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Cancer实验系列 | 开篇 | Molecular cloning | 分子克隆

时间:2023-02-24 04:11:07浏览次数:50  
标签:shRNA 系列 Cancer seq cloning 表达 Molecular

 

必须要开这个系列了,而且要对实操有一定的理解,没一篇我都会咨询实验成功过的人士,以确保未来我能带领小弟们做出来。

 

未来要开的系列:

Cancer模型系列:

  • Cell line (DepMap)
  • Mouse (JAX)
  • Organoid
  • Patient sample(非常难)

基础实验系列:

  • WB
  • RT-PCR
  • co-IP

基因表达调控系列:

  • 基因表达调控 - RNAi(shRNA siRNA)
  • 基因表达调控 - CRISPR/Cas9
  • 基因表达调控 - 过表达 CDS
  • 基因表达调控+标记 - Cre/LoxP

NGS系列:

  • RNA-seq
  • ChIP-seq
  • ATAC-seq
  • Cut&Run
  • scRNA-seq
  • scRNA-seq/scATAC-seq
  • Perturb-seq
  • Spatial transcriptome

 

 

目的:

  • 只要是生信和实验,通过in silico或者screening找到了hit,那肯定是要验证的,过表达实验很难,那就down吧,RNAi是首选,所以要把siRNA或者shRNA放进质粒载体,去小鼠或者其Organoid里测试。

 

Molecular cloning refers to the isolation of a DNA sequence from any species (often a gene), and its insertion into a vector for propagation, without alteration of the original DNA sequence.

 

质粒选择:

 

 

参考:

 

标签:shRNA,系列,Cancer,seq,cloning,表达,Molecular
From: https://www.cnblogs.com/leezx/p/17150023.html

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