文件映射缺页中断和匿名页面缺页中断主要区别在于缺页时的处理方式和触发原因。
对于文件映射缺页中断，当程序需要访问文件映射的某个页面但该页面尚未调入内存时，就会触发文件映射缺页中断。这时，操作系统会根据文件映射的约定从磁盘加载相应的文件内容到内存中，然后更新页表，使得程序可以继续执行。
而对于匿名页面缺页中断，当程序需要访问匿名页面（不属于具体文件映射的页面，通常是用于堆和栈的页面）且该页面尚未调入内存时，就会触发匿名页面缺页中断。这时，操作系统会为该页面分配物理内存并清零，然后更新页表，使得程序可以继续执行。
可以看出，文件映射缺页中断是由于需要从文件加载页面到内存，而匿名页面缺页中断是由于需要分配新的页面并清零。因此，它们在处理方式和触发原因上有所不同。