NGS
  • 2023-12-05上下游分析
    上游分析这里说的上游分析,通常指的是NGS组学数据的标准化流程,比如WGS/WES的fastq—>bam—>vcfRNA-seq的fastq—>bam—>表达矩阵-差异基因ChIP-seq等的fastq—>bam—>peaks(bed)—>motif(特征)理论上完全练习实践掌握其中一个,是算作入门生信,可以通过自学获取另外一些
  • 2023-07-27NGS实验室质控-DNA污染控制方法篇(引用)
    NGS实验室质控-DNA污染控制方法篇 本篇主要和大家分享有关NGS检测体细胞突变时判断DNA污染的方法。  一、FDA产品-MSK-IMPACT的DNA污染控制方法 1)判断样本交叉污染(samplemix-up) 计算参考样本和待查样本间的“不一致比例”,即在参考样本中纯合基因
  • 2023-07-26敲低这个基因就可以开怀大吃了!诺奖技术助力编辑蛋白质组!NGS可使临床治疗受益!...
    1壹1吃货的春天?Science子刊:科学家找到一种胡吃海塞也能健康的方法载脂蛋白CIII(ApoCIII)水平升高与代谢性疾病有关。在喂食高脂肪食物的同时采用反义寡核苷酸降低ApoCIII基因的表达可保护代谢系统不发生紊乱;因食用高脂肪而发生代谢紊乱的小鼠使用反义寡核苷酸治疗后,其血糖代谢、