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bigwig文件转换为big文件

时间:2023-01-29 00:11:42浏览次数:91  
标签:0.0 文件 big bigWigToWig wig so.1 bigwig libssl

将bigwig转换为wig

 

conda install -c bioconda ucsc-bigwigtowig
bigWigToWig signal.bigWig signal.wig


bigWigToWig : Convert bigWig to wig. http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/bigWigToWig wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/bigWigToWig
chmod +x bigWigToWig
bigWigToWig ENCFF126HQH.bigWig ENCFF126HQH.wig

bigWigToWig: error while loading shared libraries: libssl.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory
原因:系统的libssl.so.1.0.0文件不能找到
解决问题:在系统中查找该文件,如有,建立连接 使得能够找到该库文件,如果没有下载
sudo ln /lib/x86_64-linux-gnu/libssl.so.1.0.0 /usr/lib/libssl.so.10

(base) []# locate libssl.so.1.0.0
/home/user01/anaconda3/lib/libssl.so.1.0.0

(base) []# cp /home/user01/anaconda3/lib/libssl.so.1.0.0 ./

# more ENCFF126HQH.wig
#bedGraph section chr1:0-911538
chr1    0    68294    0
chr1    68294    68509    1.07497
chr1    68509    87093    0
chr1    87093    87202    1.07497
chr1    87202    87308    0.80428
chr1    87308    88163    0
chr1    88163    88378    1.07497




使用 pyBigWig 模块查看 bigwig 文件中的内容
https://blog.csdn.net/weixin_43569478/article/details/111503530

标签:0.0,文件,big,bigWigToWig,wig,so.1,bigwig,libssl
From: https://www.cnblogs.com/emanlee/p/17071559.html

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