1.用tassel将VCF文件转换为phylip格式run_pipeline.pl-Xmx10G-importGuessyour.vcf-ExportPlugin-saveAsyour.phy-formatPhylip_Inter#run_pipeline.pl是tassel里的一个程序#vcf文件应该只包含SNP信息，不能有indel信息，因为INDEL位点在转换为phy文件时，会变成-或者0，这

 001、测试数据转换为vcf格式[root@PC1test]#lstest.maptest.ped[root@PC1test]#plink--filetest--recodevcf-iid--outtest   002、将vcf转为p

 001、软件下载：     下载地址    [root@PC1phylip]#wgethttps://evolution.gs.washington.edu/phylip/download/phylip-3.697.tar.gz[root@PC1

 001、软件下载，github            [root@PC1phylip]#wgethttps://github.com/edgardomortiz/vcf2phylip/archive/refs/tags/v2.8.tar.