以前一直没有条件,曾一度想自己买个显卡搞DL,但没有时间,也没有支持,最后就不了了之了。
无论是NGS的genetics,还是NGS的single-cell,DL都是大有可为的,最近出现的chatgpt更是确信了这一点。
未来Deep learning将会成为生信的标准工具,这是大势所趋,不可阻挡。
我目前在研究的MIRA就是使用了Autoencoder,这个已经在单细胞领域非常成熟了。【清一色NC灌水】
降噪 - Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder
空间 - Deciphering spatial domains from spatially resolved transcriptomics with an adaptive graph attention auto-encoder
Graph-based autoencoder integrates spatial transcriptomics with chromatin images and identifies joint biomarkers for Alzheimer’s disease
Fast and precise single-cell data analysis using a hierarchical autoencoder
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标签:autoencoder,Deep,cell,PyTorch,learning,using From: https://www.cnblogs.com/leezx/p/17087923.html