• 2024-07-11在linux服务器上搭建slurm集群部署
    在Linux服务器上搭建Slurm集群部署是一个涉及多个步骤和组件配置的过程。Slurm是一个面向Linux和Unix的开源作业调度程序,广泛用于高性能计算环境。一、环境准备选择服务器和硬件设备:选择合适的服务器和硬件设备,建议选用多核心、大内存、高速硬盘的服务器以满足高性能计算的需求
  • 2024-02-15slurm初步使用
    先使用脚本.sh1#!/bin/bash2#SBATCH--job-name=test3#SBATCH-pamd_2564#SBATCH--error=log/%J.err5#作业运行的标准错误输出将写到文件log/[JOBID].err文件中6#SBATCH--output=log/%J.out7#作业运行的标准输出将写到文件log/[JOBID].out文件中8
  • 2024-01-16升级slurm,从18.08到23.02
    前言本笔记是大致流程,给有一定管理经验的slurmcluster管理员参考,还是建议大家少折腾。环境CentOS7,openHPC1.3.9全家桶(附带slurm18.08),xcat集群管理(没有xcat的话,用for循环ssh代替psh和pscp)slurm版本Slurm最近的大版本如下(年.月)18.08,19.05,20.02,20.11,21.08,22.05,2
  • 2023-12-05使用Slurm集群进行分布式图计算:对Github网络影响力的系统分析
    本文分享自华为云社区《基于Slurm集群的分布式图计算应用实践:Github协作网络影响力分析》,作者:yd_263841138。1.引言Slurm(SimpleLinuxUtilityforResourceManagement)是一个针对小型Linux集群的开源、容错、高可扩展的集群管理及作业调度系统,它具备统一管理集群内的计算资源
  • 2023-10-04samtools线程数对 sam文件转换为bam文件效率的影响
     001、(base)[b20223040323@admin1batch_test02]$ls##测试sam文件template.slurmtest.sam(base)[b20223040323@admin1batch_test02]$cattemplate.slurm##测试模板#!/bin/bash#SBATCH-Jxxxx#SBATCH-pCnode2##SBATCH-o%j.xxxx.r
  • 2023-08-09Slurm和K8S
     1、观点差异K8s专为管理长时间运行的流程而构建的      协调多个微服务,扩展、管理可用性,通常支持一个或多个web服务云原生系统假设有"infinite"可用资源        优先级不是云编排的核心,体现在调度语义上,"Affinity"与"Anti-Affinity"设置不能
  • 2023-08-03slurm 不支持--share 选项-解决方法
    提交脚本含有--share的会报错,反复安装slurm尝试都失败sbatchslurm_scriptsbatch:unrecognizedoption'--share'Try"sbatch--help"formoreinformation 结果是:slurm自从14.0后就不支持share了,改用--oversubscribe,这样就允许一个节点同
  • 2023-07-25Slurm 测试环境配置
    Slurm测试环境配置1.机器规划Host:HPC_Slurm_Main:192.168.141.135Clients:HPC_Slurm_Client01:192.168.141.136HPC_Slurm_Client02:192.168.141.137HPC_Slurm_Client03:192.168.141.1382.修改主机名 /etc/hosts, /etc/hostname192.168.141.136 node1-nfs192.168.141.137
  • 2023-04-16Slurm执行的CPU管理步骤
    Slurm使用四个基本步骤来管理一个job/step的CPU资源:步骤1:节点选择Slurm选择向作业或作业步骤分配CPU资源的节点集。节点选择受到许多控制CPU分配的配置和命令行选项的影响(下面的步骤2)。如果配置了SelectType=select/linear,则所选节点上的所有资源都将分配给job/step。如果Selec
  • 2023-04-09谁在使用SLURM
    Slurm在世界上许多最强大的计算机上提供工作负载管理。在2013年11月的Top500榜单上,排名前十的系统中有五个使用Slurm,包括排名第一的系统。仅这五个系统就包含超过570万个核心。下面列出了一些使用Slurm的系统:天河二号由中国国防科技大学(NUDT)设计,拥有16000个节点,每个节点配备2
  • 2023-04-06源码安装slurm
    一、源码安装munge1、下载munge下载地址:https://github.com/dun/munge/releases2、安装编译 tar-Jxvfmunge-0.5.15.tar.xz./bootstrap./configure--prefix=/usr/local/munge\--sysconfdir=/usr/local/munge/etc\--localstatedir=/usr/local/munge/local\--with-
  • 2023-03-05Slurm的命令
    sacct用于报告有关活动或已完成作业的作业或作业步的记账信息。salloc用于实时为作业分配资源。通常用于分配资源和生成shell。然后使用shell执行srun命令来启动并行
  • 2022-12-08Reason=Low socket*core*thread count, Low CPUs [slurm@2021-09-15T15:18:53]
    提交作业:#srunhostnamesrun:Requirednodenotavailable(down,drainedorreserved)srun:job58queuedandwaitingforresources查看作业状态:squeue58compute
  • 2022-09-21个人超级计算机
     这篇文章是回答一位用户的问题。问:站长,我是一个在读研究生,正在学习分布式计算、高性能集群计算方面的知识,Laxcus分布式操作系统也是我的学习模板之一,但是我发现,无论是