参考:
https://310.ai/copilot
可以通过自然语言对话形式实现小分子、蛋白质的相关处理:生成序列、折叠等
应该是agent技术调用不同工具实现
- 从UniProt数据库中搜索和加载蛋白质。
- 使用ESM Fold方法折叠蛋白质。
- 使用310.ai基础模型设计新蛋白质。
- 使用TM-Align方法比较蛋白质。
- 利用ProteinMPNN模型进行蛋白质逆折叠。
- 聚焦并可视化蛋白质结构的特定部分。
- 生成报告并导出结果。 例如: - 查找结合锌且序列长度小于300的蛋白质。 - 折叠序列"DIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQ"。 - 设计包含特定功能的新蛋白质。 - 比较两个或多个蛋白质。 - 使用ProteinMPNN重新设计蛋白质。 - 高亮显示特定残基范围。 - 导出结果报告。
在线体验:
https://310.ai/copilot
小分子查找
蛋白质PDB查找
ProteinMPNN生成蛋白质序列
ESMFold进行蛋白序列的折叠<