• 2024-04-23《技术预测与技术规划》课程大纲
    【课程背景】技术型的企业通常都要面临长期的技术投入是否能变现、如何能变现的问题,企业的核心增长逻辑就是打造技术核心竞争力和让技术核心竞争力变现。但是技术核心竞争力的打造是一个长期的过程,必须有足够强的预见性。【课程收益】本课程主要解决四大核心问题:如何预测未来
  • 2023-12-25R语言布朗运动模拟股市、物种进化树状图、二项分布可视化
    全文链接:http://tecdat.cn/?p=32393原文出处:拓端数据部落公众号本文模拟了在连续和离散时间布朗演化一些简单的方法。布朗运动的数学模型(也称为随机游动)也可以用来描述许多现象以及微小颗粒的随机运动,如股市的波动和在化石中的物理特性的演变。布朗运动是随机模式,即改变了从一
  • 2023-11-244-基因家族的系统进化树-基于Windows系统上的iqtree
    今天来讲如何构建系统进化树,使用的软件是iqtree,这是一个基于最大似然法估算的建树软件,可以在Windows系统上运行。1,于此网址“http://www.iqtree.org/”自行下载,并解压。2,将已经鉴定好的自己的基因家族蛋白序列(fasta格式),先用MAFFT网站做多序列比对。我的蛋白序列文件命名是“Ptb
  • 2023-06-12从tassel到phylip-构建群体进化树
    1.用tassel将VCF文件转换为phylip格式run_pipeline.pl-Xmx10G-importGuessyour.vcf-ExportPlugin-saveAsyour.phy-formatPhylip_Inter#run_pipeline.pl是tassel里的一个程序#vcf文件应该只包含SNP信息,不能有indel信息,因为INDEL位点在转换为phy文件时,会变成-或者0,这
  • 2023-05-20R语言布朗运动模拟股市、物种进化树状图、二项分布可视化
    本文模拟了在连续和离散时间布朗演化一些简单的方法。布朗运动的数学模型(也称为随机游动)也可以用来描述许多现象以及微小颗粒的随机运动,如股市的波动和在化石中的物理特性的演变。布朗运动是随机模式,即改变了从一次到下一个是随机从正态分布绘制均值为0.0,方差为σ2×ΔT。换句话
  • 2023-05-15R语言布朗运动模拟股市、物种进化树状图、二项分布可视化
    全文链接:http://tecdat.cn/?p=32393原文出处:拓端数据部落公众号本文模拟了在连续和离散时间布朗演化一些简单的方法。布朗运动的数学模型(也称为随机游动)也可以用来描述许多现象以及微小颗粒的随机运动,如股市的波动和在化石中的物理特性的演变。布朗运动是随机模式,即改变了从一
  • 2023-05-10大语言模型进化树重磅发布,感慨技术方向选择的残酷,文末有彩蛋
    文/高扬 今天说点有深度的内容。五一假期,学习了一篇论文《HarnessingthePowerofLLMsinPractice:ASurveyonChatGPTandBeyond》。    这篇论文来自Amazon以及TexasA&MUniversity研究团队,他们通过追踪近年来语言模型的发展,构建了一个现代大语言模型
  • 2023-05-05这个热图上面的树是根据系统发育关系画的吗?
    今天培训群里有人问了这么一个问题:这个热图上面的树是根据系统发育关系画的吗?这个问题不只问过一次,类似的问题也有一些,拿到一个图不知道各部分是怎么来的。看到树就以为是进化树,看到点就是差异基因,看到颜色就是表达。遇到这种问题,原因一般有2点:主观原因:对图的含义不理解,对图怎么
  • 2023-04-24R语言生态学进化树推断物种分化历史:分类单元数与时间关系、支系图可视化|附代码数据
    全文链接:http://tecdat.cn/?p=31434最近我们被客户要求撰写关于生态学进化树的研究报告,包括一些图形和统计输出。我们围绕进化树技术进行一些咨询,分析生物类群在时间上的多样性是如何变化的我们将用到分类单元数-时间图(Lineages-through-timeplot),该图可以用来描述物种多样化
  • 2023-01-30R语言生态学:进化树推断物种分化历史:分类单元数与时间关系、支系图可视化
    全文链接:http://tecdat.cn/?p=31434原文出处:拓端数据部落公众号我们围绕进化树技术进行一些咨询,分析生物类群在时间上的多样性是如何变化的。我们将用到分类单元数-时间
  • 2022-12-31使用 phylip构建进化树
     001、测试数据转换为vcf格式[root@PC1test]#lstest.maptest.ped[root@PC1test]#plink--filetest--recodevcf-iid--outtest   002、将vcf转为p