首页 > 其他分享 >seurat 单细胞数据分析中 DimPlot函数实现pca

seurat 单细胞数据分析中 DimPlot函数实现pca

时间:2022-08-27 16:55:41浏览次数:61  
标签:数据分析 seurat 函数 单细胞 pca DimPlot

 

前期处理参考:https://www.jianshu.com/p/fef17a1babc2

001、

dat <- pbmc[["pca"]]@cell.embeddings       ## 绘图数据
dat[1:3, 1:3]
plot(dat[,1], dat[,2])                     ## 绘图

 

 

 

标准结果:

 

标签:数据分析,seurat,函数,单细胞,pca,DimPlot
From: https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/16630897.html

相关文章

  • Seurat4.0单细胞数据分析 数据的归一化
     001、数据的归一化是在数据的标准化的基础上进行的,而且是按照行来进行的,即:(每一行的观测值-每一行的平均值)/每一行的标准差 验证: a、前期步骤参考:https://ww......
  • Financial - 情景分析中的“曲线-PCA”是怎么工作的?
    from天翼老师背景描述:假设某个曲线上有10个期限点(term),我们要会看过去100天的这条曲线的变化。 计算过程:1)这是第1天,与第0天之间,每个期限点的变化:△0f(t)=[f1(t1)......