PDB
  • 2024-10-21使用pdb进行detr3d代码走读(一)
    花了一天在新pc上调通了mmdetection3d和detr3d的代码环境_mmdetectiondetr3d-CSDN博客书接上文结合bashtools/dist_test.shprojects/DETR3D/configs/detr3d_r101_gridmask.py~/Downloads/detr3d_r101_gridmask.pth1入口应该是然后打断点进去阅读一下:进入main函数之
  • 2024-10-03python多进程debug
    代码调试问题阐述最近遇到一个pythondebug多进程的问题有一个进程A,这个进程会fork出8个进程B,forkjoin结束后,又会fork出8个进程A。假设按时间有序,我就只想断fork出的第一个B和第一个进程A,怎么做?(breakpointjustbreakonlyonce)类似于java多线程调试的意思,只断一个线程,all-
  • 2024-09-22Rosetta 二:手把手教你用Rosetta的全局对接模块
    文章目录1.跟着官网下载2.跟着官网的样例做对接1.导航到配体文件夹2.准备受体2.1先导航到蛋白受体文件夹2.2下载3BLP的pdb文件并用clean_pdb.py脚本预处理蛋白质2.3把处理好的蛋白放到docking文件夹3.准备配体参数3.1导航到ligand_prep3.2配体文件3.分析
  • 2024-09-21ghidra---配置获取加载pdb文件
    ghidra---配置获取加载pdb文件在不配置"SymbolServerConfig"的情况下,如果自己有pdb文件且和可执行程序在同一文件夹下,ghidra会自动加载相应pdb文件。分析Windows自身的可执行程序时,如果可以获取微软提供的符号文件,可以极大提高分析效率。打开一个可执行程序,界面操作Edit->
  • 2024-09-19Oracle 19c通过cdb的service name连接后为pdb库
     Oracle19c通过cdb的servicename连接后为pdb库 现在数据库版本为19.19,库名为oemdb,有1个容器数据库pdb为empdbrepos,如下:[oracle@oem13c~]$sqlplus/assysdbaSQL*Plus:Release19.0.0.0.0-ProductiononThuSep1909:34:512024Version19.19.0.0.0......09:
  • 2024-09-12开启PDB时报错ORA-00800、ORA-65054
    问题描述:开启PDB时报错ORA-00800、ORA-65054,如下所示:数据库信息:账务库备库1节点IP:192.168.133.183实例名:tmis1版本:oracle19.201、告警信息2024-09-10T22:19:44.336563+08:00Errorsinfile/u01/app/oracle/diag/rdbms/tmisdg/tmis1/trace/tmis1_vktm_152164.trc(inciden
  • 2024-08-31autodock vina后处理分析
    拆分对接结果vina_split--inputresult.pdbqt--ligandcomplex/lig使用mv命令批量修改文件名,把01-09修改成1-9,便于批量处理foriin`seq19`;do>mv"lig0${i}.pdbqt""lig${i}.pdbqt">done使用Openbabel把pdbqt转成pdbforiin`seq120`;do>obabel
  • 2024-08-30ΔΔG 值
    在你的代码中,DDG代表蛋白质复合物在某种突变下的自由能差异(ΔΔG)。这个值通常用于预测蛋白质突变对其稳定性或结合自由能的影响。在生物化学中,ΔΔG是一种非常重要的指标,用于评估突变是否会使蛋白质更加稳定或不稳定。模型的工作流程ComplexEncoder类:该类用于编码蛋白质
  • 2024-08-29字典查找对应输入的字符
    一、将文件放入到数据库#include<stdio.h>#include<sqlite3.h>#include<sys/types.h>#include<sys/stat.h>#include<fcntl.h>#include<string.h>#include<unistd.h>intmain(intagrc,char*agrv[]){FILE*fp;fp=fo
  • 2024-08-28sqlite3数据库
    sqlits3数据库名,创建一个数据库,并打开,有点像vim.headerson  .modecolumn可以让输出的更美观一点  //打开一个数据库文件  ret=sqlite3_open("student.db",&pDb);  if(ret!=SQLITE_OK){    fprintf(stderr,"sqlite3_openfailed!:%s\n",
  • 2024-08-16.NET CORE在publish的时候去掉pdb
     默认设置下,publish出来的文件其实是包含很多的pdb文件,即使你过程当中选择的是“输出为单一文件”: 想要设置为publish的时候不输出,有三种方法(推荐第三种):1.直接改项目的配置文件的配置:2.直接改Web项目的publish的文件的配置:在最终的Startup的项目(比如是Web)的publish配
  • 2024-08-10dyMEAN数据集
    这条数据看起来是描述一个抗体-抗原复合物(来自PDB的6BKD结构)的详细信息,包括链的编号、序列、CDR区域等。以下是对每个字段的详细解释:总体结构pdb:"6bkd"PDBID,是一个四位字母代码,用于标识蛋白质数据库(PDB)中的一个特定的结构。这条数据描述的是PDBID为6bkd的结构。he
  • 2024-08-04SQLite库笔记:API函数编程
    本文主要介绍SQLite库的一些核心API函数,和实现数据库增删查改功能的C语言示例程序代码。目录1.API函数原型1.1sqlite3_open1.2sqlite3_close1.3sqlite3_free1.4sqlite3_errmsg1.5sqlite3_exec1.6sqlite3_get_table1.7sqlite3_free_table2.返回码定义3.示
  • 2024-07-28【C++软件调试技术】使用 Windbg 分析软件异常时的诸多细节与技巧总结
    目录1、dump文件1.1、dump文件的生成方式1.2、dump文件的大小2、pdb符号文件2.1、pdb文件的路径设置2.2、pdb文件的时间戳与名称问题2.3、如何确定要找哪些pdb文件?3、使用Windbg静态分析dump文件以及动态调试程序的一般步骤4、确定发生异常或崩溃的业务模块,到业务模块
  • 2024-07-26Oracle数据库状态信息自动化收集脚本
    #!/bin/bash#配置变量ORACLE_SID=CDBORACLE_HOME=/u01/app/oracle/product/19c/dbhome_1PATH=$ORACLE_HOME/bin:$PATHexportORACLE_SIDORACLE_HOMEPATH#数据库登录信息DB_USER=lcsdbDB_PASS=123456PDB_NAME=FS3_LCS#输出文件OUTPUT_DIR=/path/to/output/dire
  • 2024-07-24SPONGE常用教程:蛋白+配体模拟1
    软件支持SPONGE(SimulationPackagetOwardNextGEnerationmolecularmodelling)是由北京大学高毅勤课题组开发的分子动力学模拟程序。安装教程XPONGE使用python编写的分子动力学模拟前后处理工具。简易安装:pipinstallgit+https://gitee.com/gao_hyp_xyj_admin/xponge.gitDS
  • 2024-07-09K8s 驱逐场景以及规避方案
    Pod驱逐场景总结从一个SRE角度看,Pod驱逐分为两种情况:较安全驱逐&提高稳定性的良性驱逐API发起驱逐,典型案例:kubectldrainNodeNotReady时,ControllerManager发起的驱逐有风险的驱逐节点压力驱逐节点磁盘空间不足、内存不足或Pid不足,kubelet发起驱逐
  • 2024-07-05一个用来画拉氏图的简单Python脚本
    技术背景关于拉氏图的更多介绍,可以参考下这篇博客,这里简单引述一部分内容:Ramachandranplot(拉氏图)是由G.N.Ramachandran等人于1963年开发的,用来描述蛋白质结构中氨基酸残基二面角\(\psi\)和\(\phi\)是否在合理区域的一种可视化方法。同时也可以反映出该蛋白质的构象是否合理
  • 2024-06-20技术解读数据库如何实现“多租户”?
    本文分享自华为云社区《【GaussTech速递】技术解读之GaussDB多租技术》,作者:GaussDB数据库。数据库多租技术介绍随着云计算时代的到来,多租户的概念也逐渐广为人知。“多租户”使得租户之间可以共享物理资源,能够帮助用户节约硬件成本和运维成本,提高资源利用效率。同时,在实现的过程
  • 2024-06-02基于docker的oracle12.2.0.1部署及oracle使用与docker镜像容器制作迁移方法
    基于docker的oracle12.2.0.1部署及oracle使用与docker镜像容器制作迁移方法本文介绍了基于docker的oracle12.2.0.1部署,包含了oracle基本配置、监听器和实例启动方法、PDB和CDB操作方法、表空间建立和用户数据库建立、常见启动问题解决等,并介绍了镜像制作、镜像打包、镜像迁移
  • 2024-05-19ORA-01035
    TableofContents1.现象2.分析3.处理1.现象当用户登录时,提示如下信息:ERROR:ORA-01035:ORACLEonlyavailabletouserswithRESTRICTEDSESSIONprivilege此报错的意思是只有拥有登录restrict实现的权限的用户才可以执行登录操作。也就是说,登录的pdb
  • 2024-05-15Oracle数据库给某个PDB下面的用户设置密码永不过期
    切换到PDB:使用ALTERSESSIONSETCONTAINER语句切换到PDB,如下所示:ALTERSESSIONSETCONTAINER=PDB;确保密码策略允许永不过期:ALTERPROFILEDEFAULTLIMITPASSWORD_LIFE_TIMEUNLIMITED;这个命令会将默认配置修改为密码永不过期。然后,将用户的密码设为过期并立即修
  • 2024-04-17常见问题——VS调试出现:未加载mscorlib.pdb 的页面
    问题:VS在调试程序的时间,出现单独一个报错页面:未加载mscorlib.pdbmscorlib.pdb包含查找模块mscorlib.dll的源文件所需的调试信息解决方法:点击调试=>选项=>调试=>勾选:常规点击启用我的代码=》勾选:启用时若没有用户代码则发出警告(仅限托管)参考:https://www.cnblogs.com/Can-da
  • 2024-04-17Python-并行编程秘籍(五)
    Python并行编程秘籍(五)原文:zh.annas-archive.org/md5/e472b7edae31215ac8e4e5f1e5748012译者:飞龙协议:CCBY-NC-SA4.0第九章:调试阶段这最后一章将介绍两个重要的软件工程主题——调试和测试,这是软件开发过程中的重要步骤。本章的第一部分专注于代码调试。错误是程序中的错
  • 2024-03-25dotNet符号文件(pdb),符号包(snupkg)和SourceLink
    前言本文的主题是VisualStudio调试NuGet包,以及符号包的概念,如何去发布一个NuGet包,让我们的NuGet包支持SouceLink,这些都是我们开发中比较容易忽视的内容,但是熟悉了以后可以让我们在调试中得心应手,也是开源项目开发的基础篇。demo源代码在文末pdb符号文件程序数