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速度是conda的10倍以上,mamba的4倍,Pixi是何方神圣呢?真有这么快吗?

时间:2024-07-04 16:56:36浏览次数:23  
标签:分析 10 教程 pixi 代码 Pixi conda

原文链接:速度是conda的10倍以上,mamba的4倍,Pixi是何方神圣呢?真有这么快吗?

本期教程

写在前面

今天中午看到通哥分享的教程,conda转圈圈,为何不试试pixi,Pixi是第一次了解。但是,通过他们的介绍,确实牛X,速度是conda的10倍以上,mamba的4倍。对于自己而言,自从使用了mamba以后,基本不会在使用conda安装软件。conda很多时候,速度让我劝退了。

Pixi确实有这么牛X?

那么就实际操作一下吧。

Pixi官方网址

https://prefix.dev

安装

对于Pixi的安装,大家可以更具官网的操作进行,也可以使用通哥的教程,conda转圈圈,为何不试试pixi

大家可以自行查看通哥的教程即可,总结的两种方法,一种是直接从官网中下载,一种是在github中下载。我这里直接从官方下载,可以成功下载,若是你未能成功,直接从github中下载。

# 官方安装
curl -fsSL https://pixi.sh/install.sh | bash
# 加入自动补齐
echo 'eval "$(pixi completion --shell bash)"' >> ~/.bashrc

###

# 下载安装脚本
git clone https://github.com/prefix-dev/pixi.git
# 运行脚本
cd pixi/install/
bash install.sh
#加入自动补齐
echo 'eval "$(pixi completion --shell bash)"' >> ~/.bashrc
# 刷新设置
source ~/.bash_profile
source ~/.bashrc

关于Pixi详细的说明,可以到官网进行了解。
https://prefix.dev/blog/pixi_a_fast_conda_alternative

与conda、mamba比较

Pixi搜索时间

mamba搜索,不知道今天为什么这么慢?

conda搜索


在添加镜像时,我们可以选择性添加。

我这里只添加了bioconda

pixi config append default-channels bioconda

若我们的教程对你有所帮助,请点赞+收藏+转发,这是对我们最大的支持。

往期部分文章

1. 最全WGCNA教程(替换数据即可出全部结果与图形)


2. 精美图形绘制教程

3. 转录组分析教程

4. 转录组下游分析

小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学教程,以及基于R分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!

标签:分析,10,教程,pixi,代码,Pixi,conda
From: https://blog.csdn.net/kanghua_du/article/details/140183825

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