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第一题

时间:2022-09-07 16:01:14浏览次数:47  
标签:100k 第一 normal bed tumor window coverage

# 窗口拆分 test.bed 需要修改
bedtools makewindows -g test.bed -w 100000 -s 100000 >> 100k_window.bed
# tumor coverage count
bedtools coverage -a 100k_window.bed -b tumor.bam > tumor.counts.txt
# normal coverage count
bedtools coverage -a 100k_window.bed -b normal.bam > normal.counts.txt

标签:100k,第一,normal,bed,tumor,window,coverage
From: https://www.cnblogs.com/kid-kid/p/16665769.html

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