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利用Biopython – Pairwise Alignment计算序列相似度

时间:2023-11-13 11:12:59浏览次数:40  
标签:Bio Seq Biopython Pairwise match import Alignment

# Import libraries
from Bio import pairwise2
from Bio.Seq import Seq

# Creating sample sequences
seq1 = Seq("TGTGACTA")
seq2 = Seq("CATGGTCA")

# Finding similarities
alignments = pairwise2.align.globalxx(seq1, seq2)

# Showing results
for match in alignments:
print(match)

 

转自:https://blog.csdn.net/caihaihua0572/article/details/128528750

标签:Bio,Seq,Biopython,Pairwise,match,import,Alignment
From: https://www.cnblogs.com/lajf/p/17828693.html

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