文章目录1.跟着官网下载2.跟着官网的样例做对接1.导航到配体文件夹2.准备受体2.1先导航到蛋白受体文件夹2.2下载3BLP的pdb文件并用clean_pdb.py脚本预处理蛋白质2.3把处理好的蛋白放到docking文件夹3.准备配体参数3.1导航到ligand_prep3.2配体文件3.分析

ghidra---配置获取加载pdb文件在不配置"SymbolServerConfig"的情况下，如果自己有pdb文件且和可执行程序在同一文件夹下，ghidra会自动加载相应pdb文件。分析Windows自身的可执行程序时，如果可以获取微软提供的符号文件，可以极大提高分析效率。打开一个可执行程序，界面操作Edit->

 Oracle19c通过cdb的servicename连接后为pdb库 现在数据库版本为19.19，库名为oemdb，有1个容器数据库pdb为empdbrepos，如下：[oracle@oem13c~]$sqlplus/assysdbaSQL*Plus:Release19.0.0.0.0-ProductiononThuSep1909:34:512024Version19.19.0.0.0......09:

问题描述：开启PDB时报错ORA-00800、ORA-65054，如下所示：数据库信息：账务库备库1节点IP：192.168.133.183实例名：tmis1版本：oracle19.201、告警信息2024-09-10T22:19:44.336563+08:00Errorsinfile/u01/app/oracle/diag/rdbms/tmisdg/tmis1/trace/tmis1_vktm_152164.trc(inciden

拆分对接结果vina_split--inputresult.pdbqt--ligandcomplex/lig使用mv命令批量修改文件名，把01-09修改成1-9，便于批量处理foriin`seq19`;do>mv"lig0${i}.pdbqt""lig${i}.pdbqt">done使用Openbabel把pdbqt转成pdbforiin`seq120`;do>obabel

在你的代码中，DDG代表蛋白质复合物在某种突变下的自由能差异（ΔΔG）。这个值通常用于预测蛋白质突变对其稳定性或结合自由能的影响。在生物化学中，ΔΔG是一种非常重要的指标，用于评估突变是否会使蛋白质更加稳定或不稳定。模型的工作流程ComplexEncoder类:该类用于编码蛋白质

一、将文件放入到数据库#include<stdio.h>#include<sqlite3.h>#include<sys/types.h>#include<sys/stat.h>#include<fcntl.h>#include<string.h>#include<unistd.h>intmain(intagrc,char*agrv[]){FILE*fp;fp=fo

sqlits3数据库名，创建一个数据库，并打开，有点像vim.headerson  .modecolumn可以让输出的更美观一点  //打开一个数据库文件  ret=sqlite3_open("student.db",&pDb);  if(ret!=SQLITE_OK){    fprintf(stderr,"sqlite3_openfailed!:%s\n",

 默认设置下，publish出来的文件其实是包含很多的pdb文件，即使你过程当中选择的是“输出为单一文件”： 想要设置为publish的时候不输出，有三种方法（推荐第三种）：1.直接改项目的配置文件的配置：2.直接改Web项目的publish的文件的配置：在最终的Startup的项目（比如是Web）的publish配

这条数据看起来是描述一个抗体-抗原复合物（来自PDB的6BKD结构）的详细信息，包括链的编号、序列、CDR区域等。以下是对每个字段的详细解释：总体结构pdb:"6bkd"PDBID，是一个四位字母代码，用于标识蛋白质数据库（PDB）中的一个特定的结构。这条数据描述的是PDBID为6bkd的结构。he

本文主要介绍SQLite库的一些核心API函数，和实现数据库增删查改功能的C语言示例程序代码。目录1.API函数原型1.1sqlite3_open1.2sqlite3_close1.3sqlite3_free1.4sqlite3_errmsg1.5sqlite3_exec1.6sqlite3_get_table1.7sqlite3_free_table2.返回码定义3.示

目录1、dump文件1.1、dump文件的生成方式1.2、dump文件的大小2、pdb符号文件2.1、pdb文件的路径设置2.2、pdb文件的时间戳与名称问题2.3、如何确定要找哪些pdb文件？3、使用Windbg静态分析dump文件以及动态调试程序的一般步骤4、确定发生异常或崩溃的业务模块，到业务模块

#!/bin/bash#配置变量ORACLE_SID=CDBORACLE_HOME=/u01/app/oracle/product/19c/dbhome_1PATH=$ORACLE_HOME/bin:$PATHexportORACLE_SIDORACLE_HOMEPATH#数据库登录信息DB_USER=lcsdbDB_PASS=123456PDB_NAME=FS3_LCS#输出文件OUTPUT_DIR=/path/to/output/dire

软件支持SPONGE（SimulationPackagetOwardNextGEnerationmolecularmodelling）是由北京大学高毅勤课题组开发的分子动力学模拟程序。安装教程XPONGE使用python编写的分子动力学模拟前后处理工具。简易安装：pipinstallgit+https://gitee.com/gao_hyp_xyj_admin/xponge.gitDS

Pod驱逐场景总结从一个SRE角度看，Pod驱逐分为两种情况：较安全驱逐&提高稳定性的良性驱逐API发起驱逐，典型案例：kubectldrainNodeNotReady时，ControllerManager发起的驱逐有风险的驱逐节点压力驱逐节点磁盘空间不足、内存不足或Pid不足，kubelet发起驱逐

技术背景关于拉氏图的更多介绍，可以参考下这篇博客，这里简单引述一部分内容：Ramachandranplot（拉氏图）是由G.N.Ramachandran等人于1963年开发的，用来描述蛋白质结构中氨基酸残基二面角\(\psi\)和\(\phi\)是否在合理区域的一种可视化方法。同时也可以反映出该蛋白质的构象是否合理

本文分享自华为云社区《【GaussTech速递】技术解读之GaussDB多租技术》，作者：GaussDB数据库。数据库多租技术介绍随着云计算时代的到来，多租户的概念也逐渐广为人知。“多租户”使得租户之间可以共享物理资源，能够帮助用户节约硬件成本和运维成本，提高资源利用效率。同时，在实现的过程

基于docker的oracle12.2.0.1部署及oracle使用与docker镜像容器制作迁移方法本文介绍了基于docker的oracle12.2.0.1部署，包含了oracle基本配置、监听器和实例启动方法、PDB和CDB操作方法、表空间建立和用户数据库建立、常见启动问题解决等，并介绍了镜像制作、镜像打包、镜像迁移

TableofContents1.现象2.分析3.处理1.现象当用户登录时，提示如下信息:ERROR:ORA-01035:ORACLEonlyavailabletouserswithRESTRICTEDSESSIONprivilege此报错的意思是只有拥有登录restrict实现的权限的用户才可以执行登录操作。也就是说，登录的pdb

切换到PDB：使用ALTERSESSIONSETCONTAINER语句切换到PDB，如下所示：ALTERSESSIONSETCONTAINER=PDB;确保密码策略允许永不过期：ALTERPROFILEDEFAULTLIMITPASSWORD_LIFE_TIMEUNLIMITED;这个命令会将默认配置修改为密码永不过期。然后，将用户的密码设为过期并立即修

问题：VS在调试程序的时间，出现单独一个报错页面：未加载mscorlib.pdbmscorlib.pdb包含查找模块mscorlib.dll的源文件所需的调试信息解决方法：点击调试=>选项=>调试=>勾选：常规点击启用我的代码=》勾选：启用时若没有用户代码则发出警告（仅限托管）参考：https://www.cnblogs.com/Can-da

Python并行编程秘籍（五）原文：zh.annas-archive.org/md5/e472b7edae31215ac8e4e5f1e5748012译者：飞龙协议：CCBY-NC-SA4.0第九章：调试阶段这最后一章将介绍两个重要的软件工程主题——调试和测试，这是软件开发过程中的重要步骤。本章的第一部分专注于代码调试。错误是程序中的错

前言本文的主题是VisualStudio调试NuGet包,以及符号包的概念，如何去发布一个NuGet包，让我们的NuGet包支持SouceLink，这些都是我们开发中比较容易忽视的内容，但是熟悉了以后可以让我们在调试中得心应手，也是开源项目开发的基础篇。demo源代码在文末pdb符号文件程序数

由于c++std::exception在windbg里面调用堆栈显示不正确，可以通过加载了系统pdb和软件pdb后，!analyze-v可以分析出来，所有需要配置系统pdb。1、把exe，pdb放到同一个目录下。2、加载dmp文件（拖动dmp文件到windbg）。3、设置pdb路径：File->SymbolFilePath，比如D:\Desktop\3dLayer，记得加

 1.静态检查windbg调试工具包中有一个工具symchk.exe,选项很多,下面一个简单的用法可以检查一个test.exe能不能找到与它匹配的PDB:  这是成功的情形.下面来个失败的作为对比: 2.如果已经在windbg内部,可以通过下面的命令检查  最后一行说MATCH,肯定没问