首页 > 其他分享 >matlab工具包EEGLAB中功能连接FCLAB的使用(一)

matlab工具包EEGLAB中功能连接FCLAB的使用(一)

时间:2024-11-29 12:04:44浏览次数:12  
标签:MST 指标 BCT 文件夹 matlab FCLAB EEGLAB Tools

准备阶段:
FCLAB:https://github.com/ramsys28/FCLAB在这里插入图片描述
或者:eeglab中:File -> Manage EEGLAB extensions,这里面下载:
在这里插入图片描述
BCT:https://github.com/brainlife/BCT

将下载好的,BCT文件夹放进eeglab工具包中plugins -> FCLAB 中;这里BCT文件夹是最里面的文件夹,打开后是相关的函数,不可打开后还是BCT文件夹
在这里插入图片描述
在matlab中,主页 -> 设置路径 -> 添加并包含子文件夹,选择eeglab添加一下;
在这里插入图片描述

调用: Tools -> FCLAB -> Compute Functional Connectivity -> iCOH:
在这里插入图片描述
先选择iCOH,勾选Auto Compete运行一下:
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

注意:
1.到这里有时会报错,稍微注意一下是否文件没添加好,建议都使用gitHub上下载的,不知道是否因为版本不匹配,会报各种错;
2.在最后一步,选择指标时,第一次使用FCLAB的时,要选择iCOH运行一下,然后,需要PLI或者其他指标运行时就不会报错了;
3.关于FCLAB参数的具体介绍,有一篇文章,可以查阅一下:https://ieeexplore.ieee.org/document/8333378
4. 在选定指标,设置好频率后,后面所有的计算都是基于当前的选择;

比如,接下来使用PLI进行计算:在这里插入图片描述
点击ok,运行结束后,默认就可以,选择ok;
可视化:Tools -> FCLAB -> Visualize Functional Connectivity:有三种不同的可视化图形
在这里插入图片描述
图论分析:Tools -> FCLAB -> Grap/MST analysis:
界面中阈值的选择,可根据相关研究文献中介绍进行选择;在这里插入图片描述
勾选与否MST,都可进行此可视化:Tools -> FCLAB ->Visualize Grap/MST parameters
在这里插入图片描述
不勾选,不可进行此可视化:Tools -> FCLAB -> Visualize MST
在这里插入图片描述
对于上述计算的结果,都会保存在EEG结构体中,

在这里插入图片描述
红字1:是第一个选择PLI计算出来的邻接矩阵;
红字2:是计算出来的一些指标,图中展示的那样,有局部的一些指标(如度,局部效率等),也有全局的一些指标(如节点数、全局效率、特征路径长度、直径等);
红字3:是最后计算的最小生成树的相关指标;

如果,需要其中的哪些数据,可以保存下数据,存为.mat格式,就可以正常加载,然后取相应的指标用于统计分析等;

比如:在运行结束后,命令行窗口输入save(‘EEG1125’,‘EEG’);,然后EEG结果就保存成EEG1125.mat了;
然后在代码中,调用就可以了:
在这里插入图片描述

标签:MST,指标,BCT,文件夹,matlab,FCLAB,EEGLAB,Tools
From: https://blog.csdn.net/weixin_43604817/article/details/144020902

相关文章