我这边引起Command PhaseScriptExecution failed with a nonzero exit code的原因是我刚更换了推送证书，于是我打开 钥匙串访问 发现推送证书处于不受信任状态，于是把证书状态设置为信任状态并删除了旧的推送证书，设置完成后再去运行，就可以成功运行了。
这是我这边的单一情况，我在网上搜索的时候发现其他人有各自的问题，所以如果出现问题，可以先查看错误提示的具体信息，或者检查一下自己最近做的有可能引起问题的操作，我这边没法看到具体错误提示信息，所以只能采取排除的方法，最后发现是推送证书不受信任的原因引起的。