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biomaRt使用 | 同源基因名转换 | 人鼠同源基因ID

时间:2022-08-19 13:59:34浏览次数:65  
标签:转换 biomaRt 基因 人鼠 同源 ID

 

这个要严谨一点,众所周知,小鼠是小写,人是大写,以前为了方便都是直接一个toupper函数完成转换,但这样做实在是太粗糙了,大概有三分之一的基因会丢失。

我简单统计了一下:

人鼠同源的有23242个基因注释,其中有7695个基因是无法简单对应的,所以你之前的分析会漏掉很多基因。

建议使用ensembl_gene_id来做index,然后map,这样才是生信该有的严谨!!!

 

 

待续~

 

标签:转换,biomaRt,基因,人鼠,同源,ID
From: https://www.cnblogs.com/leezx/p/16601710.html

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