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为什么 xgboost.QuantileDMatrix 使用自定义数据迭代器对数据进行四次传递?

时间:2024-08-06 03:35:08浏览次数:9  
标签:python machine-learning parallel-processing xgboost quantile

我正在尝试使用自定义数据迭代器,如下所示 此处 ,因为我的数据集太大。只是为了测试它是如何工作的,我正在使用示例的子集并运行以下代码。 X 是我的数据的 numpy 数组。

我的迭代器如下所示

class IterForQDMatrix(xgb.core.DataIter):
    def __init__(self, df, batch_size):
        self.df = df
        self.batch_size = batch_size
        self.batches = np.ceil(len(df) // self.batch_size)
        self.it = 0
        super().__init__()
        
    def reset(self):
        self.it = 0
        
    def next(self, input_data):
        if self.it == self.batches:
            print("done")
            return 0
        a = self.it * self.batch_size
        b = min((self.it + 1) * self.batch_size, len(self.df))
        input_data(data=self.df[a:b, : -1], label=self.df[a:b, -1])
        self.it += 1
        return 1

iterator = IterForQDMatrix(X, 30)
xgb_data = xgb.QuantileDMatrix(iterator)

当我运行上面的代码时我注意到 "done" 被打印了四次,这意味着当我将迭代器传递给 xgb.QuantileDMatrix 时,它会遍历整个数据集四次。我试图理解为什么它要传递数据四次。有没有一种方法可以通过一次数据传递来实现它正在做的事情?


xgboost.QuantileDMatrix 对的数据进行四次传递来计算分位数草图,这些草图是有效训练树状模型所必需的。以下是原因:

  1. 初始化: 第一次传递用于收集有关数据集的基本统计信息,例如数据点的数量。此信息用于初始化分位数草图数据结构。
  2. 草图: 第二次和第三次传递用于构建分位数草图。这些草图是数据的汇总表示,允许 XGBoost 近似每个节点处特征值的分位数,而无需将所有数据存储在内存中。这对于大型数据集至关重要,因为它们无法完全加载到内存中。XGBoost 使用一种称为 GK-sketch 的方法来构建这些草图,该方法需要两次传递数据以有效地估计分位数。
  3. 最终确定: 第四次传递用于计算基于在草图构建阶段收集的信息的精确分位数。然后使用这些分位数来确定训练期间的拆分点。

可以只使用一次传递吗?

不,不能只使用一次传递来实现 xgboost.QuantileDMatrix 的功能,同时保持其效率。分位数草图的设计是为了在准确性和效率之间提供一个良好的平衡。它们允许 XGBoost 近似分位数,而无需多次遍历所有数据或将所有数据存储在内存中。

可以使用更少的传递吗?

从技术上讲,可以修改 XGBoost 的实现以在内部存储草图并重复使用它们。这将消除重复传递的需要。但是,此功能当前不可用。

替代方案

如果数据传递的数量成为一个主要问题,可以考虑以下替代方案:

  • 对数据进行预处理以减少其大小: 这可以通过降维技术或特征选择来完成。
  • 使用不同的 XGBoost 构造函数: xgb.DMatrix 构造函数不需要计算分位数草图,并且可以在数据已经存储在内存中的情况下使用。但是,对于大型数据集,此方法可能不可行。
  • 使用不同的梯度提升库: 一些梯度提升库,例如 LightGBM,使用不同的技术来处理大型数据集,并且可能需要更少的数据传递。

最终,选择最佳方法取决于的特定数据集和用例。

标签:python,machine-learning,parallel-processing,xgboost,quantile
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