• 2024-09-03文献解读- Genome-wide imputation using the practical haplotype graph in the heterozygous crop cassava
    关键词:农业;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Genome-wideimputationusingthepracticalhaplotypegraphintheheterozygouscropcassava标题(中文):使用杂合作物木薯中的实用单倍型图进行全基因组插补发表期刊:G3作者单位:康奈尔大学等发表年份:2021文章地址:https://doi.org/10.10
  • 2023-08-23基因组大数据计算: CPU和GPU加速方案深度评测
    随着NGS测序通量的大幅提高,搭配高效NGS二级分析技术的精准解决方案快速融进基因组学的各个应用领域:遗传进化、临床诊断、分子育种、医药开发等。以下我们通过对基于CPU和GPU不同硬件平台的NGS二级分析方案进行详细评测,以期为基因组学研究领域的用户提供参考。Sentieon软件是面向CPU
  • 2023-07-14Sentieon | 每周文献-Epidemiology-第五期
    流行病学系列文章-1标题(英文):RareVariantsinInbornErrorsofImmunityGenesAssociatedWithCovid-19Severity标题(中文):与Covid-19严重程度相关的免疫基因先天性缺陷的罕见变异发表期刊:《FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology》作者单位:华大基因
  • 2023-07-05Sentieon | 每周文献-Agrigenomics-第四期
    农业系列文章-1标题(英文):Genomicfootprintsofsorghumdomesticationandbreedingselectionformultipleenduses标题(中文):高粱驯化的基因组足迹和多种最终用途的育种选择发表期刊:《MolecularPlant》作者单位:中国科学院植物研究所植物资源重点实验室等发表
  • 2023-07-05Sentieon | 每周文献-Genetic Disease-第二期
    遗传病系列文章-1标题(英文):AnswerALS,alarge-scaleresourceforsporadicandfamilialALScombiningclinicalandmulti-omicsdatafrominducedpluripotentcelllines标题(中文):AnswerALS,一种用于散发性和家族性ALS的大规模资源,结合了来自诱导多能细胞系的临床和多
  • 2023-07-05Sentieon | 每周文献-Population Sequencing-第一期
    群体基因组系列文章-1标题(英文):TheImpactofACEsonBMI:AnInvestigationoftheGenotype-EnvironmentEffectsofBMI标题(中文):ACEs对BMI的影响:探究BMI的基因型-环境效应发表期刊:BehaviorGenetics作者单位:美国俄勒冈州立大学心理学系发表年份:2022文章地址:https://doi.
  • 2023-07-05Sentieon实战:NGS肿瘤变异检测流程
      肿瘤基因突变检测是NGS的一个重要应用,其分析难点主要在于低频变异的准确性。不同于遗传病检测,肿瘤样本类型多样,测序方法和参数复杂,且缺乏对应各种场景的公共标准真集。再加上常用开源软件经常遇到的准确性低,稳定性差,速度慢等问题。这使得广大诊断公司在评估肿瘤变异检测工具
  • 2023-07-05加速体细胞突变检测分析流程-系列2(ctDNA等高深度样本)
    Sentieon●体细胞变异检测系列-2  Sentieon致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈,通过算法的深度优化和企业级的软件工程,大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。 针对体细胞变异检测,Sentieon软件提供两个模块:TNscope和TNhaplotyer2。 TNscope:此模
  • 2023-07-05体细胞突变检测分析流程-系列1( WES&Panel)
    Sentieon●体细胞变异检测-系列1 Sentieon致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈,通过算法的深度优化和企业级的软件工程,大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。 针对体细胞变异检测,Sentieon软件提供两个模块:TNscope和TNhaplotyer2。 TNscope:此模块
  • 2023-07-05Sentieon | 每周文献-Tumor Sequencing-第三期
     肿瘤测序系列文章-1标题(英文):Therelationshipbetweengeneticcharacteristicsandclinicalcharacteristicsandtheefficacyof 131Itherapyinchildrenandadolescentswithlocallyadvancedormetastaticdifferentiatedthyroidcancer标题(中文):局部晚期或
  • 2023-04-16毅硕科技携手Sentieon独家赞助第21届亚太生物信息学大会(APBC 2023)
    APBC介绍亚太生物信息学大会(AsiaPacificBioinformaticsConference,APBC)是一年一度的行业国际盛会,汇聚区域间生物信息学领域的学者、研究人员和产业领导者,共同探讨生物信息学领域的研究进展、技术发展和应用创新。自2003年开始,APBC在亚太地区已成功举办20届。APBC的主要目标
  • 2023-01-06Hap-Eval:Sentieon团队开发的开源结构变异SV准确率评估工具
    Sentieon开发的Hap-eval准确率评估工具在设计之初就考虑到了复杂以及重复的基因组区域,采用了基于单倍型拼接序列的矩阵比较模式,兼容包括PacBio和ONT在内的主流三代长读长测
  • 2022-12-07基因组大数据计算:CPU和GPU加速方案深度评测
    随着NGS测序通量的大幅提高,搭配高效NGS二级分析技术的精准解决方案快速融进基因组学的各个应用领域:遗传进化、临床诊断、分子育种、医药开发等。以下我们通过对基