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Linux 中 shell 脚本实现根据gff统计每一个基因的转录本数目

时间:2023-05-16 22:48:14浏览次数:34  
标签:shell 基因 NF Linux gene gff

 

001、生成基因名称的列表

awk -F "\t" '$3 == "gene" && $NF ~ /gene=/ {print $NF}' chr1.gff | sed 's/\(.*\)\(gene=[^;]\+\)\(.*\)/\2/' | sort | uniq > gene.list

 

002、

 

标签:shell,基因,NF,Linux,gene,gff
From: https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/17407086.html

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