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QTL
2024-06-16
尘封在文件夹中的GWAS和QTL定位的古老笔记
longlongago,小野记录了关于重测序基因定位和GWAS相关的笔记。打开古老的文件夹,发现有些东西依然不过时,零零散散,随意发布。QTL定位策略:群体类型:作图群体,自然群体选材策略:全群个体分析,选择基因型分析,混合分组分析优点:适合稀有基因研究;群体可控,目的性和结果预期性强缺点:需
2024-06-16
针对F1和F3群体的基因定位新方法
最近国人有几个新的基因定位方法发表,记录下备忘。MolPlant|中国农科院蔬菜所开发异交物种基因高效定位的新算法工具OcBSA经典的基因位点快速定位方法BulkedSegregantAnalysis(BSA,集群分离分析法)具有适用范围广、实验成本低的优势,但现有BSA算法(例如SNPindex,ED,Gvalue)均是基