• 2024-10-11Boc-Val-Ala-PAB-PNP|CAS号:1884578-00-0多肽化合物
    Boc-Val-Ala-PAB-PNP是一种多肽化合物,其中包含了多个保护基团和特定的氨基酸序列。下面是对该化合物的详细解析:基本信息英文名:Boc-Val-Ala-PAB-PNPCAS号:1884578-00-0分子式:C27H34N4O9分子量:558.58结构式:分子结构1.**Boc**(叔丁氧羰基):  -这是一种常用的氨基酸N端
  • 2024-09-30残基和原子
    从您提供的aa_feature类的截图信息来看,以下是对aa_feature类中各个属性的整理:主要属性说明aa_embedding:residue_embedding:一个嵌入层,形状为(25,64),用于表示氨基酸残基的嵌入。res_pos_embedding:一个嵌入层,形状为(192,64),用于表示氨基酸残基的位置嵌入。atom_
  • 2024-08-18AlphaFold2:Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold(蛋白质结构预测)
    ICLR-15July2021MainMethod:MSA+EvoformerPytorchcode:https://github.com/lucidrains/alphafold2literatures:https://www.nature.com/articles/s41586-021-03819-2JohnJumper,RichardEvans,AlexanderPritzel,TimGreen,MichaelFigurnov,OlafRonneberger
  • 2024-08-10dyMEAN数据集
    这条数据看起来是描述一个抗体-抗原复合物(来自PDB的6BKD结构)的详细信息,包括链的编号、序列、CDR区域等。以下是对每个字段的详细解释:总体结构pdb:"6bkd"PDBID,是一个四位字母代码,用于标识蛋白质数据库(PDB)中的一个特定的结构。这条数据描述的是PDBID为6bkd的结构。he
  • 2024-03-13我与人工智能的一次问答
    Q1:为什么基因突变单点错译突变中的一种类型——GLY变为ALA这种,相对来说在病例中很少见?A2:基因突变导致氨基酸替换的频率以及对生物体影响的程度受到多种因素的影响。GLY(甘氨酸)变为ALA(丙氨酸)这种单点突变相对少见成为临床重要疾病的直接原因的原因可能包括以下几个方面:1.生物
  • 2023-12-10通过提示学习进行多级蛋白质结构预训练
    MULTI-LEVELPROTEINSTRUCTUREPRE-TRAININGWITHPROMPTLEARNING通过提示学习进行多级蛋白质结构预训练期刊:ICLR2023作者:浙江大学团队背景蛋白质可以关注不同的结构水平来实现其功能。蛋白质结构有四个不同的层次,第一级是由氨基酸组成的蛋白质序列,第二级是指局部折叠结构,第三季
  • 2023-11-07氨基酸周期表
  • 2023-06-10蛋白质是如何生成的
    蛋白质的生成过程称为蛋白质合成或蛋白质生物合成,它发生在细胞内的核糖体中。蛋白质合成包括两个主要的步骤:转录和翻译。转录(Transcription):转录是指将DNA中的基因信息转录成RNA的过程。在细胞核中,DNA的两条链解开,其中一条链作为模板,由RNA聚合酶酶依据碱基配对原则合成与DNA模
  • 2023-05-31蛋白质测序学习
    蛋白质有四级结构,基本单位是氨基酸。氨基酸的分子结构通式为一个氨基-NH2、一个羧基-COOH、一个氢原子-H、一个侧链R基团连接在同一个碳原子上。根据R基团的不同,氨基酸分为20种。氨基酸之间羧基和氨基通过脱水缩合形成肽键-CO-NH-连接在一起,多个氨基酸最终形成一条肽链,肽链上氨
  • 2023-05-10蛋白质深度学习
    本文主要面向两类目标读者:一类是想使用机器学习的生物学家,一类是想进入生物学领域的机器学习研究者。如果你不熟悉生物学或机器学习,仍然欢迎你阅读本文,但有时你可能会觉得有点读不太懂!如果你已经熟悉这两者,那么你可能根本不需要本文——你可以直接跳到我们的示例notebook以
  • 2023-04-1920种氨基酸及其缩写
    中文英文三字母缩写单字母缩写甘氨酸GlycineGlyG丙氨酸AlanineAlaA缬氨酸ValineValV亮氨酸LeucineLeuL异亮氨酸IsoleucineIleI脯氨酸ProlineProP苯丙氨酸PhenylalaninePheF酪氨酸TryrosineTyrY色氨酸TryptphanTrpW
  • 2023-03-28SARS-CoV-2、SARS-CoV (2003)及RaTG13病毒株的S(Spike)蛋白氨基酸序列差异
    在NCBI网站上得到SARS-CoV(2003)、SARS-CoV-2及RaTG13的S蛋白氨基酸序列在clustalOmega进行比对,下面是结果