大家好，我是邓飞，这里介绍一下如何使用Haploview进行单倍型的分析。
计划分为三篇文章：
- 第一篇：Haploview做单倍型教程1–软件安装
- 第二篇：Haploview做单倍型教程2-分析教程
- 第三篇：Haploview做单倍型教程3–结果解读
今天是第一篇。
下面是Haploview做的结果：
下面是LDblockShow做的结果：
两者结果是一致的。
Haploview因为是GUI界面，可以鼠标点点点的形式，所以更简单：
1. 软件下载
官网： https://www.broadinstitute.org/haploview/downloads#JAR
windows系统：
Linux系统：
2. 配置java环境
https://www.java.com/zh-CN/download/
下载安装好之后，在终端运行java，出现帮助文档，说明配置成功。
2.1 windows系统
cmd终端打开，键入java，出现下面界面，说明配置成功。
2.2 Linux系统
终端打开，键入java，出现下面界面，说明配置成功。
3. windows安装
安装好之后，打开HaploView软件：
打开软件：
4. Linux安装
终端下，键入命令：
java -jar Haploview.jar
出现界面：
上面就是搞定了软件的安装。
下一篇介绍一下数据分析实操方法。
下下一篇介绍Haploview结果如何解读及如何微调结果。
欢迎继续关注。