https://zssure.blog.csdn.net/article/details/49231303
题记:
DICOM医学图像处理专栏撰写已有两个年头,积累了近百篇文章。 起初 只是用于记录自己科研、工作中遇到的疑难问题,专注于图像处理(主要是医学图像,这也正是专栏名称最初的由来);后来逐渐延伸到了DICOM数据传输方向,专注于医院内影像数据的传输和管理,遂将博文标题按照【DICOM医学图像处理:XXX】和【DICOM:XXX】划分,分别介绍图像处理和数据传输;到最后又添加了开源工具分析部分,诸如DICOM开源实现库(dcmtk、dcm4che、fo-dicom)、开源PACS系统(Orthanc、dcm4chee、ClearCanvas)。
背景:
近期多次收到网友邮件或私信希望给出一个简单的说明,方便由简到难的来逐步浏览和阅读专栏中的博文。自己按照上述的主线来写,一直以为逻辑还算清晰,但自己回想起来,对于初学者甚至外行来说,专栏整体还不够清晰,一时很难找到切入点进行学习。因此近期一直在考虑写一篇关于“DICOM学习路线图”的博文,构思许久仍感充满纰漏,如何能够让初学者快速掌握DICOM相关知识?如何能够学习知识点的同时展开实际编程训练?还有许许多多的问题没有想好、想明白……
今天暂时整理初稿,大致对专栏文章进行一个简单分类,以便初学者快速归类定位相关博文,后续会持续更新完善,希望达到自己当初“深入浅出,引领DICOM学习”的设想。
DICOM整体思维导图:
DICOM协议属于开放式系统互联OSI七层模型中的应用层,与我们日常最常用的HTTP协议(HTTP,几乎等同于互联网的代名词,当然由于其安全性问题正在逐渐被HTTPS取代)类似。两者有着诸多相似的地方,想必大家对HTTP协议都有所了解,因此决定通过类比DICOM与HTTP来介绍DICOM协议,让大家快速对DICOM协议有一个宏观的把握。
对比 HTTP DICOM
OSI层 应用层 应用层
数据 HTML文件 .DCM文件
服务 GET、POST、HEAD、PUT
PUT、DELETE、TRACE、CONNECT、OPTIONS C-ECHO、C-FIND、C-STORE、C-MOVE、C-GET
N-GET、N-SET、N-ACTION、N-CREATE、N-DELETE、N-EVENT-REPORT
应用 互联网B/S模式,
也可以用于C/S模式 C/S模式,
也可以用于WADO(B/S模式)
简而言之:将DICOM协议当做是专属于医疗领域的“HTTP”传输协议,常见的HTTP协议是通过上表中的各种服务来实现浏览器与服务器之间HTML格式数据的传输;DICOM协议是通过上表中的各种服务实现了医疗设备与数据中心之间DCM格式数据的传输。
虽然在互联网中经常会混淆HTTP与HTML两个概念(详情可以参考HTTP vs HTML),但从缩写上来看还是比较好区分:一个是网络传输协议(HTTP),一个是数据格式标记语言(HTML),在HTTP协议中发送的正是HTML格式的数据。进入到DICOM领域可能更容易混淆,因为在DICOM领域传输使用的协议和协议上传输的数据都叫做DICOM,一个称之为DICOM协议,一个称之为DICOM图像(即.dcm后缀的文件)。之前HTTP与HTML同属于互联网但是由不同的组织机构制定和发布,而DICOM协议和DICOM数据同时包含在DICOM标准中(最新的标准是DICOM3.0)。
如是,为了更好的学习DICOM标准,按照类似HTTP(协议)和HTML(数据)的方式将DICOM标准进行一个划分。整体的思维导图如下:
DICOM专栏博文分类:
按照以上思维导图的划分方法,将DICOM医学图像处理专栏中的博文对应进行一个简单的分类。大致如下:
DICOM标准介绍篇:
该部分从整体上对DICOM标准进行介绍,此外还会涉及到其他医疗领域的信息化标准,诸如HL7、IHE等,使得读者对DICOM标准有一个整体宏观上的把握。
DICOM医学图像处理:全面分析DICOM3.0标准中的通讯服务模块
DICOM医学图像处理:浅析SWF、WML、SPS、MPPS
DICOM医学图像处理:DICOM网络传输
DICOM:DICOM3.0网络通信协议(续)
DICOM数据篇:
该部分主要以.dcm后缀的文件为目标,即通常所说的医学影像(当然DICOM标准不单单存储二维影像,还可以存储一维的心电数据、动态影像、四维超声/CT等等),介绍文件的常规操作(解析、写入、格式转换)和高级处理(常见的图像处理算法,诸如去噪、增强、分割、融合等等)。
DCMTK开源库类继承结构与DICOM3.0标准元素定义的对应关系图
DCMTK开源库的学习笔记1:将DCM文件保存成BMP文件或数据流(即数组)
DCMTK 开源库的学习笔记2:直接操作dcm文件中像素数据的尝试
DCMTK开源库的学习笔记3:dcmtk文件中数据元的修改
5. DCMTK开源库类继承结构与DICOM3.0标准元素定义的对应关系图
DICOM医学图像处理:Dcmtk与fo-dicom保存文件的不同设计模式之“同步VS异步”+“单线程VS多线程”
DICOM医学图像处理:DICOM存储操作之“多幅BMP图像数据存入DCM文件”
DICOM医学图像处理:DICOM存储操作之 “多幅JPG图像数据存入DCM文件”
DICOM:基于fo-dicom的简易DICOM Viewer
DICOM:Transfer Syntax传输语义之奇葩GE Private TS
DICOM:DICOM三大开源库对比分析之“数据加载”
DICOM协议篇:
该部分以医学设备与数据中心的实际交互为目标,介绍设备与PACS(当然也会涉及到RIS、HIS等系统)之间数据的具体传输,例如常见的Q/R(查询/提取)操作、数据存储操作等等。
DICOM:基于DCMTK实现C-FIND SCU
DICOM医学图像处理:基于DCMTK工具包学习和分析worklist
DICOM医学图像处理:利用fo-dicom发送C-Find查询Worklist
DICOM医学图像处理:storescp.exe与storescu.exe源码剖析,学习C-STORE请求
DICOM医学图形处理:storescp.exe与storescu.exe源码剖析,学习C-STORE请求(续)
DICOM医学图像处理:AETitle在C-FIND和C-MOVE请求中的设置问题
DICOM医学图像处理:fo-dicom网络传输之 C-Echo and C-Store
DICOM医学图像处理:fo-dicom网络传输之C-FIND and C-MOVE
DICOM医学图像处理:DIMSE消息发送与接收“大同小异”之DCMTK fo-dicom mDCM
DICOM:dcmqrscp.exe与storescu.exe中C-STORE服务的差别
DICOM:fo-dicom之C-STORE再分析‘解决System.ObjectDisposedException异常’
DICOM:DICOM Print服务中PresentationContext协商之 MetaSOPClass与SOPClass对比分析
DICOM:DICOM Print 服务详细介绍
DICOM:参考dcm4che2扩展fo-dicom(mDCM)中的UserIdentity字段
DICOM应用篇:
该部分是对DICOM数据篇和DICOM应用篇的实际操作,以DICOM标准为主线,着重介绍各种DICOM开源实现库(包括dcmtk、fo-dicom(mDCM)、dcm4che),以及常见的开源信息系统,诸如Orthanc、ClearCanvas、dcm4chee。
DCMTK开源库的学习笔记4:利用ini配置文件对dcm影像进行归档
Web版PACS开发纪要一:关闭动态库中创建的线程
Web版PACS开发纪要二:解决文件传输数据“丢失”问题
DICOM医学图像处理:DCMTK在VS2012中的配置
DICOM医学图像处理:开源库mDCM与DCMTK的比较分析(一),JPEG无损压缩DCM图像
DICOM医学图像处理:开源库mDCM与DCMTK的比较分析(一),JPEG无损压缩DCM图像(续)
DICOM医学图像处理:DCMTK的wiki资料学习之PACS调试
DICOM医学图像处理:WEB PACS初谈
DICOM医学图像处理:WEB PACS初谈二,图像的传输
DICOM医学图像处理:WEB PACS初谈三,PHP扩展骨架
DICOM医学图像处理:WEB PACS初谈四,PHP DICOM Class
DICOM医学图像处理:Deconstructed PACS之Orthanc
DICOM医学图像处理:Deconstructed PACS之Orthanc,Modification & Anonymization
DICOM医学图像处理:Orthanc Plugin SDK实现WADO服务
DICOM医学图像处理:深入剖析Orthanc的SQLite,了解WADO & RESTful API
DICOM:DCMTK工具包分析之dcmqrscp.exe、dcmqridx.exe、dcmqrti.exe
DICOM:剖析Orthanc中的Web Server, Mongoose
DICOM:剖析Orthanc中的Web Server,Mongoose之“连接请求触发的事件序列”(二)
DICOM:剖析Orthanc中的Web Server,Mongoose之 Flag bit & Event(三)
DICOM:开源DICOM服务框架DCM4CHE构建的准备
DICOM:开源DICOM服务框架DCM4CHE 安装
DICOM:开源DICOM服务框架DCM4CHE 构建
DICOM:再次剖析fo-dicom中DicomService的自定义事件绑定
DICOM:Ubuntu14环境下安装dcm4chee+oviyam2.1
DICOM:dcm4chee奇葩逻辑浅析之UID修改
DICOM:C-GET与C-MOVE对比剖析
DICOM:DICOM万能编辑工具之Sante DICOM Editor
DICOM:dcm4che工具包如何压缩dcm文件探讨(前篇)
DICOM:dcm4che工具包如何压缩dcm文件探讨(续篇)
DICOM:基于JMeter+dcm4che2测试PACS服务器性能的解决方案(前篇)
DICOM:基于JMeter+dcm4che2测试PACS服务器性能的解决方案(续篇)
DICOM翻译篇:
该部分是本人在Github上发起的[DICOM3.0标准中文版开源书籍项目](https://github.com/zssure-thu/DICOM-Chinese),由于目前大多数DICOM相关的资料(如上述思维导图中提到的官方网站、开源论坛)都是英文版,中文资料甚少,因此决定发起该项目,以DICOM标准的中文翻译为基础,介绍并普及医疗领域的信息化技术,关注医疗改革的发展。
DICOM:DICOM3.0标准中文版开源书籍之”本地版本管理方案
DICOM:DICOM3.0标准中文版开源书籍之“git版本库合并
DICOM:DICOM3.0标准中文版开源书籍编辑之”github仓库合并“
DICOM:DICOM3.0标准中文版开源书籍协同编辑之“Github Pull Requests”
DICOM:开源书籍之『DICOM标准中文版』启动计划
PS: 整体博文的分类也可以参考之前总结的一篇DICOM医学图像处理:二零一四▪DICOM专栏一览
备注:
由于DICOM标准复杂,体量很大,因此本博文仅作为DICOM标准学习路线图的初稿,对初学者起到一个简单的引导作用。后续会逐步更新完善,敬请期待!
作者:[email protected]
时间:2015-10-18
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最新上线的DICOMer知识星球:
最专业的医疗技术分享平台,深入浅出介绍医疗领域国际标准DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine),细致分析标准的通信协议DIMSE与数据格式DICOM,实例剖析医学图像处理(Medical Image)、医疗信息化(PACS/LIS/HIS/RIS)、医疗互联网,以及人工智能等领域的应用,主要分为几个栏目:
①DICOM Worldview:DICOM标准解析;
②DiBugs:常见错误汇总与分析;
③DiTools:各种开源DICOM工具介绍;
④DICOM-RT:肿瘤放射治疗领域标准应用;
⑤DICOM-AI:图像处理、机器学习与人工智能在DICOM中的应用以及最新论文讲解;
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