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R实战—相关矩阵可视化

时间:2022-10-14 15:05:03浏览次数:43  
标签:实战 相关系数 可视化 corr hc 相关矩阵 white ggcorrplot TRUE


R实战—相关矩阵可视化_相关分析

近几天毕业生相继离校了

你们走了,我好继承华水的食堂

R实战—相关矩阵可视化_取值范围_02

在这里,祝毕业生一路顺风

R实战—相关矩阵可视化_相关分析_03

愿此去前程似锦

再相逢依旧如故

今天讲相关分析,并将得出的相关矩阵可视化。

R实战—相关矩阵可视化_相关分析_04

dvdf

相关关系是一种非确定性的关系,相关系数是研究变量之间线性相关程度的量。

相关系数的求解公式如图所示:

R实战—相关矩阵可视化_取值范围_05

如果有两个变量:X、Y,最终计算出的相关系数的含义可以有如下理解:

(1)当相关系数为0时,X和Y两变量无关系。

(2)当X的值增大(减小),Y值增大(减小),两个变量为正相关,相关系数在0.00与1.00之间。

(3)当X的值增大(减小),Y值减小(增大),两个变量为负相关,相关系数在-1.00与0.00之间。

相关系数的绝对值越大,相关性越强,相关系数越接近于1或-1,相关度越强,相关系数越接近于0,相关度越弱。

通常情况下通过以下取值范围判断变量的相关强度:

0.8-1.0极强相关

0.6-0.8强相关

0.4-0.6中等程度相关

0.2-0.4弱相关

0.0-0.2极弱相关或无相关

R实战—相关矩阵可视化_相关分析_04

dvdf

我们选取的变量如下图所示:

R实战—相关矩阵可视化_取值范围_07

利用R软件做相关矩阵的可视化

R实战—相关矩阵可视化_desktop_08

其颜色越深,表明相关程度越大,相关性越强,以x1、x4为例,给出其相关系数为0.99,相关关系极强。

R实战—相关矩阵可视化_相关分析_04

dvdf

#R程序

install.packages("ggcorrplot")

library(ggcorrplot)

#计算相关矩阵(cor()计算结果不提供p-value)

data<-read.csv("C:/Users/27342/Desktop/a.csv")

corr <-round(cor(data), 3)

head(corr[, 1:13])

#用ggcorrplot包提供的函数cor_pmat()

p.mat <-cor_pmat(data)

head(p.mat[, 1:13])

ggcorrplot(corr)#method默认为square

ggcorrplot(corr, method = "circle")#方法为circle

ggcorrplot(corr, hc.order = TRUE, outline.color = "white")#重排矩阵,使用分等级聚类

ggcorrplot(corr, hc.order = TRUE, type = "lower", outline.color = "white")#下三角形

ggcorrplot(corr, hc.order = TRUE, type = "upper", outline.color = "white")#上三角形

#更改颜色以及主题

ggcorrplot(corr, hc.order = TRUE, type = "lower", outline.color = "white",

ggtheme = ggplot2::theme_gray, colors = c("#6D9EC1", "white", "#E46726"))

#添加相关系数

ggcorrplot(corr, hc.order = TRUE, type = "lower", lab = TRUE)

R实战—相关矩阵可视化_相关分析_10

标签:实战,相关系数,可视化,corr,hc,相关矩阵,white,ggcorrplot,TRUE
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