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生信phageannotator安装

时间:2024-09-02 13:56:37浏览次数:11  
标签:core nf conda pip 安装 phageannotator 生信

  1. 创建 Conda 环境

    conda create -n phageannotator_env python=3.8
    conda activate phageannotator_env
    
  2. 安装 Nextflow

    • 通过 Conda 安装 Nextflow:
      conda install -c bioconda nextflow
      
  3. 安装 nf-core

    • 通过 pip 安装 nf-core 工具:
      pip install nf-core
      
  4. 下载和安装 nf-core/phageannotator

    • 使用 nf-core 工具下载 phageannotator 工作流:
      nf-core download phageannotator
      
  5. 运行 nf-core/phageannotator

问题:

下载失败可以执行pip install --upgrade nf-core更新再执行第三步

标签:core,nf,conda,pip,安装,phageannotator,生信
From: https://www.cnblogs.com/rainsc/p/18390850

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