Linux命令中有一些常用符号，看到时不一定好查询它们的功能和含义，这里列举一些常见的符号和解释，欢迎大家补充完善。
|: 管道符，在两个相邻命令之间传递数据；如ls | head把ls命令的输出传给head命令，只显示前10个文件/文件夹。
*: 通配符，通常用于匹配任意字符串，如ls *.fq.gz匹配当前目录下所有后缀为.fq.gz的文件，前缀可以是任何字符。
~: 波浪线，指代家目录。键盘左上角ESC下的按键，配合Shift输入。
.: 通常指代当前目录，如./run.sh运行当前目录下的run.sh脚本；multiqc -d . -o multiqc对当前目录下的文件执行multiqc汇总。
../: 表示上一层目录。
>: 输出重定向。ls > filename把ls的输出结果写入文件filename。具体见Linux学习 - 管道、标准输入输出。
<: 输入重定向。paste <(ls *_1.fq.gz) <(ls *_2.fq.gz)把两个ls命令的输出传递给paste作为其输入。具体见Linux学习 - 管道、标准输入输出。
^: 用于正则表达式中表示以什么开头。grep '^>' test.fa获得所有>开头的行，也就是FASTA文件的名字行。sed 's/^>//g'替换开头的>为空，第一个和第二个/之间的为被替换的内容，第二个和第三个/之间的为要被替换成的内容。
注意：grep '>' file和grep > file的区别。可以看看朴实无华的4条致命命令！还有什么。
`: 反引号，键盘左上角ESC下的按键。`ls`表示运行ls命令并捕获其输出。
$(ls): 等同于`ls`，表示运行ls命令并捕获其输出。与把命令括在反引号中基本相似，但更推荐使用。新学习时可直接使用此种方式。
;: 多条语句写在一行需要加分号分割。如 for samp in `tail -n +2 sampleFile | cut -f 1`; do ${samp}_related_things; done 用分号分割开3个语句。循环 `tail -n +2 sampleFile | cut -f 1` 的输出并进行一系列样品相关的操作。
\t: TAB键
\n: 换行
$或${}: 用于获取变量的值。如上面的${samp}。加和不加{}的通常无区别，但在一些情况会导致变量名字识别出错。如${samp}_related_things表示获取变量samp的值，而$samp_related_things表示获取变量samp_related_things的值。
\r 或^M: 回车符; ^M的输入方式是Ctrl+v;Ctrl+m; 通常windows下的文件拷贝到linux系统上，需要执行sed -i s/\r//g file去掉末尾的回车符。
awk中的$0, $1: $0表示整行，$1表示当前行第一列，$2表示当前行第二列，以此类推。
''与""：单引号和双引号通常混用，但双引号中的变量可以获取其值。
&: 把程序放到后台运行，具体见耗时很长的程序忘加nohup就运行了怎么办？章节。
\\: 通常是转义符，把特殊变量转义为普通字符，如${HOME}表示获取家目录，\${HOME}就是一个字符串${HOME}。\\用于行尾时表示该行命令还未结束，后面还有跟随的命令语句，常用于命令太长一行写不下时。
a="a value": 等号用于bash中变量赋值时，前后都不能有空格。
<<: 表示读入数据，具体见Linux学习 - 管道、标准输入输出。
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