全文链接：https://tecdat.cn/?p=38800原文出处：拓端数据部落公众号在生物医学领域，探究可遗传性状的遗传基础是关键挑战之一。对于受多基因位点多因素控制的性状，准确检测其关联存在诸多困难，且易受群体结构等混杂因素影响产生假阳性结果。本文帮助客户建立Lasso线性混合模型，它能实现

基于比对排序去除重复后的BAM文件，使用deepvariant进行Calling变异，可指定基因组区域（染色体编号：开始位置-结束位置格式），docker封装，适用于CallingSNPs/Indels及基于VCF的基因分型等，在输出目录生成VCF文件。1.deepvariant分析示例参数1：工作分型的目录（变异VCF文件输出的目录