20230221:purr包 GSEA pandas
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purr的map_*函数的使用
DF = List1 %>% names %>% map_dfr(function(x){ #把List1转化成DataFrame的格式, map_dfr是把结果都按行合并起来. return (data.frame(x , List1[[x]]$'all')) })
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- clusterProfile::GSEA调用的是DOSE::GSEA_internal
- DOSE::GSEA_internal 调用的是fgea包或者自己写的GSEA_DOSE函数
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总是忘记pandas的操作命令,感觉还是R操作数据框要方便一些
data1.iloc[i,23] 第i行第23列数据 X1=train_data.iloc[:,:22] 取前23列数据 Y1=train_data.iloc[:,22] 取第23列数据
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