• 2024-06-03易基因:RNA免疫共沉淀测序 (RIP-seq) 技术介绍
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。RIP-seq是将RNA免疫共沉淀(RNAImmunoprecipitation,RIP)与二代测序技术(NGS)相结合以研究细胞内RNA与蛋白互作的技术,RIP利用目标蛋白抗体把相应的RNA-蛋白复合物(RNABindingProtein,RBP)沉淀下来,然后经过富集和纯化就可以
  • 2024-05-29如何基于Perl实现批量蛋白名转换为基因名?以做后续GO与KEGG分析
    众所周知,在完成蛋白组学组间差异蛋白筛选后,往往要做GO与KEGG功能富集分析,这就需要我们首先将蛋白名转换为基因名,或者找出基因ID。将蛋白名转化为基因名可能涉及不同的转换工具或数据库,这里有几种常见的方法:①UniProt数据库:UniProt数据库提供了蛋白和其对应基因的关联信息。可
  • 2024-04-02预测蛋白是否为转录因子?
    1.TFpredictandSABINE:Sequence-BasedPredictionofStructuralandFunctionalCharacteristicsofTranscriptionFactors(TFpredict和SABINE:基于序列的转录因子结构和功能特征的预测)DOI:10.1371/journal.pone.0082238有一个疑问为啥不能找到在线预测的呀???2.DeepTFacto
  • 2024-03-15关于鸡蛋的10个真相
    每天吃一颗鸡蛋,有助于降低心血管疾病发病和死亡的风险。鸡蛋富含优质蛋白,氨基酸构成更好,容易被人体吸收利用。全蛋的蛋白质吸收利用率甚至比牛奶、肉类更高。鸡蛋中的卵磷脂、卵黄素等,对神经系统和身体发育有很大作用。如果想促进大脑发育、提升记忆力,与其花钱买保健品,不如早餐一
  • 2024-03-05R:基因的蛋白序列多行转单行
    从Phytozome上导出来的,这个用于后续的基因家族分析,通过此脚本将序列变为一行#清除所有变量rm(list=ls())#设置工作目录setwd("C:/Users/Administrator/Desktop")#定义读取和处理序列数据的函数process_sequences<-function(file_path){#读取文件内容lines
  • 2024-01-29易基因:ChIP-seq等揭示人畜共患寄生虫弓形虫的蛋白质乳酸化和代谢调控机制|项目文章
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。弓形虫(Toxoplasmagondii)是弓形虫病(toxoplasmosis)广泛传播的寄生虫病的病原体之一,但其生物学特性仍然知之甚少。乳酸(Lactate)作为葡萄糖代谢的产物,不仅在包括弓形虫在内的多种生物体中作为能量来源,还是一种参与基因激
  • 2024-01-12【卡梅德生物】哺乳动物细胞蛋白表达
        在当今生物技术的蓬勃发展中,哺乳动物细胞蛋白表达技术作为一项引人瞩目的前沿技术,正日益引起科研人员和生物制药行业的广泛关注。本文将深入剖析这一技术的现状,突出其独特优势以及当前所面临的挑战。在哺乳动物细胞蛋白表达领域,构建高效表达载体、选择合适的受体细胞和
  • 2023-11-243-基因家族的鉴定-基于Windows系统上的HMMER
    下面讲如何在windows系统上用HMMER做基因家族的鉴定:1,下载我们电脑首先要有个迅雷,然后复制这个链接,用迅雷打开(http://hmmer.janelia.org/static/binaries/hmmer3.0_windows.zip),下载到本地,解压。 2,案例分析HMMER是根据蛋白的结构域进行搜寻的,例如我们现在要找毛果杨的bZI