BIG-SCAPE提取gbk文件时出错

我在运行 BiG-SCAPE 时遇到以下错误。请帮忙。

导入 GenBank 文件 警告：未知产品“氰化氢” 警告：未知产品“NRP-金属基团” 警告：未知产品“类似膦酸盐”

以 314 个文件开头 提取序列的文件：0

似乎我在从 gbk 文件中提取数据时遇到问题

当 BIG-SCAPE 无法识别 GenBank (.gbk) 文件中列出的某些产品名称时，就会出现遇到的错误。更具体地说，它不熟悉术语“氰化物”、“NRP-金属基团”和“类似磷酸盐”。

这并不一定意味着存在错误。BIG-SCAPE 基于已知基因簇和产物的数据库运行。当它遇到不熟悉的术语或新术语时，它会将其标记为警告。

可以采取以下措施来解决此问题：

1. 检查警告： 虽然警告本身并不妨碍提取过程，但最好仔细检查它们。确保这些“未知产品”不是由于 .gbk 文件中的拼写错误或格式错误造成的。
2. 更新 BIG-SCAPE 数据库： BIG-SCAPE 的开发者定期发布更新，其中可能包含对其数据库的添加内容。考虑使用最新版本以查看它是否可以识别这些产品。
3. 手动注释（如果有必要）： 如果这些产品对的分析至关重要并且在更新后仍然无法识别，则可能需要手动注释这些基因簇。这将涉及查阅文献并参考其他数据库。
4. 寻求帮助： 如果仍然遇到问题，请考虑联系 BIG-SCAPE 开发人员或在生物信息学论坛上寻求帮助。提供有关的 .gbk 文件、BIG-SCAPE 版本和遇到的确切错误消息的详细信息。

请记住，.gbk 文件中警告的存在并不一定会使的分析失效。但是，仔细检查它们并确保它们不会影响的研究结果非常重要。