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编程问答
dyMEAN
2024-12-26
dymean 维度
Letmehelpanalyzetheresiduepositionembeddingfromthecode.LookingattheAminoAcidEmbeddingclassinthefirstfile,therearetwooptionsforpositionembeddings:RelativePositionEmbedding:ifrelative_position:self.res_pos_embedding=S
2024-11-26
dymean-structure损失总结
在full_profile=False的情况下,整体的损失函数会简化为以下内容:1.总Loss当full_profile=False时,总的损失函数为:\(\text{loss}=\text{xloss}+\text{violation_loss},\)其中:\(\text{violation_loss}=\text{bond_loss}+\text{sc_bond_loss}.\)2.各部分的具