代谢组学（Metabolomics）是在20世纪90年代末兴起的新兴学科，它是在基因组学和蛋白质组学之后发展起来的一项新的组学技术，同时也是系统生物学的重要组成领域。
代谢组学探讨了在生物体受到干扰后（如基因改变或环境变化）其内源性代谢物种类、数量和变化规律。它着眼于研究生物整体、器官或组织中代谢途径及其受到内在或外在因素的影响，以及随时间变化的规律。通过揭示这些因素对代谢整体的影响，代谢组学反映了某种病理生理过程中发生的一系列生物事件。广义上代谢组学主要分为非靶向和靶向代谢组学，也有一些技术介于靶向和非靶向之间，如广靶、类靶、拟靶等。
一般代谢组学关注的对象是分子量在1000（或说1500）以下的小分子化合物。目前，技术水平在鉴定和定量方面还停留在早期阶段。在鉴定方面，能够确认和注释的物质仅占检测到的物质总数的不到20%。而在定量方面，获得的结果通常是静态和综合的，然而，代谢是一个动态的过程，有多个途径参与其中。因此，代谢组学的发展还有很长的路要走。
代谢物同蛋白质组一样，也是通过质谱仪和搜库来鉴定和定量。通常有气相质谱GC-MS、液相质谱LC-MS和核磁共振三种平台。
几年前小编从事过一小段时间的代谢组学研究，零星做过一些笔记，因此将数据分析的部分内容迁移到公众号上。但是技术的发展日新月异，不保证笔记的适用性和质量，仅供参考。
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