实战参考代码:代码
一、路径、参数配置(lung.conf)
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lidc_dicom_path: LIDC_IDRI数据集原始位置
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image_path,mask_path:保存处理后的含有结节的肺部图像和掩码图像路径
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clean_path_image,clean_path_mask:保存处理后的不含有结节的肺部图像和掩码图像路径
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meta_path:保存结节元数据路径
二、处理数据集(prepare_dataset.py)
主要记录遇上的问题。
问题一:
Could not establish path to dicom files. Have you specified the `path` option in the configuration file C:\Users\86152\pylidc.conf?
解决方法:在路径C:\Users\86152里找到pylidc.conf文件,使用记事本打开后添加LIDC_IDRI数据集原始位置 。
问题二:
解决方法:找到smoothing.py文件(点击链接自动跳转),看到第155行和第164行,改成下面图片的形式。
smoothing.py原文件:
更改后:
问题三:
解决方法:找到prepare_dataset.py文件(点击链接自动跳转),看到第152行和第153行,改成下面图片的形式。
prepare_dataset.py原文件:
更改后:
问题四:
代码运行完后发现处理结果并没有写入Meta文件夹里的meta_info.csv文件里,问题暂未解决。
参考:(41条消息) 【深度学习】肺结节分割项目实战一:处理数据集_肺部分割数据集_小河梦的博客-CSDN博客
标签:IDRI,路径,--,py,LIDC,path,结节 From: https://www.cnblogs.com/zc-030/p/17269550.html