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在比对操作中,要找出第二代短读段与第三代长读段之间的高准确度比对结果

时间:2023-12-26 10:23:01浏览次数:41  
标签:长读 第三代 准确度 第二代 纠错 短读

在比对操作中,要找出第二代短读段与第三代长读段之间的高准确度比对结果,可以采用以下方法:

1. 使用第二代测序数据对第三代长读段进行纠错。例如,Lo RDEC算法通过构建简洁de Bruijn图来寻找纠错序列,从而实现纠正第三代长读段数据中的错误区域[16]。

2. 基于比对的方法。例如,LSC算法在比对之前对第二代短读段和第三代长读段进行压缩处理,将相邻碱基压缩成一个,从而提高比对效率。然后,利用比对结果中高准确度的第二代短读段对第三代长读段进行纠错[16]。

这些方法都是通过利用第二代测序数据在比对过程中找到与第三代长读段高度匹配的短读段,从而获得高准确度的比对结果。这些方法在实际应用中已经取得了一定的成果。

标签:长读,第三代,准确度,第二代,纠错,短读
From: https://www.cnblogs.com/wangprince2017/p/17927555.html

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