• 2024-08-08R语言读取和修改 fcs文件
    记住要从上往下一个一个包的安装,已经安装了的就不用安装,如果就是读取和修改fcs文件,只需要安装flowCore包就可以了。if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")##数据源:BiocManager::install("flowWorkspaceData")##数据
  • 2024-08-05R语言 安装 cytofWorkflow
    安装R语言中的cytofWorkflow包,主要可以通过CRAN(TheComprehensiveRArchiveNetwork)或Bioconductor等渠道进行。由于cytofWorkflow是专门用于处理和分析CyTOF(细胞时间飞行质谱)数据的包,它更可能存在于Bioconductor中,而不是CRAN。以下是安装cytofWorkflow包的一般步骤:一、安装Bioc
  • 2023-11-2511-在linux系统上安装R语言
      #我们在linux系统里面安装R,能够分析许多大数据。前提是安装好conda,可以看教程“https://blog.csdn.net/liangjinghui123/article/details/130318678?spm=1001.2014.3001.5501”#查看conda环境,可以看到现在是base基础环境condainfo--envs#创建名为R的环境,中间点
  • 2023-11-246-一文解决Windows系统上的R、Rtools、Rstudio的安装,镜像设置和BiocManager等R包的安装
     这个教程我做得非常好,不仅安装好了R,Rtools,Rstudio,还设置了镜像,示范安装R包,把许多散乱的教程都统一起来了,R语言初学者值得一看。前面的文章请看:TBtools进行序列提取;基因家族的鉴定blast和hmmer;基于Windows系统的iqtree系统进化树;关于Windows系统上的java安装R与Rstudio的安
  • 2023-07-15R语言中 topGO包的安装
     001、if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install("topGO",force=TRUE)library(topGO)  。
  • 2023-02-05ChIP-seq 分析:教程简介(1)
    简介本课程介绍Bioconductor中的ChIPseq分析。该课程由4个部分组成。这将引导您完成正常ChIPseq分析工作流程的每个步骤。它涵盖比对、QC、peakcalling、基因组
  • 2022-12-26ATAC-seq分析:教程简介(1)
    简介本课程介绍Bioconductor中的ATACseq分析。该课程由2个部分组成。这将引导您完成正常ATACseq分析工作流程的每个步骤。它涵盖比对、QC、peakcalling、基因组
  • 2022-10-31单细胞分析环境搭建(三)
    导读本文将介绍并实战搭建分析单细胞的环境。1.RR语言安装(Ubuntu)在命令行运行下面的命令,如果是root帐号,请去除sudo,其他系统参考>InstallR#updateindicessudo
  • 2022-10-1620221011-R和R包安装 Rnaseq
    quantificationsource("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("Rsubread")limmaedgeRlibrary("Rsubread")limmaedgeR失败condainstallbioconductor-edgercon