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编程问答
Augustus
2023-11-11
augustus 软件的安装
001、(base)[
[email protected]
]#condainstall-cbiocondaaugustus-y##直接使用conda安装;编译安装了一天,没想到conda一个命令安装。。。 002、调用测试(base)[
[email protected]
]#augustus--version##调用测试,目前没发现
2023-11-11
bam2wig.c:12:10: fatal error: bgzf.h: No such file or directory
001、make编译报错如下:bam2wig.c:12:10:fatalerror:bgzf.h:Nosuchfileordirectory 002、查找该文件(base)[
[email protected]
]#find/-name"bgzf.h"##查找该文件,系统中不存在该文件(base)[
[email protected]
]# 003、在高算平台
2023-11-11
/bin/ld: cannot find -lcolamd
001、make编译报错:/bin/ld:cannotfind-lcolamd 002、查找该文件(py38)[
[email protected]
]#find/-name"libcolamd.so"##系统上不存在该文件;那么解决的话就应该安装,但是安装什么呢? 003、在其他机器上查找该文件(base)[b20223040323
2023-11-11
alignment.cc:16:10: fatal error: lp_lib.h: No such file or directory
001、make编译报错:alignment.cc:16:10:fatalerror:lp_lib.h:Nosuchfileordirectory 002、在系统中查找该文件(base)[
[email protected]
]#find/-name"lp_lib.h"##系统中确实不存在这个文件(base)[
[email protected]
]# 003、
2023-11-11
parser/../../include/contTimeMC.hh:18:10: fatal error: gsl/gsl_matrix.h: No such file or directory
001、make编译遇到如下问题:parser/../../include/contTimeMC.hh:18:10:fatalerror:gsl/gsl_matrix.h:Nosuchfileordirectory 002、查找该文件(base)[
[email protected]
]#find/-name"gsl_matrix.h"##系统中确实不存在该文件(base)
2023-11-11
Augustus 软件的安装
001、官网:http://bioinf.uni-greifswald.de/augustus/downloads/github:https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus/releases/tag/v3.5.0 002、tar-xzvfAugustus-3.5.0.tar.gzcdAugustus-3.5.0/make 003、调用测试