python - 构建奇点容器时在 pyproject.toml 中找不到 [tool.poetry] 部分

我正在尝试构建一个在 HPC 环境上运行的奇点容器。我正在使用 poetry 来管理python包。

我的 pyproject.toml 文件的内容如下：

[tool.poetry]
name = "haqc"
version = "0.1.0"
description = ""
authors = ["Vivek Katial <[email protected]>"]

[tool.poetry.dependencies]
python = "^3.8"
...
haqc = {path = ".", develop = true}

[tool.poetry.dev-dependencies]

[build-system]
requires = ["poetry-core>=1.0.0"]
build-backend = "poetry.core.masonry.api"

然后在我的 Singularity 定义文件中，我有以下内容可以使用 poetry 进行设置：| ||每次我尝试构建容器时，我都会收到以下错误，尽管

%post
  pip install --upgrade pip
  git clone https://<REPO>.git
  cd HAQC
  pip install "poetry==$POETRY_VERSION"
  poetry config virtualenvs.create false \
  && poetry install --no-interaction --no-ansi

文件存在于构建时的目录中（我 pyproject.toml 需要检查）： echo 'd an ls -lhar to check):

  PyProjectException

  [tool.poetry] section not found in /HAQC/pyproject.toml

  at /usr/local/lib/python3.9/site-packages/poetry/core/pyproject/toml.py:56 in poetry_config
      52│     def poetry_config(self):  # type: () -> Optional[TOMLDocument]
      53│         if self._poetry_config is None:
      54│             self._poetry_config = self.data.get("tool", {}).get("poetry")
      55│             if self._poetry_config is None:
    → 56│                 raise PyProjectException(
      57│                     "[tool.poetry] section not found in {}".format(self._file)
      58│                 )
      59│         return self._poetry_config
      60│

该错误信息表明 Poetry 无法在 pyproject.toml 文件中找到 [tool.poetry] 部分。虽然你说该文件存在，但仍有一些可能的原因导致这个问题：

1. 文件路径错误：

• Poetry 在运行时可能没有读取正确的 pyproject.toml 文件路径。确保 cd HAQC 命令确实切换到了包含 pyproject.toml 文件的目录。
• 你可以在 %post 部分添加 pwd 命令查看当前工作目录是否正确:

%post
  ...
  pwd 
  pip install "poetry==$POETRY_VERSION"
  ...

2. 文件编码问题：

• 确保 pyproject.toml 文件使用 UTF-8 编码保存。其他编码格式可能会导致解析错误。

3. 文件权限问题：

• 确保 Poetry 对 pyproject.toml 文件具有读取权限。你可以尝试在 %post 部分添加 chmod +r pyproject.toml 命令来更改文件权限。

4. Poetry 版本问题：

• 尝试使用最新版本的 Poetry，旧版本可能存在 bug。你可以尝试在 %post 部分使用 pip install --upgrade poetry 更新 Poetry。

5. 文件内容被修改：

• 确保在执行 git clone 和 poetry install 命令之间，没有任何其他命令修改了 pyproject.toml 文件内容。

调试建议：

• 在 poetry config virtualenvs.create false 命令前后添加 echo "----- Before poetry config -----" 和 echo "----- After poetry config -----" ，以便查看该命令是否成功执行。
• 尝试在本地环境中使用相同的 Singularity 定义文件和 pyproject.toml 文件构建容器，看是否能够复现该问题。

如果以上方法都无法解决问题，请提供以下信息以便进一步分析：

• 完整的 Singularity 定义文件内容。
• %post 部分的完整日志输出。
• 你使用的 Poetry 版本。

希望以上信息能帮助你解决问题。