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浅浅了解一下图像分割(pytorch框架)

时间:2024-03-16 20:04:40浏览次数:32  
标签:__ ... nn img 浅浅 self pytorch 图像

1、图像分割是什么

         图像分割分类是对图像中属于特定类别的像素进行分类的过程,因此图像分割可以认为是按像素进行分类的问题。

        传统的图像分割算法均是基于灰度值的不连续和相似的性质。而基于深度学习的图像分割技术则是利用卷积神经网络,来理解图像中的每个像素所代表的真实世界物体,这在以前是难以想象的。

2、图像分割的类型有哪些?

基于深度学习的图像分割技术主要分为两类:语义分割实例分割

语义分割会为图像中的每个像素分配一个类别,但是同一类别之间的对象不会区分。

实例分割是将图像中的每个物体实例标记出来,并为每个实例生成一个像素级的分割掩码。

实例分割看起来与目标检测相似,不同的是目标检测输出目标的边界框和类别,实例分割输出的是目标的Mask和类别。

看一下下面的图就明白了。

3、分割网络是怎么搭建的?

图像分割网络的构建通常涉及以下几个步骤:

1. 选择网络架构:首先要选择适合您任务的网络架构。常用的图像分割网络包括 U-Net、FCN、DeepLab 等。这些网络具有不同的结构和特点,适用于不同的应用场景。

2. 构建编码器和解码器部分:图像分割网络通常包括编码器和解码器两部分。编码器负责从输入图像中提取特征,通常通过卷积神经网络(CNN)来实现。解码器负责将编码器提取的特征映射回原始图像尺寸的预测结果。编码器和解码器之间通常会有一些连接,用于跳跃连接或信息传递,例如 U-Net 中的跳跃连接结构。

3. 选择损失函数:图像分割任务通常会使用像素级别的标签进行训练,因此常用的损失函数包括交叉熵损失、Dice 损失等。这些损失函数可以帮助网络学习正确的像素分类。

4. 选择优化器:选择合适的优化器来优化网络参数,例如 SGD、Adam 等。优化器的选择可以影响网络的收敛速度和性能。

5. 数据准备和预处理:准备训练数据集,并进行必要的预处理操作,例如图像缩放、裁剪、归一化等。同时,也要准备相应的标签数据,确保标签与图像对应匹配。

6. 训练网络: 使用准备好的训练数据集对网络进行训练。在训练过程中,输入图像被提供给网络,通过反向传播算法更新网络参数,以最小化损失函数。

7. 模型评估和调优:使用验证集或测试集对训练好的模型进行评估,并根据评估结果对网络进行调优。常见的评估指标包括 IoU(Intersection over Union)、Dice 系数等。

8. 模型应用:在实际应用中使用训练好的模型对新的图像进行分割预测。

创建个简单的分类网络实战:

数据存放格式:

├─data
    ├─test
    │  ├─last
    │  └─last_msk
    └─train
        ├─last
        └─last_msk

展示:       train/last图片                                                      train/last_msk图片

                  

加载数据集代码:

from torch.utils.data import Dataset
import os
import cv2
import numpy as np


class MyDataset(Dataset):
    def __init__(self, train_path, transform=None):
        self.images = os.listdir(train_path + '/last')
        self.labels = os.listdir(train_path + '/last_msk')
        assert len(self.images) == len(self.labels), 'Number does not match'
        self.transform = transform
        self.images_and_labels = []    # 存储图像和标签路径
        for i in range(len(self.images)):
            self.images_and_labels.append((train_path + '/last/' + self.images[i], train_path + '/last_msk/' + self.labels[i]))

    def __getitem__(self, item):
        img_path, lab_path = self.images_and_labels[item]
        img = cv2.imread(img_path)
        img = cv2.resize(img, (224, 224))
        lab = cv2.imread(lab_path, 0)
        lab = cv2.resize(lab, (224, 224))
        lab = lab / 255    # 转换成0和1
        lab = lab.astype('uint8')    # 不为1的全置为0
        lab = np.eye(2)[lab]    # one-hot编码
        lab = np.array(list(map(lambda x: abs(x-1), lab))).astype('float32')   # 将所有0变为1(1对应255, 白色背景),所有1变为0(黑色,目标)
        lab = lab.transpose(2, 0, 1)  # [224, 224, 2] => [2, 224, 224]
        if self.transform is not None:
            img = self.transform(img)
        return img, lab

    def __len__(self):
        return len(self.images)


if __name__ == '__main__':
    img = cv2.imread('data/train/last_msk/150.jpg', 0)
    img = cv2.resize(img, (16, 16))
    img2 = img/255
    img3 = img2.astype('uint8')
    hot1 = np.eye(2)[img3]
    hot2 = np.array(list(map(lambda x: abs(x-1), hot1)))
    print(hot2.shape)
    print(hot2.transpose(2, 0, 1))

模型代码:

import torch
from torch import nn


class Net(nn.Module):
    def __init__(self):
        super(Net, self).__init__()
        self.encode1 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(3, 64, kernel_size=3, stride=1, padding=1),
            nn.BatchNorm2d(64),
            nn.ReLU(True),
            nn.MaxPool2d(2, 2)
        )
        self.encode2 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(64, 128, kernel_size=3, stride=1, padding=1),
            nn.BatchNorm2d(128),
            nn.ReLU(True),
            nn.MaxPool2d(2, 2)
        )
        self.encode3 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(128, 256, kernel_size=3, stride=1, padding=1),
            nn.BatchNorm2d(256),
            nn.ReLU(True),
            nn.Conv2d(256, 256, 3, 1, 1),
            nn.BatchNorm2d(256),
            nn.ReLU(True),
            nn.MaxPool2d(2, 2)
        )
        self.encode4 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(256, 512, kernel_size=3, stride=1, padding=1),
            nn.BatchNorm2d(512),
            nn.ReLU(True),
            nn.Conv2d(512, 512, 3, 1, 1),
            nn.BatchNorm2d(512),
            nn.ReLU(True),
            nn.MaxPool2d(2, 2)
        )
        self.encode5 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(512, 512, kernel_size=3, stride=1, padding=1),
            nn.BatchNorm2d(512),
            nn.ReLU(True),
            nn.Conv2d(512, 512, 3, 1, 1),
            nn.BatchNorm2d(512),
            nn.ReLU(True),
            nn.MaxPool2d(2, 2)
        )
        self.decode1 = nn.Sequential(
            nn.ConvTranspose2d(in_channels=512, out_channels=256, kernel_size=3,
                               stride=2, padding=1, output_padding=1),
            nn.BatchNorm2d(256),
            nn.ReLU(True)
        )
        self.decode2 = nn.Sequential(
            nn.ConvTranspose2d(256, 128, 3, 2, 1, 1),
            nn.BatchNorm2d(128),
            nn.ReLU(True)
        )
        self.decode3 = nn.Sequential(
            nn.ConvTranspose2d(128, 64, 3, 2, 1, 1),
            nn.BatchNorm2d(64),
            nn.ReLU(True)
        )
        self.decode4 = nn.Sequential(
            nn.ConvTranspose2d(64, 32, 3, 2, 1, 1),
            nn.BatchNorm2d(32),
            nn.ReLU(True)
        )
        self.decode5 = nn.Sequential(
            nn.ConvTranspose2d(32, 16, 3, 2, 1, 1),
            nn.BatchNorm2d(16),
            nn.ReLU(True)
        )
        self.classifier = nn.Conv2d(16, 2, kernel_size=1)

    def forward(self, x):           # b: batch_size
        out = self.encode1(x)       # [b, 3, 224, 224]  =>  [b, 64, 112, 112]
        out = self.encode2(out)     # [b, 64, 112, 112] =>  [b, 128, 56, 56]
        out = self.encode3(out)     # [b, 128, 56, 56]  =>  [b, 256, 28, 28]
        out = self.encode4(out)     # [b, 256, 28, 28]  =>  [b, 512, 14, 14]
        out = self.encode5(out)     # [b, 512, 14, 14]  =>  [b, 512, 7, 7]
        out = self.decode1(out)     # [b, 512, 7, 7]    =>  [b, 256, 14, 14]
        out = self.decode2(out)     # [b, 256, 14, 14]  =>  [b, 128, 28, 28]
        out = self.decode3(out)     # [b, 128, 28, 28]  =>  [b, 64, 56, 56]
        out = self.decode4(out)     # [b, 64, 56, 56]   =>  [b, 32, 112, 112]
        out = self.decode5(out)     # [b, 32, 112, 112] =>  [b, 16, 224, 224]
        out = self.classifier(out)  # [b, 16, 224, 224] =>  [b, 2, 224, 224]   2表示类别数,目标和非目标两类
        return out


if __name__ == '__main__':
    img = torch.randn(2, 3, 224, 224)
    net = Net()
    sample = net(img)
    print(sample.shape)

训练代码:


# python
# 导入必要的库
import os  # 导入操作系统库,用于文件操作
import model  # 导入自定义的模型模块
import torch  # 导入PyTorch库
import torch.nn as nn  # 导入PyTorch神经网络模块
import torch.optim as optim  # 导入PyTorch优化器模块
import numpy as np  # 导入NumPy库,用于数组操作
from load_img import MyDataset  # 从load_img模块中导入自定义的MyDataset类
from torchvision import transforms  # 导入torchvision的transforms模块,用于图像预处理
from torch.utils.data import DataLoader  # 导入PyTorch的数据加载器模块

# 设置超参数
batchsize = 8  # 设置每个批次的大小为8
epochs = 50  # 设置训练的总轮数为50
train_data_path = 'data/train'  # 设置训练数据的路径

# 定义图像预处理流程:转换为tensor并归一化
transform = transforms.Compose([
    transforms.ToTensor(),  # 将图像转换为Tensor
    transforms.Normalize(mean=[0.485, 0.456, 0.406], std=[0.229, 0.224, 0.225])  # 归一化处理,使用预定义的均值和标准差
])

# 加载数据集,并设置批处理大小和是否打乱数据
bag = MyDataset(train_data_path, transform)  # 初始化MyDataset类,加载数据并应用预处理
dataloader = DataLoader(bag, batch_size=batchsize, shuffle=True)  # 使用DataLoader来加载数据,设置批次大小和打乱数据

# 选择使用GPU进行计算
device = torch.device('cuda')  # 设置设备为CUDA(即GPU)

# 将模型加载到GPU上
net = model.Net().to(device)  # 初始化模型,并将其移动到GPU上

# 设置损失函数和优化器
criterion = nn.BCELoss()  # 使用二分类交叉熵损失函数
optimizer = optim.SGD(net.parameters(), lr=1e-2, momentum=0.7)  # 使用随机梯度下降优化器,设置学习率和动量

# 检查是否存在保存模型的文件夹,如果不存在则创建
if not os.path.exists('checkpoints'):
    os.mkdir('checkpoints')

# 开始训练循环
for epoch in range(1, epochs + 1):  # 对每个epoch进行循环
    for batch_idx, (img, lab) in enumerate(dataloader):  # 对每个batch的数据进行循环
        img, lab = img.to(device), lab.to(device)  # 将数据和标签移动到GPU上

        # 通过模型进行前向传播,并使用sigmoid函数得到输出
        output = torch.sigmoid(net(img))  # sigmoid函数用于将输出转换为概率值

        # 计算损失
        loss = criterion(output, lab)  # 使用损失函数计算损失值

        # 每20个batch打印一次损失值
        if batch_idx % 20 == 0:
            print('Epoch:[{}/{}]\tStep:[{}/{}]\tLoss:{:.6f}'.format(
                epoch, epochs, (batch_idx + 1) * len(img), len(dataloader.dataset), loss.item()
            ))

            # 清空梯度,反向传播,更新权重
        optimizer.zero_grad()  # 清空梯度
        loss.backward()  # 反向传播计算梯度
        optimizer.step()  # 更新模型的权重

    # 每10个epoch保存一次模型
    if epoch % 10 == 0:
        torch.save(net, 'checkpoints/model_epoch_{}.pth'.format(epoch))  # 保存模型
        print

测试代码:

# 导入必要的库  
import torch                        # 导入PyTorch库  
import cv2                          # 导入OpenCV库,用于图像处理  
from torch.utils.data import Dataset, DataLoader  # 从PyTorch库中导入Dataset和DataLoader,用于构建数据集和加载数据  
from torchvision import transforms  # 从PyTorch的vision库中导入transforms,用于图像预处理  
import numpy as np                 # 导入NumPy库,用于数值计算  
import os                          # 导入os库,用于处理文件路径  
  
# 定义一个名为TestDataset的类,继承自Dataset  
class TestDataset(Dataset):  
    def __init__(self, test_img_path, transform=None):  
        # 初始化方法,接收测试图像的路径和转换方法作为参数  
        self.test_img = os.listdir(test_img_path)  # 获取测试图像路径下的所有文件名  
        self.transform = transform                  # 将转换方法保存为类的属性  
        self.images = []                             # 初始化一个空列表,用于存储完整的图像路径  
        for i in range(len(self.test_img)):         # 遍历所有文件名  
            self.images.append(os.path.join(test_img_path, self.test_img[i]))  # 拼接完整的图像路径并添加到列表中  
  
    def __getitem__(self, item):  
        # 根据索引获取图像的方法  
        img_path = self.images[item]                # 根据索引获取图像的完整路径  
        img = cv2.imread(img_path)                  # 使用OpenCV读取图像  
        img = cv2.resize(img, (224, 224))          # 将图像缩放到224x224的大小  
        if self.transform is not None:             # 如果有转换方法  
            img = self.transform(img)               # 使用转换方法处理图像  
        return img                                  # 返回处理后的图像  
  
    def __len__(self):  
        # 返回数据集的长度的方法  
        return len(self.test_img)                  # 返回图像文件名的数量  
  
# 定义测试图像的路径和模型检查点的路径  
test_img_path = 'data/test/last'  
checkpoint_path = 'checkpoints/model_epoch_10.pth'  
  
# 定义图像转换的流水线  
transform = transforms.Compose([transforms.ToTensor(),  # 将图像转换为Tensor  
                                transforms.Normalize(mean=[0.485, 0.456, 0.406], std=[0.229, 0.224, 0.225])])  # 对图像进行归一化处理  
  
# 使用定义的TestDataset类创建数据集对象  
bag = TestDataset(test_img_path, transform)  
  
# 使用DataLoader加载数据集  
dataloader = DataLoader(bag, batch_size=1, shuffle=None)  # 批处理大小为1,不打乱数据顺序  
  
# 加载模型检查点  
net = torch.load(checkpoint_path)  
  
# 将模型移动到GPU上  
net = net.cuda()  
  
# 遍历数据加载器中的每一个数据批次  
for idx, img in enumerate(dataloader):  
    # 将图像数据移动到GPU上  
    img = img.cuda()  
      
    # 前向传播,得到模型输出  
    output = torch.sigmoid(net(img))  # 对输出应用sigmoid函数,将其转换为概率值  
  
    # 将输出从GPU转移到CPU,并转换为NumPy数组  
    output_np = output.cpu().data.numpy().copy()  
      
    # 找到每个样本输出中的最小值索引  
    output_np = np.argmin(output_np, axis=1)  
      
    # 挤压数组,移除可能的单维度条目  
    img_arr = np.squeeze(output_np)  
      
    # 将索引值转换为0-255的范围(这看起来是不正确的,因为索引通常是整数,而不是概率值)  
    img_arr = img_arr*255  
      
    # 保存结果图像  
    cv2.imwrite('result/%03d.png'%idx, img_arr)  
      
    # 打印保存的图像的文件名  
    print('result/%03d.png'%idx)

结果展示:

4、所以分割网络到底是什么?

代码就是上面那些,直接运行的话也是可以的,但是我还是不理解分割到底是怎么进行运算的?

继续理解吧。

首先,模型代码分析

encode代表编码器,一共有5个encode,操作就是进行卷积+下采样

decode代表解码器,同样得有5个decode,操作就是进行卷积+上采样

最后一个分类器classifier,进行分类,

注意它的输出shape是1 x 2 x 224 x 224

代表: batch  x channels x weight x height  #batch  通道数  宽 高

注意这里的channel是前景类别 + 背景   #例如上面的类别是2,代表只有一个前景和一个背景输出的tensor是这样的

tensor([[[[ 3.1585,  3.3064,  3.1652,  ...,  3.3435,  3.2202,  3.1270],
          [ 3.2913,  3.4627,  3.4873,  ...,  3.4024,  3.3583,  3.0580],
          [ 3.3163,  3.4247,  3.2877,  ...,  3.4584,  3.1003,  3.1352],
          ...,
          [ 3.3558,  3.0914,  3.2765,  ...,  3.3156,  3.3142,  3.0663],
          [ 3.3003,  3.2883,  3.0972,  ...,  3.3562,  3.2461,  3.1394],
          [ 3.1776,  2.7403,  3.0708,  ...,  2.8127,  3.1564,  2.8254]],
         [[-3.1017, -3.2601, -3.1177,  ..., -3.2974, -3.1925, -3.0627],
          [-3.2573, -3.6687, -3.4113,  ..., -3.6558, -3.3187, -3.0988],
          [-3.2599, -3.2627, -3.2116,  ..., -3.3546, -3.0332, -3.1106],
          ...,
          [-3.3207, -3.2899, -3.2340,  ..., -3.5797, -3.2753, -3.0780],
          [-3.2396, -3.2038, -3.0360,  ..., -3.2971, -3.1837, -3.0911],
          [-3.1533, -2.7486, -3.0507,  ..., -2.8135, -3.1188, -2.8821]]]],
       device='cuda:0', grad_fn=<ConvolutionBackward0>)
 

然后,测试代码分析

在这个代码里注意看前向传播这里。

output = torch.sigmoid(net(img))

这里sigmoid是将数据归一化到0-1范围内,输出的数据是这样的

tensor([[[[0.9592, 0.9646, 0.9595,  ..., 0.9659, 0.9616, 0.9580],
          [0.9641, 0.9696, 0.9703,  ..., 0.9678, 0.9664, 0.9551],
          [0.9650, 0.9685, 0.9640,  ..., 0.9695, 0.9569, 0.9583],
          ...,
          [0.9663, 0.9565, 0.9636,  ..., 0.9650, 0.9649, 0.9555],
          [0.9644, 0.9640, 0.9568,  ..., 0.9663, 0.9625, 0.9585],
          [0.9600, 0.9394, 0.9557,  ..., 0.9434, 0.9592, 0.9440]],

         [[0.0430, 0.0370, 0.0424,  ..., 0.0357, 0.0394, 0.0447],
          [0.0371, 0.0249, 0.0319,  ..., 0.0252, 0.0349, 0.0432],
          [0.0370, 0.0369, 0.0387,  ..., 0.0337, 0.0460, 0.0427],
          ...,
          [0.0349, 0.0359, 0.0379,  ..., 0.0271, 0.0364, 0.0440],
          [0.0377, 0.0390, 0.0458,  ..., 0.0357, 0.0398, 0.0435],
          [0.0410, 0.0602, 0.0452,  ..., 0.0566, 0.0423, 0.0530]]]],
       device='cuda:0', grad_fn=<SigmoidBackward0>)

还可以知道,单个像素点的tensor是这样的

tensor([[[[0.9592],
          [0.0430]],

         [[0.9641],
          [0.0371]],

         [[0.9650],
          [0.0370]],

         ...,

         [[0.9663],
          [0.0349]],

         [[0.9644],
          [0.0377]],

         [[0.9600],
          [0.0410]]],


        [[[0.9646],
          [0.0370]],

         [[0.9696],
          [0.0249]],

         [[0.9685],
          [0.0369]],

         ...,

         [[0.9565],
          [0.0359]],

         [[0.9640],
          [0.0390]],

         [[0.9394],
          [0.0602]]],


        [[[0.9595],
          [0.0424]],

         [[0.9703],
          [0.0319]],

         [[0.9640],
          [0.0387]],

         ...,

         [[0.9636],
          [0.0379]],

         [[0.9568],
          [0.0458]],

         [[0.9557],
          [0.0452]]],


        ...,


        [[[0.9659],
          [0.0357]],

         [[0.9678],
          [0.0252]],

         [[0.9695],
          [0.0337]],

         ...,

         [[0.9650],
          [0.0271]],

         [[0.9663],
          [0.0357]],

         [[0.9434],
          [0.0566]]],


        [[[0.9616],
          [0.0394]],

         [[0.9664],
          [0.0349]],

         [[0.9569],
          [0.0460]],

         ...,

         [[0.9649],
          [0.0364]],

         [[0.9625],
          [0.0398]],

         [[0.9592],
          [0.0423]]],


        [[[0.9580],
          [0.0447]],

         [[0.9551],
          [0.0432]],

         [[0.9583],
          [0.0427]],

         ...,

         [[0.9555],
          [0.0440]],

         [[0.9585],
          [0.0435]],

         [[0.9440],
          [0.0530]]]], device='cuda:0', grad_fn=<PermuteBackward0>)

从这三个tensor可以明白,针对二分类任务,经过模型输出的预测结果包含两个通道,一个通道里存储的是前景的预测概率值,另一个通道里存储的是背景的预测概率值。或者说单个像素点会被预测两个值,分别存储在不同的通道里。多类别任务以此类推。。。

继续

output_np = output.cpu().data.numpy().copy()

是numpy数组的转换

继续

output_np = np.argmin(output_np, axis=1)

这里np.argmin是取最小值索引的操作,维度沿着通道维度,axis=1

这句代码的作用是将 output_np 数组中的每个像素(或像素区域)的类别概率转换为对应的类别索引。

输出就是这样的:

然后就是:

img_arr = np.squeeze(output_np)

目的在于去掉batch维度。之后就是进行上色了。如果想在原图上展示,就是先生成蒙版,再与图像进行合成,注意设置透明度。

参考:

感谢博主:阿里云云栖号

感谢博主:一文读懂语义分割与实例分割 - 知乎

感谢博主:Pytorch搭建训练简单的图像分割模型_pytorch分割使用预训练模型-CSDN博客

初识分割,写的不对的地方,请大家指教!

标签:__,...,nn,img,浅浅,self,pytorch,图像
From: https://blog.csdn.net/weixin_46319994/article/details/136689191

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