技术背景关于增强采样（EnhancedSampling）算法的具体原理，这里暂不做具体介绍，感兴趣的童鞋可以直接参考下这篇综述文章：Enhancedsamplinginmoleculardynamics。大致的作用就是，通过统计力学的方法，使得目标分子的CV（CollectiveVariables）具有一个尽可能大的采样子空间，并且可以将其还

技术背景在前面的MindSponge教程系列博客中，我们已经介绍过MindSponge分子动力学模拟框架的基础功能使用方法，例如MindSponge的安装与使用、定义分子系统、计算单点能和迭代器等等。这些模块和功能，更多的是凭借MindSpore深度学习框架的自动微分、GPU加速和Python语言的灵活性，而本文

技术背景分子动力学模拟中的控制器（Controller）可以被用于修改模拟过程中的原子坐标和原子速度等参量，从而达到控制系统特定参量的目的。例如控温器可以用于实现NVT系综，控压器可用于实现NPT系综。而在MindSponge分子动力学模拟框架下，控温控压都可以基于控制器Controller来实现。关于

技术背景在MindSponge教程合集中我们已经介绍了很多使用MindSponge进行分子动力学模拟的方法，这里主要介绍在MindSponge中自定义一个力场。在传统的MD软件中，如果你希望去开发一个自己的力场，或者是添加一些分子动力学模拟方法如增强采样等，会面临不少编程上的困难。而这些困难对于使

技术背景在前面的几篇博客中，我们介绍了MindSponge分子动力学模拟框架的基本安装和使用和MindSponge执行分子动力学模拟任务的方法。这里我们介绍一个在增强采样领域非常常用的工具：CollectiveVariable（CV），或者我们也可以直接称呼其为一个物理量。因为像化学反应或者是蛋白质折叠等

解决Python编程中可能出现的“段错误（核心已转储）”，并没有其他任何提示信息的问题。技术背景在各种编程语言中都有可能会遇到这样一个报错：“段错误(核心已转储)”。显然是编写代码的过程中有哪里出现了问题，但是这个报错除了这几个字以外没有任何的信息，我们甚至不知道

技术背景在各种编程语言中都有可能会遇到这样一个报错：“段错误(核心已转储)”。显然是编写代码的过程中有哪里出现了问题，但是这个报错除了这几个字以外没有任何的信息，我们甚至不知道是哪一行的代码出现了这个问题。解决方案在python中可以引用一个faulthandler的函数，就可以显

技术背景在前面的几篇博客中，我们已经介绍了MindSponge的基本使用方法，比如定义一个分子系统、计算分子的单点能以及迭代器的使用等。有了这些基础的教程，用户以及可以执行一些比较简单的模拟任务，比如可以跑一个能量极小化，或者是NVT过程。当我们去执行一个模拟任务时，比较关键的一个

技术背景在前面两篇文章中，我们分别介绍了分子动力学模拟软件MindSponge的软件架构和安装与使用教程。这里我们进入到实用化阶段，假定大家都已经在本地部署好了基于MindSpore的MindSponge的编程环境，开始用MindSponge去做一些真正的分子模拟的工作。那么分子模拟的第一步，我们就需要