用 pd.cut
和 astype("category")
实现:
In [41]: pd.cut(pd.Series([1, 2, 3, 4, 5, 6]), 3)
Out[41]:
0 (0.995, 2.667]
1 (0.995, 2.667]
2 (2.667, 4.333]
3 (2.667, 4.333]
4 (4.333, 6.0]
5 (4.333, 6.0]
dtype: category
Categories (3, interval[float64, right]): [(0.995, 2.667] < (2.667, 4.333] < (4.333, 6.0]]
In [42]: pd.Series([1, 2, 3, 2, 2, 3]).astype("category")
Out[42]:
0 1
1 2
2 3
3 2
4 2
5 3
dtype: category
Categories (3, int64): [1, 2, 3]
更多详情和示例请参阅 分类简介 和 API 文档。还有关于 与 R 的因子的区别 的文档。
快速参考
我们将从一个快速参考指南开始,将一些常见的 R 操作(使用 dplyr)与 pandas 的等价操作进行对比。
查询、过滤、抽样
R | pandas |
---|---|
dim(df) |
df.shape |
head(df) |
df.head() |
slice(df, 1:10) |
df.iloc[:9] |
filter(df, col1 == 1, col2 == 1) |
df.query('col1 == 1 & col2 == 1') |
df[df$col1 == 1 & df$col2 == 1,] |
df[(df.col1 == 1) & (df.col2 == 1)] |
select(df, col1, col2) |
df[['col1', 'col2']] |
select(df, col1:col3) |
df.loc[:, 'col1':'col3'] |
select(df, -(col1:col3)) |
df.drop(cols_to_drop, axis=1) 但见 [1] |
distinct(select(df, col1)) |
df[['col1']].drop_duplicates() |
distinct(select(df, col1, col2)) |
df[['col1', 'col2']].drop_duplicates() |
sample_n(df, 10) |
df.sample(n=10) |
sample_frac(df, 0.01) |
df.sample(frac=0.01) |
排序
R | pandas |
---|---|
arrange(df, col1, col2) |
df.sort_values(['col1', 'col2']) |
arrange(df, desc(col1)) |
df.sort_values('col1', ascending=False) |
转换
R | pandas |
---|---|
select(df, col_one = col1) |
df.rename(columns={'col1': 'col_one'})['col_one'] |
rename(df, col_one = col1) |
df.rename(columns={'col1': 'col_one'}) |
mutate(df, c=a-b) |
df.assign(c=df['a']-df['b']) |
分组和汇总
R | pandas |
---|---|
summary(df) |
df.describe() |
gdf <- group_by(df, col1) |
gdf = df.groupby('col1') |
summarise(gdf, avg=mean(col1, na.rm=TRUE)) |
df.groupby('col1').agg({'col1': 'mean'}) |
summarise(gdf, total=sum(col1)) |
df.groupby('col1').sum() |
查询、过滤、抽样
R | pandas |
---|---|
dim(df) |
df.shape |
head(df) |
df.head() |
slice(df, 1:10) |
df.iloc[:9] |
filter(df, col1 == 1, col2 == 1) |
df.query('col1 == 1 & col2 == 1') |
df[df$col1 == 1 & df$col2 == 1,] |
df[(df.col1 == 1) & (df.col2 == 1)] |
select(df, col1, col2) |
df[['col1', 'col2']] |
select(df, col1:col3) |
df.loc[:, 'col1':'col3'] |
select(df, -(col1:col3)) |
df.drop(cols_to_drop, axis=1) 但见 [1] |
distinct(select(df, col1)) |
df[['col1']].drop_duplicates() |
distinct(select(df, col1, col2)) |
df[['col1', 'col2']].drop_duplicates() |
sample_n(df, 10) |
df.sample(n=10) |
sample_frac(df, 0.01) |
df.sample(frac=0.01) |
排序
R | pandas |
---|---|
arrange(df, col1, col2) |
df.sort_values(['col1', 'col2']) |
arrange(df, desc(col1)) |
df.sort_values('col1', ascending=False) |
转换
R | pandas |
---|---|
select(df, col_one = col1) |
df.rename(columns={'col1': 'col_one'})['col_one'] |
rename(df, col_one = col1) |
df.rename(columns={'col1': 'col_one'}) |
mutate(df, c=a-b) |
df.assign(c=df['a']-df['b']) |
分组和汇总
R | pandas |
---|---|
summary(df) |
df.describe() |
gdf <- group_by(df, col1) |
gdf = df.groupby('col1') |
summarise(gdf, avg=mean(col1, na.rm=TRUE)) |
df.groupby('col1').agg({'col1': 'mean'}) |
summarise(gdf, total=sum(col1)) |
df.groupby('col1').sum() |
基本 R
使用 R 的 c
进行切片
R 使得通过名称轻松访问 data.frame
列
df <- data.frame(a=rnorm(5), b=rnorm(5), c=rnorm(5), d=rnorm(5), e=rnorm(5))
df[, c("a", "c", "e")]
或通过整数位置
df <- data.frame(matrix(rnorm(1000), ncol=100))
df[, c(1:10, 25:30, 40, 50:100)]
在 pandas 中通过名称选择多列很简单
In [1]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 3), columns=list("abc"))
In [2]: df[["a", "c"]]
Out[2]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
In [3]: df.loc[:, ["a", "c"]]
Out[3]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
通过整数位置选择多个不连续的列可以通过 iloc
索引器属性和 numpy.r_
的组合实现。
In [4]: named = list("abcdefg")
In [5]: n = 30
In [6]: columns = named + np.arange(len(named), n).tolist()
In [7]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(n, n), columns=columns)
In [8]: df.iloc[:, np.r_[:10, 24:30]]
Out[8]:
a b c ... 27 28 29
0 -1.344312 0.844885 1.075770 ... 0.813850 0.132003 -0.827317
1 -0.076467 -1.187678 1.130127 ... 0.149748 -0.732339 0.687738
2 0.176444 0.403310 -0.154951 ... -0.493662 0.600178 0.274230
3 0.132885 -0.023688 2.410179 ... 0.109121 1.126203 -0.977349
4 1.474071 -0.064034 -1.282782 ... -0.858447 0.306996 -0.028665
.. ... ... ... ... ... ... ...
25 1.492125 -0.068190 0.681456 ... 0.428572 0.880609 0.487645
26 0.725238 0.624607 -0.141185 ... 1.008500 1.424017 0.717110
27 1.262419 1.950057 0.301038 ... 1.007824 2.826008 1.458383
28 -1.585746 -0.899734 0.921494 ... 0.577223 -1.088417 0.326687
29 -0.986248 0.169729 -1.158091 ... -2.013086 -1.602549 0.333109
[30 rows x 16 columns]
aggregate
在 R 中,您可能希望将数据拆分为子集,并为每个子集计算平均值。使用名为 df
的数据框,并将其拆分为 by1
和 by2
组:
df <- data.frame(
v1 = c(1,3,5,7,8,3,5,NA,4,5,7,9),
v2 = c(11,33,55,77,88,33,55,NA,44,55,77,99),
by1 = c("red", "blue", 1, 2, NA, "big", 1, 2, "red", 1, NA, 12),
by2 = c("wet", "dry", 99, 95, NA, "damp", 95, 99, "red", 99, NA, NA))
aggregate(x=df[, c("v1", "v2")], by=list(mydf2$by1, mydf2$by2), FUN = mean)
groupby()
方法类似于基本的 R aggregate
函数。
In [9]: df = pd.DataFrame(
...: {
...: "v1": [1, 3, 5, 7, 8, 3, 5, np.nan, 4, 5, 7, 9],
...: "v2": [11, 33, 55, 77, 88, 33, 55, np.nan, 44, 55, 77, 99],
...: "by1": ["red", "blue", 1, 2, np.nan, "big", 1, 2, "red", 1, np.nan, 12],
...: "by2": [
...: "wet",
...: "dry",
...: 99,
...: 95,
...: np.nan,
...: "damp",
...: 95,
...: 99,
...: "red",
...: 99,
...: np.nan,
...: np.nan,
...: ],
...: }
...: )
...:
In [10]: g = df.groupby(["by1", "by2"])
In [11]: g[["v1", "v2"]].mean()
Out[11]:
v1 v2
by1 by2
1 95 5.0 55.0
99 5.0 55.0
2 95 7.0 77.0
99 NaN NaN
big damp 3.0 33.0
blue dry 3.0 33.0
red red 4.0 44.0
wet 1.0 11.0
有关更多详细信息和示例,请参阅分组文档。
match
/ %in%
用 %in%
在 R 中选择数据的常见方法是使用 match
函数定义的。操作符 %in%
用于返回一个逻辑向量,指示是否有匹配项:
s <- 0:4
s %in% c(2,4)
isin()
方法类似于 R 的 %in%
操作符:
In [12]: s = pd.Series(np.arange(5), dtype=np.float32)
In [13]: s.isin([2, 4])
Out[13]:
0 False
1 False
2 True
3 False
4 True
dtype: bool
match
函数返回其第一个参数在第二个参数中的匹配位置的向量:
s <- 0:4
match(s, c(2,4))
有关更多详细信息和示例,请参阅重塑文档。
tapply
tapply
类似于 aggregate
,但数据可以是不规则的,因为子类大小可能不规则。使用名为 baseball
的数据框,并根据数组 team
检索信息:
baseball <-
data.frame(team = gl(5, 5,
labels = paste("Team", LETTERS[1:5])),
player = sample(letters, 25),
batting.average = runif(25, .200, .400))
tapply(baseball$batting.average, baseball.example$team,
max)
在 pandas 中,我们可以使用 pivot_table()
方法来处理这个问题:
In [14]: import random
In [15]: import string
In [16]: baseball = pd.DataFrame(
....: {
....: "team": ["team %d" % (x + 1) for x in range(5)] * 5,
....: "player": random.sample(list(string.ascii_lowercase), 25),
....: "batting avg": np.random.uniform(0.200, 0.400, 25),
....: }
....: )
....:
In [17]: baseball.pivot_table(values="batting avg", columns="team", aggfunc="max")
Out[17]:
team team 1 team 2 team 3 team 4 team 5
batting avg 0.352134 0.295327 0.397191 0.394457 0.396194
有关更多详细信息和示例,请参阅重塑文档。
subset
query()
方法类似于基本的 R subset
函数。在 R 中,您可能希望获取data.frame
的行,其中一列的值小于另一列的值:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
subset(df, a <= b)
df[df$a <= df$b,] # note the comma
在 pandas 中,有几种执行子集的方法。您可以使用query()
或将表达式传递为索引/切片,以及标准布尔索引:
In [18]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [19]: df.query("a <= b")
Out[19]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [20]: df[df["a"] <= df["b"]]
Out[20]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [21]: df.loc[df["a"] <= df["b"]]
Out[21]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
更多详细信息和示例请参见查询文档。
with
在 R 中使用名为df
的数据框(data.frame)和列a
和b
的表达式将使用with
进行评估,如下所示:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
with(df, a + b)
df$a + df$b # same as the previous expression
在 pandas 中,使用eval()
方法的等价表达式将是:
In [22]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [23]: df.eval("a + b")
Out[23]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
In [24]: df["a"] + df["b"] # same as the previous expression
Out[24]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
在某些情况下,eval()
比纯 Python 中的评估要快得多。更多详细信息和示例请参见评估文档。
使用 R 的c
进行切片
R 可以轻松通过名称访问data.frame
列
df <- data.frame(a=rnorm(5), b=rnorm(5), c=rnorm(5), d=rnorm(5), e=rnorm(5))
df[, c("a", "c", "e")]
或通过整数位置
df <- data.frame(matrix(rnorm(1000), ncol=100))
df[, c(1:10, 25:30, 40, 50:100)]
在 pandas 中按名称选择多个列非常简单
In [1]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 3), columns=list("abc"))
In [2]: df[["a", "c"]]
Out[2]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
In [3]: df.loc[:, ["a", "c"]]
Out[3]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
通过iloc
索引器属性和numpy.r_
的组合可以实现通过整数位置选择多个非连续列。
In [4]: named = list("abcdefg")
In [5]: n = 30
In [6]: columns = named + np.arange(len(named), n).tolist()
In [7]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(n, n), columns=columns)
In [8]: df.iloc[:, np.r_[:10, 24:30]]
Out[8]:
a b c ... 27 28 29
0 -1.344312 0.844885 1.075770 ... 0.813850 0.132003 -0.827317
1 -0.076467 -1.187678 1.130127 ... 0.149748 -0.732339 0.687738
2 0.176444 0.403310 -0.154951 ... -0.493662 0.600178 0.274230
3 0.132885 -0.023688 2.410179 ... 0.109121 1.126203 -0.977349
4 1.474071 -0.064034 -1.282782 ... -0.858447 0.306996 -0.028665
.. ... ... ... ... ... ... ...
25 1.492125 -0.068190 0.681456 ... 0.428572 0.880609 0.487645
26 0.725238 0.624607 -0.141185 ... 1.008500 1.424017 0.717110
27 1.262419 1.950057 0.301038 ... 1.007824 2.826008 1.458383
28 -1.585746 -0.899734 0.921494 ... 0.577223 -1.088417 0.326687
29 -0.986248 0.169729 -1.158091 ... -2.013086 -1.602549 0.333109
[30 rows x 16 columns]
aggregate
在 R 中,您可能希望将数据拆分为子集并为每个子集计算平均值。使用名为df
的数据框,并将其拆分为组by1
和by2
:
df <- data.frame(
v1 = c(1,3,5,7,8,3,5,NA,4,5,7,9),
v2 = c(11,33,55,77,88,33,55,NA,44,55,77,99),
by1 = c("red", "blue", 1, 2, NA, "big", 1, 2, "red", 1, NA, 12),
by2 = c("wet", "dry", 99, 95, NA, "damp", 95, 99, "red", 99, NA, NA))
aggregate(x=df[, c("v1", "v2")], by=list(mydf2$by1, mydf2$by2), FUN = mean)
groupby()
方法类似于基本的 R aggregate
函数。
In [9]: df = pd.DataFrame(
...: {
...: "v1": [1, 3, 5, 7, 8, 3, 5, np.nan, 4, 5, 7, 9],
...: "v2": [11, 33, 55, 77, 88, 33, 55, np.nan, 44, 55, 77, 99],
...: "by1": ["red", "blue", 1, 2, np.nan, "big", 1, 2, "red", 1, np.nan, 12],
...: "by2": [
...: "wet",
...: "dry",
...: 99,
...: 95,
...: np.nan,
...: "damp",
...: 95,
...: 99,
...: "red",
...: 99,
...: np.nan,
...: np.nan,
...: ],
...: }
...: )
...:
In [10]: g = df.groupby(["by1", "by2"])
In [11]: g[["v1", "v2"]].mean()
Out[11]:
v1 v2
by1 by2
1 95 5.0 55.0
99 5.0 55.0
2 95 7.0 77.0
99 NaN NaN
big damp 3.0 33.0
blue dry 3.0 33.0
red red 4.0 44.0
wet 1.0 11.0
更多详细信息和示例请参见分组文档。
match
/ %in%
在 R 中选择数据的常见方式是使用%in%
,该运算符使用match
函数定义。运算符%in%
用于返回一个逻辑向量,指示是否存在匹配项:
s <- 0:4
s %in% c(2,4)
isin()
方法类似于 R 的%in%
运算符:
In [12]: s = pd.Series(np.arange(5), dtype=np.float32)
In [13]: s.isin([2, 4])
Out[13]:
0 False
1 False
2 True
3 False
4 True
dtype: bool
match
函数返回其第一个参数在第二个参数中匹配位置的向量:
s <- 0:4
match(s, c(2,4))
更多详细信息和示例请参见重塑文档。
tapply
tapply
类似于 aggregate
,但数据可以是不规则的数组,因为子类大小可能不规则。使用名为 baseball
的 data.frame,并根据数组 team
检索信息:
baseball <-
data.frame(team = gl(5, 5,
labels = paste("Team", LETTERS[1:5])),
player = sample(letters, 25),
batting.average = runif(25, .200, .400))
tapply(baseball$batting.average, baseball.example$team,
max)
在 pandas 中,我们可以使用pivot_table()
方法来处理这个问题:
In [14]: import random
In [15]: import string
In [16]: baseball = pd.DataFrame(
....: {
....: "team": ["team %d" % (x + 1) for x in range(5)] * 5,
....: "player": random.sample(list(string.ascii_lowercase), 25),
....: "batting avg": np.random.uniform(0.200, 0.400, 25),
....: }
....: )
....:
In [17]: baseball.pivot_table(values="batting avg", columns="team", aggfunc="max")
Out[17]:
team team 1 team 2 team 3 team 4 team 5
batting avg 0.352134 0.295327 0.397191 0.394457 0.396194
更多详细信息和示例请参见重塑文档。
subset
query()
方法类似于基本的 R subset
函数。在 R 中,您可能希望获取 data.frame
的行,其中一个列的值小于另一个列的值:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
subset(df, a <= b)
df[df$a <= df$b,] # note the comma
在 pandas 中,有几种方法可以执行子集。您可以使用query()
或将表达式传递为索引/切片,以及标准布尔索引:
In [18]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [19]: df.query("a <= b")
Out[19]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [20]: df[df["a"] <= df["b"]]
Out[20]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [21]: df.loc[df["a"] <= df["b"]]
Out[21]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
更多详细信息和示例请参见查询文档。
with
在 R 中使用名为 df
的 data.frame,具有列 a
和 b
,将使用 with
进行评估,如下所示:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
with(df, a + b)
df$a + df$b # same as the previous expression
在 pandas 中,等效的��达式,使用eval()
方法,将是:
In [22]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [23]: df.eval("a + b")
Out[23]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
In [24]: df["a"] + df["b"] # same as the previous expression
Out[24]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
在某些情况下,eval()
比纯 Python 中的评估要快得多。更多详细信息和示例请参见 eval 文档。
plyr
plyr
是用于数据分析的分割-应用-组合策略的 R 库。这些函数围绕 R 中的三种数据结构展开,a
代表 arrays
,l
代表 lists
,d
代表 data.frame
。下表显示了这些数据结构在 Python 中的映射方式。
R | Python |
---|---|
array | list |
lists | 字典或对象列表 |
data.frame | dataframe |
ddply
在 R 中使用名为 df
的 data.frame 表达式,您想要按 month
汇总 x
:
require(plyr)
df <- data.frame(
x = runif(120, 1, 168),
y = runif(120, 7, 334),
z = runif(120, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7,8),30),
week = sample(1:4, 120, TRUE)
)
ddply(df, .(month, week), summarize,
mean = round(mean(x), 2),
sd = round(sd(x), 2))
在 pandas 中,等效的表达式,使用groupby()
方法,将是:
In [25]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 120),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 120),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 120),
....: "month": [5, 6, 7, 8] * 30,
....: "week": np.random.randint(1, 4, 120),
....: }
....: )
....:
In [26]: grouped = df.groupby(["month", "week"])
In [27]: grouped["x"].agg(["mean", "std"])
Out[27]:
mean std
month week
5 1 63.653367 40.601965
2 78.126605 53.342400
3 92.091886 57.630110
6 1 81.747070 54.339218
2 70.971205 54.687287
3 100.968344 54.010081
7 1 61.576332 38.844274
2 61.733510 48.209013
3 71.688795 37.595638
8 1 62.741922 34.618153
2 91.774627 49.790202
3 73.936856 60.773900
更多详细信息和示例请参见分组文档。
ddply
在 R 中使用名为 df
的 data.frame 表达式,您想要按 month
汇总 x
:
require(plyr)
df <- data.frame(
x = runif(120, 1, 168),
y = runif(120, 7, 334),
z = runif(120, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7,8),30),
week = sample(1:4, 120, TRUE)
)
ddply(df, .(month, week), summarize,
mean = round(mean(x), 2),
sd = round(sd(x), 2))
在 pandas 中,等效的表达式,使用groupby()
方法,将是:
In [25]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 120),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 120),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 120),
....: "month": [5, 6, 7, 8] * 30,
....: "week": np.random.randint(1, 4, 120),
....: }
....: )
....:
In [26]: grouped = df.groupby(["month", "week"])
In [27]: grouped["x"].agg(["mean", "std"])
Out[27]:
mean std
month week
5 1 63.653367 40.601965
2 78.126605 53.342400
3 92.091886 57.630110
6 1 81.747070 54.339218
2 70.971205 54.687287
3 100.968344 54.010081
7 1 61.576332 38.844274
2 61.733510 48.209013
3 71.688795 37.595638
8 1 62.741922 34.618153
2 91.774627 49.790202
3 73.936856 60.773900
更多细节和示例请参见分组文档。
reshape / reshape2
meltarray
在 R 中使用名为a
的三维数组的表达式,你想要将其融化成数据框:
a <- array(c(1:23, NA), c(2,3,4))
data.frame(melt(a))
在 Python 中,由于a
是一个列表,你可以简单地使用列表推导式。
In [28]: a = np.array(list(range(1, 24)) + [np.NAN]).reshape(2, 3, 4)
In [29]: pd.DataFrame([tuple(list(x) + [val]) for x, val in np.ndenumerate(a)])
Out[29]:
0 1 2 3
0 0 0 0 1.0
1 0 0 1 2.0
2 0 0 2 3.0
3 0 0 3 4.0
4 0 1 0 5.0
.. .. .. .. ...
19 1 1 3 20.0
20 1 2 0 21.0
21 1 2 1 22.0
22 1 2 2 23.0
23 1 2 3 NaN
[24 rows x 4 columns]
meltlist
在 R 中使用名为a
的列表的表达式,你想要将其融化成数据框:
a <- as.list(c(1:4, NA))
data.frame(melt(a))
在 Python 中,这个列表将是一个元组的列表,所以DataFrame()
方法会将其转换为所需的数据框。
In [30]: a = list(enumerate(list(range(1, 5)) + [np.NAN]))
In [31]: pd.DataFrame(a)
Out[31]:
0 1
0 0 1.0
1 1 2.0
2 2 3.0
3 3 4.0
4 4 NaN
更多细节和示例请参见数据结构介绍文档。
meltdf
在 R 中使用名为cheese
的数据框的表达式,你想要重塑数据框:
cheese <- data.frame(
first = c('John', 'Mary'),
last = c('Doe', 'Bo'),
height = c(5.5, 6.0),
weight = c(130, 150)
)
melt(cheese, id=c("first", "last"))
在 Python 中,melt()
方法是 R 的等价物:
In [32]: cheese = pd.DataFrame(
....: {
....: "first": ["John", "Mary"],
....: "last": ["Doe", "Bo"],
....: "height": [5.5, 6.0],
....: "weight": [130, 150],
....: }
....: )
....:
In [33]: pd.melt(cheese, id_vars=["first", "last"])
Out[33]:
first last variable value
0 John Doe height 5.5
1 Mary Bo height 6.0
2 John Doe weight 130.0
3 Mary Bo weight 150.0
In [34]: cheese.set_index(["first", "last"]).stack(future_stack=True) # alternative way
Out[34]:
first last
John Doe height 5.5
weight 130.0
Mary Bo height 6.0
weight 150.0
dtype: float64
更多细节和示��请参见重塑文档。
转换
在 R 中,acast
是一个使用名为df
的数据框来转换为更高维数组的表达式:
df <- data.frame(
x = runif(12, 1, 168),
y = runif(12, 7, 334),
z = runif(12, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7),4),
week = rep(c(1,2), 6)
)
mdf <- melt(df, id=c("month", "week"))
acast(mdf, week ~ month ~ variable, mean)
在 Python 中,最好的方法是利用pivot_table()
:
In [35]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 12),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 12),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 12),
....: "month": [5, 6, 7] * 4,
....: "week": [1, 2] * 6,
....: }
....: )
....:
In [36]: mdf = pd.melt(df, id_vars=["month", "week"])
In [37]: pd.pivot_table(
....: mdf,
....: values="value",
....: index=["variable", "week"],
....: columns=["month"],
....: aggfunc="mean",
....: )
....:
Out[37]:
month 5 6 7
variable week
x 1 93.888747 98.762034 55.219673
2 94.391427 38.112932 83.942781
y 1 94.306912 279.454811 227.840449
2 87.392662 193.028166 173.899260
z 1 11.016009 10.079307 16.170549
2 8.476111 17.638509 19.003494
类似于dcast
,它使用在 R 中名为df
的数据框来根据Animal
和FeedType
聚合信息的表达式:
df <- data.frame(
Animal = c('Animal1', 'Animal2', 'Animal3', 'Animal2', 'Animal1',
'Animal2', 'Animal3'),
FeedType = c('A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'B', 'A'),
Amount = c(10, 7, 4, 2, 5, 6, 2)
)
dcast(df, Animal ~ FeedType, sum, fill=NaN)
# Alternative method using base R
with(df, tapply(Amount, list(Animal, FeedType), sum))
Python 可以用两种不同的方式来处理这个问题。首先,类似于上面使用pivot_table()
:
In [38]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "Animal": [
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: "Animal2",
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: ],
....: "FeedType": ["A", "B", "A", "A", "B", "B", "A"],
....: "Amount": [10, 7, 4, 2, 5, 6, 2],
....: }
....: )
....:
In [39]: df.pivot_table(values="Amount", index="Animal", columns="FeedType", aggfunc="sum")
Out[39]:
FeedType A B
Animal
Animal1 10.0 5.0
Animal2 2.0 13.0
Animal3 6.0 NaN
第二种方法是使用groupby()
方法:
In [40]: df.groupby(["Animal", "FeedType"])["Amount"].sum()
Out[40]:
Animal FeedType
Animal1 A 10
B 5
Animal2 A 2
B 13
Animal3 A 6
Name: Amount, dtype: int64
更多细节和示例请参见重塑文档或分组文档。
factor
pandas 有一个用于分类数据的数据类型。
cut(c(1,2,3,4,5,6), 3)
factor(c(1,2,3,2,2,3))
在 pandas 中,可以通过pd.cut
和astype("category")
来实现:
In [41]: pd.cut(pd.Series([1, 2, 3, 4, 5, 6]), 3)
Out[41]:
0 (0.995, 2.667]
1 (0.995, 2.667]
2 (2.667, 4.333]
3 (2.667, 4.333]
4 (4.333, 6.0]
5 (4.333, 6.0]
dtype: category
Categories (3, interval[float64, right]): [(0.995, 2.667] < (2.667, 4.333] < (4.333, 6.0]]
In [42]: pd.Series([1, 2, 3, 2, 2, 3]).astype("category")
Out[42]:
0 1
1 2
2 3
3 2
4 2
5 3
dtype: category
Categories (3, int64): [1, 2, 3]
更多细节和示例请参见分类介绍和 API 文档。还有关于 R 的因子的差异的文档。
meltarray
在 R 中使用名为a
的三维数组的表达式,你想要将其融化成数据框:
a <- array(c(1:23, NA), c(2,3,4))
data.frame(melt(a))
在 Python 中,由于a
是一个列表,你可以简单地使用列表推导式。
In [28]: a = np.array(list(range(1, 24)) + [np.NAN]).reshape(2, 3, 4)
In [29]: pd.DataFrame([tuple(list(x) + [val]) for x, val in np.ndenumerate(a)])
Out[29]:
0 1 2 3
0 0 0 0 1.0
1 0 0 1 2.0
2 0 0 2 3.0
3 0 0 3 4.0
4 0 1 0 5.0
.. .. .. .. ...
19 1 1 3 20.0
20 1 2 0 21.0
21 1 2 1 22.0
22 1 2 2 23.0
23 1 2 3 NaN
[24 rows x 4 columns]
meltlist
在 R 中使用名为a
的列表的表达式,你想要将其融化成数据框:
a <- as.list(c(1:4, NA))
data.frame(melt(a))
在 Python 中,这个列表将是一个元组的列表,所以DataFrame()
方法会将其转换为所需的数据框。
In [30]: a = list(enumerate(list(range(1, 5)) + [np.NAN]))
In [31]: pd.DataFrame(a)
Out[31]:
0 1
0 0 1.0
1 1 2.0
2 2 3.0
3 3 4.0
4 4 NaN
更多详细信息和示例请参见数据结构介绍文档。
meltdf
在 R 中使用名为cheese
的数据框进行数据重塑的表达式:
cheese <- data.frame(
first = c('John', 'Mary'),
last = c('Doe', 'Bo'),
height = c(5.5, 6.0),
weight = c(130, 150)
)
melt(cheese, id=c("first", "last"))
在 Python 中,melt()
方法相当于 R 中的:
In [32]: cheese = pd.DataFrame(
....: {
....: "first": ["John", "Mary"],
....: "last": ["Doe", "Bo"],
....: "height": [5.5, 6.0],
....: "weight": [130, 150],
....: }
....: )
....:
In [33]: pd.melt(cheese, id_vars=["first", "last"])
Out[33]:
first last variable value
0 John Doe height 5.5
1 Mary Bo height 6.0
2 John Doe weight 130.0
3 Mary Bo weight 150.0
In [34]: cheese.set_index(["first", "last"]).stack(future_stack=True) # alternative way
Out[34]:
first last
John Doe height 5.5
weight 130.0
Mary Bo height 6.0
weight 150.0
dtype: float64
更多详细信息和示例请参见重塑文档。
cast
在 R 中,acast
是使用名为df
的数据框进行高维数组转换的表达式:
df <- data.frame(
x = runif(12, 1, 168),
y = runif(12, 7, 334),
z = runif(12, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7),4),
week = rep(c(1,2), 6)
)
mdf <- melt(df, id=c("month", "week"))
acast(mdf, week ~ month ~ variable, mean)
在 Python 中,最佳方式是利用pivot_table()
:
In [35]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 12),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 12),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 12),
....: "month": [5, 6, 7] * 4,
....: "week": [1, 2] * 6,
....: }
....: )
....:
In [36]: mdf = pd.melt(df, id_vars=["month", "week"])
In [37]: pd.pivot_table(
....: mdf,
....: values="value",
....: index=["variable", "week"],
....: columns=["month"],
....: aggfunc="mean",
....: )
....:
Out[37]:
month 5 6 7
variable week
x 1 93.888747 98.762034 55.219673
2 94.391427 38.112932 83.942781
y 1 94.306912 279.454811 227.840449
2 87.392662 193.028166 173.899260
z 1 11.016009 10.079307 16.170549
2 8.476111 17.638509 19.003494
类似于dcast
,它使用 R 中名为df
的数据框根据Animal
和FeedType
聚合信息:
df <- data.frame(
Animal = c('Animal1', 'Animal2', 'Animal3', 'Animal2', 'Animal1',
'Animal2', 'Animal3'),
FeedType = c('A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'B', 'A'),
Amount = c(10, 7, 4, 2, 5, 6, 2)
)
dcast(df, Animal ~ FeedType, sum, fill=NaN)
# Alternative method using base R
with(df, tapply(Amount, list(Animal, FeedType), sum))
Python 可以通过两种不同的方式来实现。首先,类似于上面使用pivot_table()
:
In [38]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "Animal": [
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: "Animal2",
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: ],
....: "FeedType": ["A", "B", "A", "A", "B", "B", "A"],
....: "Amount": [10, 7, 4, 2, 5, 6, 2],
....: }
....: )
....:
In [39]: df.pivot_table(values="Amount", index="Animal", columns="FeedType", aggfunc="sum")
Out[39]:
FeedType A B
Animal
Animal1 10.0 5.0
Animal2 2.0 13.0
Animal3 6.0 NaN
第二种方法是使用groupby()
方法:
In [40]: df.groupby(["Animal", "FeedType"])["Amount"].sum()
Out[40]:
Animal FeedType
Animal1 A 10
B 5
Animal2 A 2
B 13
Animal3 A 6
Name: Amount, dtype: int64
更多详细信息和示例请参见重塑文档或分组文档。
factor
pandas 有一种用于分类数据的数据类型。
cut(c(1,2,3,4,5,6), 3)
factor(c(1,2,3,2,2,3))
在 pandas 中,可以通过pd.cut
和astype("category")
来实现:
In [41]: pd.cut(pd.Series([1, 2, 3, 4, 5, 6]), 3)
Out[41]:
0 (0.995, 2.667]
1 (0.995, 2.667]
2 (2.667, 4.333]
3 (2.667, 4.333]
4 (4.333, 6.0]
5 (4.333, 6.0]
dtype: category
Categories (3, interval[float64, right]): [(0.995, 2.667] < (2.667, 4.333] < (4.333, 6.0]]
In [42]: pd.Series([1, 2, 3, 2, 2, 3]).astype("category")
Out[42]:
0 1
1 2
2 3
3 2
4 2
5 3
dtype: category
Categories (3, int64): [1, 2, 3]
更多详细信息和示例请参见分类介绍和 API 文档。还有一份关于 R 中因子的差异的文档。
标签:...,教程,df,....,col1,np,2.2,Pandas,Out From: https://www.cnblogs.com/apachecn/p/18154743