- 2023-10-27GBLUP-RR in BGLR
来自PaulinoPérez-Rodríguez和JoséCrossa两位GS领域大佬的报告。从GBLUP到RRBLUP,再到BRR理论使用经典数据集CIMMYTwheat599BGLR示例作者:生物信息与育种
- 2023-10-15深度学习模型在基因组选择中的预测能力(统计、总结)
Gianolaetal.[61]:应用:基因组选择。比较:多层感知器(MLP)与贝叶斯线性回归(BRR)。结果:在小麦数据集中,随着隐藏层神经元数量的增加,MLP的预测能力提高。MLP对BRR的性能提高了11.2%至18.6%。在Jersey数据集中,MLP也超越了BRR,特别是在脂肪产量、牛奶产量和蛋白产量上。Pérez-R
- 2023-10-15深度学习不如GBLUP的原因
深度学习,尤其是最近几年,被广泛宣传为可以处理复杂问题的强大工具。然而,我们必须理解,在某些特定的问题或数据集上,传统的方法有时可能更适合或更稳定。以下是一些可能解释为什么在考虑G×E交互效应时,深度学习没有表现得像GBLUP模型那么好的原因:数据量和复杂性:深度学习模型,特别是
- 2023-10-13GBLUP方法的缺点
GBLUP(GenomicBestLinearUnbiasedPrediction)是一种在基因组选择中广泛使用的方法,但它也有一些潜在的缺点和限制,包括:计算复杂性:GBLUP的计算复杂性相对较高,特别是在大规模基因组数据集上。需要处理大量的SNP标记数据,这可能需要大量的计算资源和时间。不考虑基因互作:GBLUP通常假
- 2023-10-13GBLUP最佳线性无偏预测
想象一下,你正在尝试预测一种植物的产量,你手头有这些植物的DNA信息(称为基因组数据或标记)以及它们的实际产量。你的目标是,当获得一个新的植物的DNA信息时,你想用它来预测这个植物的产量,即使你并不知道它的实际产量。GBLUP是帮助你完成这项任务的工具之一。线性预测:GBLUP的核心是