安装R包相关的一些scripts – 备份

1.

options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor") 
BiocManager::install("DESeq2", ask = F,update = F)

该设置方式中镜像的作用域似乎只在当前session

# 解决依赖
install.packages(c("curl", "openssl"), ask = F, update = F)

install.packages("openssl", ask = F, update = F)

2.

虽然 install.packages()并不支持版本的选择，但是如果你知道R包的源文件的位置：
https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive或者其他镜像，则可以直接通过 source 的方式安装

packageurl = 'https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_3.3.5.tar.gz'
install.packages(packageurl, repos = NULL, type = 'source')

3.

options("repos"=c(CRAN = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 

4.

.packages(all.available=T)  # 在console显示已安装包的名字

(.packages())  # 显示 已加载包