001、 单个删除
(base) [root@pc1 test1]# ls a.fa (base) [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试文件 >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt (base) [root@pc1 test1]# seqkit grep -v -p "chr1" a.fa ## 删除chr1 >chr2 tttgggjjjcccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt
(base) [root@pc1 test1]# ls a.fa (base) [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt (base) [root@pc1 test1]# seqkit grep -v -p "chr2" a.fa ## 删除chr2 >chr1 tttcccggg >chr3 ccc >chr4 aaaaatt
(base) [root@pc1 test1]# ls a.fa (base) [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt (base) [root@pc1 test1]# seqkit grep -v -p "chr4" a.fa ## 删除chr4 >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjjcccjjjjjj >chr3 ccc
002、批量删除
(base) [root@pc1 test1]# ls a.fa rm.list (base) [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt (base) [root@pc1 test1]# cat rm.list ## 删除列表 chr2 chr4 (base) [root@pc1 test1]# seqkit grep -v -f rm.list a.fa ## 删除命令 [INFO] 2 patterns loaded from file >chr1 tttcccggg >chr3 ccc
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