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deepvariant
2025-01-12
生信技能69 - 使用deepvariant对基因组指定区域Calling SNPs/Indels
基于比对排序去除重复后的BAM文件,使用deepvariant进行Calling变异,可指定基因组区域(染色体编号:开始位置-结束位置格式),docker封装,适用于CallingSNPs/Indels及基于VCF的基因分型等,在输出目录生成VCF文件。1.deepvariant分析示例参数1:工作分型的目录(变异VCF文件输出的目录