- 2024-11-06Differential motif enrichment | CentriMo | meme
两个peakset的motif差异富集网页版更好用:https://meme-suite.org/meme/tools/centrimo命令行需要准备文件,比较复杂。 wgethttps://jaspar.elixir.no/download/data/2024/CORE/JASPAR2024_CORE_vertebrates_non-redundant_pfms_meme.txtln-s/home/zz950/reference/refda
- 2024-07-01课前准备---多样本ATAC联合分析(封装版)
作者,EvilGenius大家好,我们的课程已经在进行中了,需要分享给大家很多的分析资料,大家好好学习,资料很珍贵,好好保存。ATAC的主流分析内容1)Readfilteringandalignment2)Barcodecounting3)Identificationoftransposasecutsites4)Detectionofaccessiblechromatinpeaks
- 2024-04-15易基因:ENCODE和modENCODE联盟的ChIP-seq实验设计指南和注意事项|干货
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。ChIP-seq(染色质免疫沉淀测序)实验指南和实践(ChIP-seqguidelinesandpracticesoftheENCODEandmodENCODEconsortia),由ENCODE(EncyclopediaofDNAElements)和modENCODE(ModelOrganismENCODE)联盟研究人员撰写。文
- 2024-04-10Peaks:每周至少要进行一次用户访谈?
名字:Peaks开发者/团队:VogelhausAppsGmbH平台:iOS、watchOS请简要介绍下这款产品每个人生活的节奏都有一个内置的生理时钟,这就是所谓的昼夜节律。它不仅控制着我们何时感到疲倦或者精力旺盛,更加深远的意义在于,理解自己的昼夜节律可以帮助你发挥身体的最大潜能,从而让你更高
- 2024-03-01LeetCode 2345. Finding the Number of Visible Mountains
原题链接在这里:https://leetcode.com/problems/finding-the-number-of-visible-mountains/description/题目:Youaregivena 0-indexed 2Dintegerarray peaks where peaks[i]=[xi,yi] statesthatmountain i hasapeakatcoordinates (xi,yi).Amountaincan
- 2024-01-24【题解 P4197】 Peaks
Peaks题目描述在Bytemountains有\(n\)座山峰,每座山峰有他的高度\(h_i\)。有些山峰之间有双向道路相连,共\(m\)条路径,每条路径有一个困难值,这个值越大表示越难走。现在有\(q\)组询问,每组询问询问从点\(v\)开始只经过困难值小于等于\(x\)的路径所能到达的山峰中第\(
- 2024-01-24基于 pytorch-openpose 实现 “多目标” 人体姿态估计
前言还记得上次通过MediaPipe估计人体姿态关键点驱动3D角色模型,虽然节省了动作K帧时间,但是网上还有一种似乎更方便的方法。MagicAnimate就是其一,说是只要提供一张人物图片和一段动作视频(舞蹈武术等),就可以完成图片人物转视频。于是我就去官网体验了一下,发现动作的视频
- 2023-11-30易基因:人精子H3K4me3 ChIP-seq和DNA甲基化WGBS揭示与生育和发育相关重叠区域
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。目前,六分之一的夫妇患有不孕不育,其中多达一半的病例由男性因素引起,在过去的40年中,精子数量下降了50%。尽管导致精子质量和数量下降的因素知之甚少,但环境-表观基因组相互作用是可能的。暴露于有毒物质、饮食和BMI升
- 2023-08-19P4197 Peaks 题解
P4197Peaks题解题目描述在Bytemountains有\(n\)座山峰,每座山峰有他的高度\(h_i\)。有些山峰之间有双向道路相连,共\(m\)条路径,每条路径有一个困难值,这个值越大表示越难走。现在有\(q\)组询问,每组询问询问从点\(v\)开始只经过困难值小于等于\(x\)的路径所能到达的
- 2023-06-21【算法】编写一个函数,返回数字数组的“峰值”(或局部最大值)的位置和值。
编写一个函数,返回数字数组的“峰值”(或局部最大值)的位置和值。例如,数组arr=[0,1,2,5,1,0]在位置3处具有值为5的峰值(因为arr[3]等于5)。输出将以Dictionary<string,List<int>的形式返回,其中包含两个键值对:“pos”和“peaks”。如果给定的数组中没有峰值,只需返回{“pos”=>newList<int>(),“pea
- 2023-03-31基于matlab的高精度信号峰值检测算法
1.算法描述 峰值检验是示波表中数据采集方式之一,这种技术起源于存储深度不能满足捕获毛刺的需要。如果用模拟示波器去观察,只有当毛刺信号是重复性的并且和主信号同步时,才能看到毛刺信号。由于毛刺源于其他电路系统,所以这些毛刺只是偶尔发生,并且和主信号
- 2023-03-22ChIP-seq 分析:Differential Peaks(15)
动动发财的小手,点个赞吧!1.寻找差异区域然而,识别特定于细胞系或条件的峰并不能捕获表观遗传事件的全部变化。为了识别表观遗传事件的差异,我们可以尝试量化IP样本中非
- 2023-03-03ChIP-seq 分析:数据与Peak 基因注释(10)
动动发财的小手,点个赞吧!1.数据今天,我们将继续回顾我们在上一次中研究的MycChIPseq。这包括用于MEL和Ch12细胞系的MycChIPseq。可在此处找到MEL细胞系中Myc