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pysam
2024-06-15
VCF文件的genotype(GT)为何会出现".",而非常见的./.或.|.
今天处理一个客户的基因型数据,遇到了一个格式转化的问题。我想将标准vcf转为某特定格式(类hapmap),之前基于pysam库写了一个比较成熟的脚本,运行了n年都没问题。但这次出错如下:a,b=v['GT']ValueError:notenoughvaluestounpack(expected2,got1)如果你直接去网上搜